朱由检继位之时，只有16岁，面对千疮百孔的大明，以及那位与他只差了100岁的九千九百岁魏忠贤，其做出了错误的政治判断。
由于魏忠贤性格残忍阴毒，执掌朝政后，排除异己，甚至假传圣旨，谋害皇嗣，将内操军增加至一万人，自己穿甲出入宫禁，权势滔天，见到魏忠贤如此作为，年轻的崇祯从心底是害怕的，他怕魏忠贤学曹吉祥，试图取而代之。
然而魏忠贤的确贪恋荣华，但并没有曹公公那样远大的报复，如果他想谋害崇祯，是一件非常容易的事，宫里大大小小的事皆被其掌控，神不知鬼不觉干掉崇祯并非什么难事，而以他的权势，别人没有真凭实据，谁又敢进行指责的？
崇祯安然无恙，说明魏忠贤不想威胁王权，在一定程度上，魏忠贤与崇祯之间是互相依存的，只是崇祯没有意识到这个问题。
为什么这么说？由于明朝制度，文官集团的力量比较强大，如果是朱元璋以及朱棣这样的帝王在位，是完全可以压制的，然而只要皇帝能力不足，就会出现文官集团压制皇帝的事情，很不幸，明朝朱棣以后的数代帝王能力完全不能与朱棣朱元璋相比，甚至天才的朱厚熜都不行。
于是皇帝需要分担压力，那么阉党诞生了，皇帝需要阉党来对抗文官集团，而阉党也需要皇帝当靠山，皇帝如果失去了权威，那么阉党肯定遭殃，比如明武宗朱厚照刚刚继位不久，吏部尚书焦芳等文官集团，就快开始胁迫朱厚照惩治八虎，虽然八虎咎由自取，但这种胁迫的形式说明文官集团并不把皇帝当回事。
这正如嘉靖帝朱厚熜继位，文官集团起初甚至不许让朱厚熜的亲生父亲进太庙，在名分上要以明孝宗为皇考，亲生父亲兴献王改称“皇叔考兴献大王”，祭祀之时对自己的亲生父母要自称“侄皇帝”，不但如此，文管集团宣布，反对者都是奸邪，当斩，这就是明朝著名的“大礼仪事件”，就算一个平常人，这都是极大的侮辱，何况皇帝。
文官集团把持朝政威胁到了皇权，皇帝就需要反击，其中的一项手段就是扶持阉党，在天启年间，阉党最具影响力的就是魏忠贤，只有他能对抗东林党，崇祯杀了魏忠贤，在一定程度上等于对自己权力的削弱。
其实魏忠贤是要杀的，只是崇祯选择的时间不对，当时大明已经摇摇欲坠了，需要的是内部的稳定，而魏忠贤的死恰恰打破了文官集团与阉党的平衡，失去压制的东林党人，站在了地主阶级的一方，对下层人民影响十分巨大，甚至连赈灾的钱粮都敢于拦阻，魏忠贤那么权势滔天，他都没不敢做，而且阉党对于下层民众的影响其实并不是很深。
总之，崇祯因为判断上的失误，杀了该杀却不能杀的魏忠贤，大明出现权利失衡，以他自己的能力又无法驾驭群臣，致使大明无力应付内忧外患的局面，想必后来对于诛杀魏忠贤，崇祯一定是后悔的。
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