北京
1月7日消息，近期，我们对话分子之心创始人许锦波，探讨蛋白质结构预测的议题以及生物经济的未来变革。他指出，只有真实地了解产业，才能够更好地驱动技术的发展。而他们的远景是，希望能打造出中国生物经济时代的基础设施。
许锦波将生命体比作城市，DNA好比城市的设计蓝图，而蛋白质是城市建设的基础材料、城市运行的基本单位，“蛋白质可以是支撑高楼大厦结构的木材钢筋、传递信息的光纤电缆，也可以是美化环境的草木植被……”以此说明，蛋白质的功能和作用，取决于它的折叠结构。所以，如果能够看清、测清蛋白质的三维结构，就如同拿到了破解生命奥秘的“密码本”，这对于推动整个人类科学的发展都有重大意义，也是许锦波从2001年起就投身的研究。
在2016年的全球蛋白质结构预测比赛（CASP）中，他的RaptorX-Contact方法，一举把预测分从此前徘徊多年的30分左右，拔高到了60分，证明AI可以大幅提升蛋白质结构预测精度。
而从业至今，许锦波的遗憾在于“没有更早地去了解产业需求” 。“只有真实地了解产业，才能够更好地驱动技术的发展，否则就有些闭门造车。”
例如，在药物研发领域，如果能够设计出新颖的蛋白药物，如蛋白疫苗、抗体药等等，将会有更大的概率解决当前人类遇见的许多疑难杂症；在食品领域，如果能够开发出更多优质安全的替代蛋白食品，就可以丰富人类的营养来源、缓解食品短缺问题；材料领域，可以通过优化蛋白质，开发出易降解且能循环使用的环保生物材料，促进社会可持续发展等。
带着这样的愿景，2021年底许锦波回国，并于次年创办了公司分子之心（MoleculeMind）。关于起名，许锦波先确定了英文“MoleculeMind”——Molecule意味着公司主要是研究分子，Mind释义为心智，故而“MoleculeMind”的中文名定为分子之心。
“我们在做的事情是交叉学科里比较大的项目，既需要从‘0到1’研究和解决科学问题，也需要将技术落地于产业实践，更需要高效的团队配合。我们很多解决方案都是既需要懂计算、懂AI，也需要懂生物背景。”分子之心团队成员涉及的领域，包括生物、AI、药物和临床等等。据介绍，团队里80%是研发人员，核心研发团队里九成以上是博士。
据了解，2021年，分子之心推出了自主研发的全球首个功能完整的AI蛋白优化与设计平台MoleculeOS。在2023世界人工智能大会上，分子之心又推出了全球首个集成序列、结构、功能和进化的产业级AI蛋白质生成大模型——NewOrigin（中文名：达尔文），这也是面向生物经济时代的基础设施级底层大模型。
“技术层面，希望AI蛋白质设计真的能做到‘按需设计’。近期的目标是，AI设计出的几十个分子里，能有1-2个达标的。长期目标是，AI每一个设计出来的分子，都能符合定制化要求。产业化方面，希望通过AI蛋白质技术，设计出真正、实用、有用的产品。”而对于“有用”的解读，许锦波解释得十分简单、明了：“对现阶段行业、产业发展有所改善，就是有用。”
而最终，他希望，“我们能打造出中国生物经济时代的基础设施。” （易智）
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