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新使生物翻译组学Ribo-seq:超高分辨率 & 低起始量核糖体印迹测序

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前言PREFACE

新使生物自2023年9月推出国内首款超高分辨率专业翻译组QEZ-seq®建库试剂盒以来,收到了大量国内外科研学者的好评及建议,我们在此详细介绍我们的产品及特点

01

技术背景

全新的翻译组建库技术QEZ-seq®源自美国Cornell大学,由美国EzraBio Inc. 和中国新使生物科技有限公司合作开发转化


图1. 新使生物翻译组试剂盒

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2

技术原理

Ribo-seq通过捕获核糖体保护的mRNA片段进行文库构建,获取翻译事件的足迹信息,对翻译过程进行研究


图2. 翻译组文库原理

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3

技术优势


图3. 技术对比

1、适用于多物种样本

新使生物QEZ-seq® 1.0试剂盒配有专门针对哺乳动物、植物和真菌的裂解液,无需进行复杂的样品处理,让每个研究者都能快速上手

2、无需使用专业设备

不再依赖蔗糖梯度制备仪,超速离心机和核糖体分选仪,让无经验的研究者也能快速进行样本处理

(传统的Ribo-seq样品处理步骤复杂,需要有经验的实验室及专业的设备支撑)

3、超快速文库构建

只需2小时即可完成cDNA文库构建,至最终产物回收最快只需4-6小时即可完成

(传统的Ribo-seq建库周期需要5-7天时间,步骤繁冗复杂)

4、全程单管反应

文库构建全程在单个试管内进行,直接添加,简单易上手,减少被污染的风险

(传统的Ribo-seq需要不断切胶回收并更换反应管)

5、可针对微量细胞

目前稳定最低只需200个细胞量的RNA(以小鼠卵母细胞为例)即可完成cDNA文库构建,有助于生殖发育学、神经生物学等领域的研究

(传统的Ribo-seq初始样品细胞量需要 ≥ 5x106~1x107 )

6、超高分辨率

A. 5'端剪切精度更高

QEZ-seq® 1.0技术专为翻译组分析而开发,不同于转录组Small RNA-seq建库方法(图F),我们的文库在5'端具有更高的精度,不会受到建库过程中碱基偏好性的影响(图H)


图4. 各类具有代表性的Ribo-seq数据集5'端精度比较

(H图为我们的技术)

B. 单碱基分辨率更高

QEZ-seq® 1.0技术拥有单碱基的分辨率,3核苷酸周期性≥70%,极大地提高了核糖体印迹的精准度,适用于各种核糖体相关的分析

(传统的Ribo-seq在分辨率普遍较低,3核苷酸周期性只能达到40%-50%)


图5 . QEZ-seq® 1.0质控


图6. QEZ-seq® 1.0质控

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4

实测数据展示


图7. 全基因组的覆盖度


图8. 比对到基因组的read长度分布


图9. 3核苷酸周期性


图10. 5' offset

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5

我们的服务

我们除了提供专业翻译组试剂盒,同时也为广大科研客户提供全套服务项目,流程包括:

1、样品处理

只需将样品快速冷冻,干冰运输寄给我们,我们负责后续全部事项

2、文库构建

我们的服务包括翻译组Ribo-seq + 转录组RNA-seq

3、深度测序

我们向客户保证有效数据量而非单纯下机数据量,不用担心测序量的问题

4、数据分析

包含10-12项标准化分析,满足大部分客户的需求,也可按客户要求进行个性化定制分析



图11. 标准化分析项目


图12. 个性化分析项目

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6

有任何问题请咨询:

新使生物官方网站:www.neoribo.com

邮箱:service@neoribo.com

联系电话:+86 13738233285

+1 607-279-4324

微信:13738233285 / Hello-Q968

销售区域:中国、亚太地区、美国

新使生物专业翻译组学技术平台

新使生物NeoRibo长期专注于翻译组学技术研发与应用,已构建覆盖核糖体翻译、tRNA解码、RNA修饰及Poly(A)尾调控等多个层面的技术体系,提供从整体翻译活性、基因翻译效率到密码子分辨率翻译行为的系统解决方案,全面解析转录后及翻译过程中的精细调控机制。



新使生物专业翻译组一站式服务平台
产品名称

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