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【前沿&进展】Advanced Biotechnology | 中山大学曹永长组-自主开发猪特异性V(D)J引物,构建多组织单细胞免疫组库新研究体系

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2026年10月9日,中山大学曹永长团队在Advanced Biotechnology杂志(JCR 8.8/Q1)在线发表了题为“A single-cell profile of the porcine immune repertoire: concurrent profiling of T cell receptor and B cell receptor V(D)J sequences in health”的文章。


该研究以健康杜洛克×长白×大白(Duroc × Landrace × Yorkshire,DLY)三元杂交仔猪为研究对象,整合单细胞RNA测序与T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)V(D)J测序技术,系统解析了仔猪11种免疫相关组织的细胞组成、免疫细胞异质性及适应性免疫组库特征,构建了覆盖淋巴器官、黏膜组织和外周血的多组织单细胞免疫组库参考图谱,为深入研究猪免疫系统的组织分布特征、免疫细胞克隆动态及病原感染后的免疫应答提供了重要的数据资源。


在研究方法与数据资源构建方面,研究团队自主设计了猪特异性V(D)J扩增引物,并将其应用于单细胞免疫组库文库构建与测序分析。该研究不仅完成了全局免疫细胞图谱的绘制,还进一步对B细胞和T细胞进行亚群细分,在此基础上,研究系统分析了BCR和TCR的V/J基因使用偏好、CDR3长度分布、受体基因片段配对、克隆多样性、克隆扩增及跨组织克隆共享特征,进一步将免疫受体信息映射至单细胞转录组图谱,实现了从细胞身份、转录状态到免疫受体克隆特征的多维度整合分析。


研究结果显示,猪不同免疫相关组织具有明显的细胞组成差异和组织特异性免疫结构,淋巴器官、肠道黏膜及外周血呈现出不同的免疫细胞分布特征。BCR与TCR组库均表现出一定的V(D)J基因使用偏好和丰富的克隆多样性。此外,研究还揭示了不同B细胞亚群的免疫球蛋白轻链使用、重链同种型及IgG亚类等位基因组成特征,进一步丰富了对猪体液免疫组库结构的认识。


该研究成果为后续开展猪重要疫病感染过程中的免疫细胞动态追踪、疫苗免疫应答评价、候选免疫标志物筛选、抗体组库分析及猪免疫发育研究提供了基础参考,也为进一步完善猪单细胞免疫组库研究技术体系、推动相关研究从基础图谱构建向疾病机制解析和免疫干预研究拓展奠定了基础。

本研究主要由中山大学副教授张灏,硕士生张祺鑫,哈尔滨兽医研究所张贺副研究员,北京百奥益康公司王盼飞共同完成,中山大学曹永长教授,哈尔滨兽医研究所吴洋副研究员,北京百奥益康公司刘杰为共同通讯作者。该研究得到了国家重点研发计划的资助。

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