Science | 遇赫课题组揭示披毛犀的起源、演化与更新世气候波动的联系

2026 年 9 月 10 日，北京大学生命科学学院、基因功能研究与操控全国重点实验室 、北京大学生态中心遇赫研究组联合 中国科学院地质与地球物理研究所阮骄杨等 国 内外 学者 在 Science 期刊在线发表研究论文 Paleogenomics and habitat modeling reveal temperate Eurasian origins of woolly rhinoceroses 。研究整合披毛犀古基因组数据与栖息地模拟，重建披毛犀近五十万年遗传多样性的起源和演化历史及其与古环境变化的关联，凸显了在中低纬度地区开展深时古基因组研究的重要意义。

更新世气候波动如何塑造 动物 演化，是演化生物学长期关注的重要问题。披毛犀（ Coelodonta antiquitatis ）是更新世适应寒冷的标志物种之一（图1），然而 一直以来， 我们对这一物种的精细演化历史，特别是它遗传多样性的起源、存续和 其 对更新世冰期 - 间冰期 旋回变化 的响应过程，知之甚少。为 回答 这 些 问题， 研究 团队 获取了来自 欧亚大陆 10 个遗址或地区 ， 距今约 23 万至 1.8 万年前的 29 份 披毛犀线粒体基因组和 14 份披毛犀核基因组（图2.A）。该数据集 聚焦先前缺乏采样的中纬度广大地区， 且 覆盖 中 - 晚更新世 的 多个冰期 - 间冰期 旋回 ， 为重建披毛犀的演化历史提供了 关键 的遗传证据。同时，研究 团队模拟了距今50万年前至披毛犀灭绝前栖息地适宜度的演变（图2.B–G），为遗传数据揭示的群体动态提供了可能的环境解释。

图 1. 披毛犀头骨化石（ 标本收藏于 国家自然博物馆，摄影人： 雷晓乐 ）

图 2 . 本研究所用披毛犀古代基因组的时空信息 （ A ） 和 过去五十万年 栖息地适宜度 的演变 （ B – G ）

基于迄今最全面的线粒体基因组数据集， 研究 估计披毛犀的最近共同祖先时间 （ TMRCA ） 约为 46 万年前，接近目前已知最早的化石记录，并处于海洋同位素阶段（ MIS ） 12 冰期，与其适应寒冷的特征相符。主要线粒体谱系在 46 万至 4 2 万年前分化， 处于 MIS 12 – MIS 11 的 冰期–间冰期 转型 期。栖息地模拟显示该时期披毛犀适宜栖息地在欧亚大陆大幅收缩、破碎，提示气候转暖引发的植被与生境重组可能是披毛犀遗传亚结构形成的环境推手。

末次间冰期是更新世 晚期 最温暖的 阶段 之一。 栖息地模拟显示，披毛犀在此时期经历了适宜 生境的大幅 收缩与碎片化 ， 仅在 欧亚中部 、 俄罗斯远东及其 临近地区得以维持 。这些 彼此隔离 的避难所 ， 可能 正是 东亚和 其它地区 披毛犀群体 走向 深度遗传分化 的舞台 。东欧 的 栖息地适宜度直到约 7 万年前才恢复， 这或可解释 欧洲群体较低的核基因组遗传多样性。 相比之下 ，阿尔泰地区在过去至少 1 6 万年 间 持续宜 居，是 晚更新世 贯穿冰期 —间冰期旋回 的长期避难所。

与起源于西伯利亚北部的真猛犸象（ Mammuthus primigenius ）不同，披毛犀的遗传多样性主要形成并维持于欧亚大陆 中纬度地区，其核基因组和线粒体基因组多样性均显著高于高纬度的西伯利亚东北。混合图谱分析进一步表明，东亚、阿尔泰地区和欧洲曾保留了独特遗传谱系，而西伯利亚东北群体则源自阿尔泰与东亚群体的混合（图3）。 这提示 ， 即使是适应 寒冷 的 物种 ，其 遗传多样性也可能 在 温带中纬度 相对稳定的生境中孕育并长期维系 。相较于因DNA保存条件优越而备受关注的高纬度地区，中低纬度地区值得更多的古基因组研究投入。

图3. 披毛犀核基因组揭示的群体结构、基因流与遗传多样性

综上，本研究把冰河时代最具代表性的巨兽之一——披毛犀的遗传历史，放到更新世气候与生境变迁的背景中加以解读，凸显了欧亚大陆温带地区在耐寒物种演化中的关键作用（图4），也展示了中、低纬度地区古基因组学研究的巨大潜力。未来， 随着样本时空覆盖的拓展 ， 以及古基因组与高分辨率古环境模拟的进一步结合， 披毛犀演化历史的 更多 细节 有望被逐一还原 。

图 4 . 晚更新世 中纬度地区 披毛犀 和生境 的艺术 复原图 （作者：叶健豪）

清华大学生命科学学院 PTN 项目博士生雷晓乐（ 导师为北京大学生命科学学院遇赫研究员 ）与中国科学院地质与地球物理研究所 阮 骄杨 特聘 研究员为本文共同第一作者。生命科学学院遇赫研究员为本文的通讯作者。 斯德哥尔摩大学 Love Dalén 教授、莫斯科大学 Alexandra Buzhilova 教授和俄罗斯科学院西伯利亚分院人类学与民族学研究所 Michael Shunkov 研究员等为本研究做出重要贡献。 中国科学院古脊椎动物 与古人类 研究所、国家自然博物馆和黑龙江 绥化市青冈县第四纪古生物化石博物馆 为 本 研究提供了重要样本。

文章链接：science.org/doi/10.1126/science.aed0430

制版人： 十一

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