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谷歌DeepMind发布AlphaGenome Atlas,预测90亿种基因变异

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在大型语言模型争夺舆论焦点之际,谷歌DeepMind团队再次将机器学习应用于科学前沿。周二,DeepMind正式发布AlphaGenome Atlas。这是一个庞大的PB级数据库,能够预测人类基因组中90亿种可能核苷酸变异的影响,旨在帮助科学家更精准地理解人体基本原理及相关疾病机制。

从模型到地图集:绘制基因变异效应图

AlphaGenome Atlas建立在DeepMind去年推出的AlphaGenome AI模型基础之上。尽管AlphaGenome已能预测基因变异对生物过程的影响,但在实际应用中,研究人员仍面临如何从海量可能性中筛选关键变异的挑战。

DeepMind团队表示,通过大规模预计算AlphaGenome的预测结果,团队创建了这一易于访问的资源。正如地图集整合地理特征一样,AlphaGenome Atlas绘制了DNA变异在整个基因组中的分子效应图。该平台现已向全球研究人员公开。

AVI评分机制:缩小搜索范围

该数据库的核心创新在于为每个预测变异分配“AlphaGenome变异影响”(AVI)评分。谷歌声称,这一评分机制可帮助研究人员对基因变异进行排名,识别出最可能对目标性状产生显著影响的变异,从而避免低效的“大海捞针”式搜索。

在与GREGoR财团合作的实验中,研究人员利用AVI评分成功识别出影响DNM1基因的遗传变异。DNM1基因与癫痫性脑病这一罕见且严重的脑部疾病密切相关。更重要的是,候选变异的AVI评分揭示了其具体作用机制:该变异创建了一个错误的剪接位点,导致最终产生的蛋白质异常延长。

持续演进的科学工具

DeepMind指出,AlphaGenome Atlas目前提供的仍是预测结果。随着底层AlphaGenome模型的不断演进,这些预测精度将持续提升。该平台被视为研究人员武器库中的又一新工具,而非终极答案。

此举进一步印证了DeepMind致力于将机器学习推向超越大语言模型的广阔领域。除AlphaGenome外,DeepMind还开发了用于预测蛋白质结构的AlphaFold以及提升天气预报准确性和速度的多个模型。

与此同时,谷歌也在加速其商业布局。公司今年计划资本支出超过1950亿美元,并试图通过AI答案重构搜索结果生态,这一举动引发了关于独立网络出版商生存空间的争议。

【星途科讯 图文丨欧阳布布 首发于ZAKER科技,转载请注明出处】

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