从空间组学到长读长,组学以及测序质控为何亟需更清晰的标准化路径?2025 年在《Nature Methods》上发表的研究指出空间数据套用单细胞质控易遗漏局部伪影,需算法校正。但这类偏差源于前处理还是组织异质性,单细胞与空间组学又该在哪些环节统一标准?这些判断发生在测序之前,算法无法弥补[1]。此外,对长读长 RNA-seq 的系统评估表明,转录本鉴定更依赖序列长度与碱基准确性,而测序深度主要影响定量精度[2]。因此,实验室须更早识别风险、更快定位异常,并为流程优化提供数据依据。
组学研究以及测序实验的每一步都离不开可靠、标准化、可追溯的质量控制。为帮助大家系统掌握各环节的质控判断,丁香园联合安捷伦将于 8 月 13 日 14:00 举办「组学质控进阶:体系搭建、实操落地与问题排查」线上讲座,邀请三位行业专家,围绕测序质控中的前沿应用、流程要点与实操经验展开分享,如实验设计、样本与文库质量评估、长片段文库构建、常见故障排查技巧等进行讲解。现在扫码报名参与,还有机会赢取炫彩蓝牙音响、水具套装、多巴胺彩色网格包等精美好礼!
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直播亮点抢先看
主题一:单细胞及空间组学实验质控体系标准化
主讲人:王翠亭 欧易生物产品经理
讲课背景:
样本类型、建库流程和数据结构的变化,让不少人陷入「用单细胞 QC 经验套用空间数据」的误区:同样的质控指标,换个场景判断逻辑可能完全不同,分不清是技术噪声还是真实异常,容易导致误判返工或漏判影响后续分析。本场报告将介绍单细胞及时空组学技术背景,并围绕单细胞测序和时空组学实验的质控标准化展开,帮助用户理解不同实验节点的质控逻辑与实践价值。
分享要点:
1
单细胞及时空组学技术介绍:从技术原理出发,理解样本类型、建库流程和数据结构的差异,为后续质控逻辑打基础。
2
单细胞测序实验质控标准化:梳理单细胞测序关键实验节点的质控要点,明确每个节点该查什么、怎么判断。
3
时空组学实验质控标准化:针对空间组学特有的样本复杂度和技术噪声,建立区别于单细胞的质控判断标准。
主题二:长片段测序的质控要点解析
主讲人:骆备 华大基因科技服务长读长测序平台生产经理
讲课背景:
长读长测序在复杂基因组组装、结构变异识别、全长转录本分析等场景中展现出重要价值,但测序深度增加并不等于结果可靠性提升,起始样本完整性和文库片段质量才是决定结果可解释性的关键因素。本场报告将围绕长读长测序的优势及应用、文库质控的必要性、关键质控点,以及 Femto Pulse 长片段分析应用案例进行解析,帮助用户更好地把控长片段测序流程中的质量风险。
内容要点:
1
长读长测序的优势及应用:梳理长读长技术在复杂基因组组装、结构变异识别、全长转录本分析等场景的应用价值。
2
长读长测序文库质控的必要性及关键质控点:拆解起始样本完整性、片段长度、序列准确性如何共同影响最终结果,解释为何深度增加不等于可靠性提升。
3
长片段分析应用案例:结合实测案例,展示如何通过片段分布分析提前识别文库质量风险,为测序策略选择提供依据。
主题三:常见质控平台的使用经验和故障排除技巧分享
主讲人:王梅 安捷伦基因组学应用工程师
讲课背景:
基线杂峰、泳道不出峰、marker 异常、胶条气泡、样本未混匀…… 这些问题几乎每个实验室都会遇到,但很多时候大家只能凭经验试错,缺乏系统的排查思路,导致反复返工、耽误进度。本场报告将结合 Fragment Analyzer 毛细管片段分析仪系统和 TapeStation 预制胶核酸电泳仪的使用经验,分享常见问题的排查思路和实用技巧。
内容要点:
1
毛细管电泳质控:分享日常操作实践要点,规范使用流程、减少人为误差;针对基线杂峰、基线不平、泳道不出峰、marker 异常、额外峰、空白孔条带、RNA 样本额外峰等常见现象,逐一拆解可能原因及应对方法。
2
预制胶电泳质控:分享日常操作要点和适用场景;针对胶条冷冻、胶条气泡、样本未混匀、样本盐离子浓度过高、样本浓度过高等高频问题,梳理排查优先级和处理顺序。
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内容策划:沈佳钰
内容审核:吴军
题图来源:图虫创意
参考文献:
[1] Totty M, Hicks SC, Guo B. SpotSweeper: spatially aware quality control for spatial transcriptomics. Nat Methods. 2025
[2] Pardo-Palacios FJ, Wang D, Reese F, et al. Systematic assessment of long-read RNA-seq methods for transcript identification and quantification. Nat Methods. 2024
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