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他们拥有孩童般清澈的眼睛,却背负着垂暮老人的衰老躯壳。这就是被称为“儿童版衰老”的罕见病—Hutchinson-Gilford早老症(HGPS)。这些住在老人身体里的孩子,每天都在与无情的死神进行残酷的赛跑。他们的生命往往在十几岁时,就因严重的心血管衰竭而戛然而止。长期以来,全球科学家都在竭尽全力修补这本“被诅咒的基因说明书”。
近日,浙江大学良渚实验室的沈宁团队在医学期刊Med在线发表题为AI-driven therapeutic antisense oligonucleotide for processing-deficientprogeroidlaminopathies的研究论文。研究团队利用人工智能(AI)算法设计出了一把针对早老症的“万能钥匙”—新型反义寡核苷酸(ASO)药物LM2556。该药物成功让早老症小鼠的寿命延长82.86%。
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从“修补”到“重塑”:一次治疗逻辑的跃迁
早老症患者往往在十几岁就因心血管疾病夭折。长期以来,治疗策略主要聚焦于“修补”:既然是法尼基化修饰出了问题,就用小分子药洛那法尼(Lonafarnib)去抑制相关酶,但其临床疗效有限且副作用较大;另一种思路是针对剪接错误,利用反义寡核苷酸(ASO)进行位点纠正。沈宁团队敏锐地发现了现有研究的痛点:以往文献报道的ASO主要局限于经典突变(LMNA c.1824C>T)患者,而对于由非经典突变或ZMPSTE24缺陷导致的“加工缺陷型早老症”,已报道的ASO疗法往往束手无策。正是这一空白,成为了团队实现治疗逻辑“从修补到重塑”的突破口。能否设计一个“广谱”疗法,像一把万能钥匙解开所有的锁?
团队将目光投向了 LMNA基因的3'非翻译区(3'UTR),该区域既包含了致病的早老蛋白(progerin),也包含了ZMPSTE24缺陷积累的异常前体(pre-lamin A),却唯独不包含对人体至关重要的正常蛋白Lamin C。靶向该区域,可以通过转录本特异性降解异常前体pre-laminA和progerin,意味着可以在降低毒性的同时,保留正常的生理功能。
ASOMAR:给药物研发装上“导航系统”
为了让这把“万能钥匙”精准成型,沈宁团队自主开发了一个名为 ASOMAR 的深度学习框架,进行ASO的序列筛选。在 ASOMAR 的指引下,研究人员精准锁定了位于 3'UTR 区域的第 2556 号位点,并成功设计出候选药物 LM2556。它能够特异性减少有害的 lamin A 相关转录本,同时维持 Lamin C 的正常水平。同时,特定的化学修饰增强了药物的组织穿透力,也极大降低了潜在的脱靶毒性。
从2D细胞到3D心脏类器官的“全链条”验证
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图1. 靶向治疗早老症的ASO药物研发流程
在早老症患者来源的心肌细胞(iCMs)中,LM2556改善了因毒素堆积而皱褶的细胞核膜,修复了紊乱的肌节结构,并显著降低了衰老标志物SA-β-gal的水平。更进一步,团队建立了三维心脏类器官模型,这是一个更接近人体心脏的复杂系统。结果显示,LM2556不仅能深入组织内部,还能有效纠正钙处理功能的异常—这是心脏能够有力跳动的关键。转录组学分析更显示:多达 3762 个因疾病失调的基因被重新“置位”回了健康状态。
在LMNAG608G/G608G纯合早老症小鼠模型中,LM2556亦展现良好的治疗效果:它不仅显著改善了主动脉血管平滑肌的丢失和心肌纤维化,更重要的是,它极大地延长了小鼠的寿命。接受治疗的雄性小鼠中位生存期达到385天,雌性更是长达448天,相比对照组延长了82.86%。值得一提的是,在与其他已报道ASO药物的头对头比较中,LM2556在疗效和安全性上均表现出突出优势,且未观察到肝、肾毒性。
浙江大学良渚实验室博士后吕林与刘畅为该论文的共同第一作者,沈宁研究员为通讯作者。
原文链接:https://www.cell.com/med/fulltext/S2666-6340(26)00196-0
良渚实验室沈宁课题组围绕“组学与精准医学分析算法开发与应用”开展临床转化密切相关的研究,运用生物信息学数据整合分析与人工智能算法,并结合实验筛选平台进行药物研发与精准治疗。现课题组诚招具有实验生物、计算生物背景的博士后和研究助理,有意者请投递简历。
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