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环肽在现代药物发现中的趋势与治疗方向

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引言

Cyclic Peptides

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环肽因高特异性、良好安全性和可调理化性质,已成为多肽药物中的重要类别(占 FDA批准多肽药物的~25%)。其环状结构赋予增强的构象刚性、蛋白水解稳定性和结合亲和力,MW约500–3000 Da,兼具生物制剂的选择性与小分子的药代动力学优势。全球环肽市场预计2032年超53亿美元,肿瘤、自身免疫和感染性疾病是主要应用领域。现基于CAS内容合集,系统分析环肽研究趋势、结构特征、理化性质及临床开发格局。

环肽研究趋势

Cyclic Peptides

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2006–2025年环肽文献持续增长(期刊66%,专利34%),2015年后加速,2023–2024年专利超期刊,反映商业化增强。中国发文量居首(专利占比高),其后为美国、日本等。CAS领域分析显示制药主导,免疫化学、生物化学方法等增长显著,应用拓展至生化工具和生物技术。

环肽作为治疗药物

Cyclic Peptides

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图1.(A)环肽相关期刊与专利的逐年分布;(B)环肽相关期刊与专利的国家/地区分布;(C)基于CAS分类的环肽相关专利逐年趋势;(D)环肽研究的主要治疗领域(图源:J. Med. Chem. 2026,https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.6c01522)


图2. 环肽类型、环化方式及几种常见修饰的示意图(图源:J. Med. Chem. 2026,https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.6c01522)

对2020–2025年具有治疗/药理/药代动力学角色的46,574种环肽进行分析。治疗领域以肿瘤学为主,感染性和炎症性疾病次之,自身免疫和心血管疾病亦占重要地位(图1)。


图3. 已鉴定的环肽分布,基于(A)环肽类型和(B)环化类型;(C)桑基图显示肽类型与环化类型的共现关系(图源:J. Med. Chem. 2026,https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.6c01522)

环肽类型(图2,图3A):大环肽(≥6个氨基酸)占比最高(>50%),双环/多环次之,环二/三肽最少,表明较大环肽因稳定性和功能多样性更受青睐。

环化类型(图3B):头尾环化最普遍(~2/3),因其消除游离末端、增强外肽酶抗性和膜通透性;侧链-尾和混合环化更多见于双环/多环及四/五肽(图3C)。


图4.(A)具有指定修饰的环肽分布;(B)桑基图显示各种修饰、肽类型和环化类型之间的共现关系(图源:J. Med. Chem. 2026,https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.6c01522)

环化键与修饰(图4A):二硫键最常见,硫醚次之。化学修饰中N-甲基化最普遍(提高口服生物利用度、蛋白酶抗性和膜通透性),其次为复杂修饰和脂化。修饰与肽类型共现显示大环和双环/多环肽修饰更多样(图4B)。


图5. 违背Lipinski和Veber类药物标准的环肽百分比(图源:J. Med. Chem. 2026,https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.6c01522)


图6. 环肽关键理化性质的分布(图源:J. Med. Chem. 2026,https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.6c01522)


图7. 环肽关键理化性质的分布(图源:J. Med. Chem. 2026,https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.6c01522)


图8. 散点图显示(图源:J. Med. Chem. 2026,https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.6c01522)

理化性质(图5):多数环肽在MW、PSA、HBD/HBA和可旋转键上违反Lipinski/Veber标准,且同时违背多条规则,证实治疗性环肽主要处于“超越五规则”空间。性质分布呈窄带聚集(图6、7),反映其为高度优化的受限化学子空间。MW–PSA和MW–Log P散点图(图8)显示极性随MW可控增长,亲脂性维持窄带,临床成功肽均落在相同范围内。


图9. 热图展示环肽类型、环化类型和修饰与各给药途径的共现关系(图源:J. Med. Chem. 2026,https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.6c01522)


图10. 热图展示环肽类型、环化类型和修饰与各治疗领域的共现关系(图源:J. Med. Chem. 2026,https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.6c01522)


图11. 热图总结环肽类型、环化类型和修饰与各潜在分子靶点的共现关系(图源:J. Med. Chem. 2026,https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.6c01522)

共现分析(图9–11):口服、直肠和静脉途径占主导;大环/双环/多环肽在口服/静脉中高度富集。N-甲基化与口服强共现,二硫键和硫醚键广泛出现。分子靶点方面,PD-1/PD-L1、Ras、SOS1、MDM/p53、TNF等为热点,环肽在靶向PPIs和传统“不可成药”靶点方面具有独特优势。

口服生物可利用环肽

Cyclic Peptides

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图12.(A)基于给药途径的环肽相关文献(期刊和专利)分布;(B)2006–2025年基于给药途径的环肽相关文献逐年趋势(图源:J. Med. Chem. 2026,https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.6c01522)

口服途径在文献中占主导,但面临多重挑战:高MW/PSA违反口服规则、酶降解、黏液屏障、主动外排、首过代谢及PK变异性。

克服策略可从以下三个方面着手。分子设计,N-甲基化、D-氨基酸、脂化、前药、变色龙设计(环境依赖性构象转变及分子内氢键)及AI预测工具(CycPeptMP)。制剂,脂质基系统(SEDDS、脂质体)、聚合物纳米粒(PLGA、壳聚糖)、肠溶包衣、渗透增强剂(辛酸钠,MYCAPSSA为临床成功例)及蛋白酶抑制剂。装置,可摄入微针(SOMA、RaniPill)、高速喷射胶囊等物理递送平台。

临床成功口服环肽仍罕见(如环孢素A),需极性掩蔽、适应性构象、代谢稳定性等多种特性异常协同。

获批环肽从早期抗菌剂(杆菌肽、万古霉素)扩展至内分泌(奥曲肽)、心血管(奈西立肽)、免疫(伏环孢素)等。近期批准包括司美诺肽(遗传性肥胖)、齐卢普兰(重症肌无力)、瑞扎芬净(侵袭性念珠菌病)。MW范围540至>43,000 Da,给药途径从注射扩展至口服、鼻用、吸入和皮下。

从理化基准来看,获批及临床环肽MW和PSA远超小分子阈值,临床成功依赖构象约束和极性掩蔽等补偿特征。失败案例(如西仑吉肽)说明靶点生物学复杂性可导致结构优化失效;罗米地辛则显示“代谢缺陷”(二硫键)可能是治疗机制的一部分。

展望

Cyclic Peptides

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环肽因兼具选择性与稳定性已成为重要药物形式。CAS数据揭示研究活动稳步增长,专利激增反映商业兴趣。肿瘤学为主,大环/双环骨架、头尾环化及N-甲基化等特征突出。口服递送受高度关注,但临床成功依赖多特性协同。临床管线展示环肽在肿瘤、免疫、心血管等领域日益成熟。未来AI驱动设计、展示平台、新型环化和递送技术将加速环肽从注射向口服转型,拓展可成药空间,巩固其作为下一代精准治疗核心模块的地位。

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