近日,《The Plant Cell》在线刊发安徽农业大学园艺学院十字花科不结球白菜团队与清华大学合作题为“Landscape of plastid DNA breaks in Arabidopsis during development and environmental stimulus”的研究论文。安徽农业大学为论文第一单位,十字花科不结球白菜团队青年教师王文杰教授与清华大学生命学院郑成霞博士为论文共同第一作者,清华大学孙前文副教授为论文通讯作者。
本研究利用最新研发的DEtail-seq技术,首次对十字花科模式物种拟南芥叶绿体基因组DNA断裂进行了全基因组高分辨率图谱绘制。该技术无需高温变性或末端补平,避免了人工损伤。研究发现,质体DNA在幼叶中较稳定,随叶片衰老断裂显著增多;核糖体DNA区域断裂频率更高,且偏向模板链。在DNA修复或复制缺陷突变体中,断裂水平急剧上升,而缩短光照时间可有效减轻损伤。研究进一步揭示R-loop积累和活性氧诱导的8-氧代鸟嘌呤修饰是导致DNA断裂的重要诱因。
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