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2026年美国临床肿瘤学会(ASCO)年会接近尾声。今年大会中,多组学相关研究占比超8%,其中基因组研究以超半数占比稳居核心赛道,从体细胞突变、拷贝数变异到融合基因、HRD、TMB等关键标志物的全景分析,已成为靶向、免疫治疗患者分层与疗效预测的标配工具;液体活检多组学的快速崛起,更让ctDNA联合甲基化、片段组学的无创监测方案,成为预后评估、肿瘤早诊的研究热点,中国在该领域的研究占比更是全球领先。
在这股多组学浪潮中,全基因组测序(WGS)凭借无偏覆盖全基因组的全景解析能力,正迎来从科研前沿到临床落地的关键跨越。从复杂变异的精准捕捉、罕见靶点的深度挖掘,到液体活检中监测灵敏度的突破,WGS在本届大会的多项重磅研究中,展现出重塑肿瘤临床诊疗格局的巨大潜力。
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亮点一览
WGS全面解析肺癌脑转移,揭示染色体不稳定性(CIN)作为脑转移标志性基因组特征(e20554)
WGS驱动的量子AI/ML模型,实现胶质母细胞瘤GBM患者生存预测与靶点发现(3020)
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Whole-genome profiling to identify chromosomal instability as a distinct feature of lung cancer brain metastases.
利用全基因组谱分析鉴定染色体不稳定性是肺癌脑转移的一个独特特征。
摘要号:e20554
发表单位:Guangdong Provincial People's Hospital, Guangdong 999 Brain Hospital, Warshel Institute of Computation Biology, Guangdong Lung Cancer Institute
临床痛点
肺癌脑转移异质性突出、预后极差,其背后的分子机制一直未被完全阐明;既往研究受限于缺乏高深度全基因组测序(WGS)数据,无法精准解析染色体不稳定性(CIN)与精细基因组结构,严重制约了脑转移启动、演化及异质性机制的研究进展,而WGS无偏全景覆盖的能力,成为破解这一难题的关键技术支撑。
研究设计
本次研究纳入83例肺癌脑转移样本,采用200×高深度WGS进行基因组分析,系统性表征体细胞驱动变异、全基因组加倍(WGD)、染色体碎裂及结构变异特征,旨在明确CIN在肺癌脑转移中的核心作用,挖掘脑转移特异性基因组特征。
核心数据与结论
高深度WGS结果显示,83例脑转移样本中68.7%存在全基因组加倍,26.5%发生CDKN2A/2B纯合缺失,39.8%出现类染色体碎裂事件,36.1%存在EGFR等驱动基因高倍扩增,清晰揭示了染色体不稳定性是肺癌脑转移的核心基因组特征。
该研究证实,全基因组测序(WGS)是解析肺癌脑转移复杂基因组特征、揭示转移演化机制的核心工具,为后续生物标志物开发与临床转化奠定了坚实基础。因美纳WGS方案通过高效捕捉全基因组SNV、CNV及复杂结构变异,精准解析CIN相关的重复序列与复杂重排盲区。
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Quantum mechanics-based multi-tensor AI/ML as predictor of patients' overall survival, gene targets, and drug responses from their glioblastoma tumors' whole genomes.
基于量子力学的多张量AI/ML:基于胶质母细胞瘤肿瘤全基因组预测患者总生存期、基因靶点和药物反应
摘要号:3020
发表单位:Illumina因美纳,University of Utah,Prism AI Therapeutics, Inc.,Scale AI, Inc.,Children's Hospital of Los Angeles/University of Southern California,Case Western Reserve University School of Medicine,Winship Cancer Institute of Emory University,Ultima Genomics, Inc.,Complete Genomics, Inc.,The Abigail Wexner Research Institute at Nationwide Children's Hospital,Hudson Alpha Clinical Services Lab LLC,Wright State University
临床痛点
胶质母细胞瘤靶向药失败率高达 95%,单基因标志物无法预测患者生存与药物反应;多组学数据高维复杂、小队列建模难度极大,亟需基于全基因组(WGS)的全景分析,解锁肿瘤生物学全貌,支撑精准诊疗决策。
研究设计
本次研究以全基因组测序(WGS)数据为核心,开发量子力学多张量AI/ML模型,旨在基于GBM全基因组拷贝数变异等全景特征,精准预测患者总生存、挖掘治疗靶点与药物反应。研究纳入多队列患者数据,通过因美纳等多平台WGS数据验证模型重现性,并结合CRISPR-Cas9实验对预测靶点进行功能验证。
核心数据与结论
研究结果表明,基于WGS数据训练的AI模型,预测患者总生存的一致性达75%-95%,优于所有传统临床指标;该模型在因美纳等多个平台的WGS数据中重现性超99%,且通过WGS发现的METTL2A靶点,经CRISPR验证可显著抑制GBM细胞增殖,药敏反应与预测结果完全匹配。
这项研究证明,全基因组测序(WGS)是破解GBM高维建模难题、实现精准预后与靶点发现的核心数据基础;因美纳WGS可作为该类AI模型的黄金标准数据底座,打造 “WGS + 量子 AI/ML”一体化方案,推动GBM从基础研究到临床诊疗的转化,赋能预后分层、新药研发与精准治疗全流程。
因美纳提供从传统短读长WGS到全新TruPath 长读长测序的全场景解决方案,成熟的短读长WGS方案可高效覆盖全基因组SNV/Indel与拷贝数变异,而今年上新的TruPath长读长方案,更能精准解析全基因组中复杂结构变异与重复序列盲区,为AI模型提供更完整的基因组信息,助力挖掘更具临床价值的预后特征与治疗靶点。
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ASCO 2026 年会持续进行,重点研究呈现出更加鲜明的转化医学特征。多项研究集中呈现出肿瘤治疗向更早阶段、更精细分层和多模式整合推进的趋势。
肝癌
局部治疗与系统治疗整合仍是不可切除HCC的重要研究方向
摘要号:LBA4000
Efficacy and safety resultsfrom EMERALD-3: A phase 3, randomized study of tremelimumab plus durvalumabwith or without lenvatinib combined with transarterial chemoembolization (TACE) in participants with unresectable embolization-eligible hepatocellular carcinoma.
作者:Ghassan K. Abou-Alfa, etal. Memorial Sloan Kettering Cancer Center
在不可切除、适合栓塞治疗的肝细胞癌中,EMERALD-3研究评估STRIDE ± lenvatinib联合TACE。STRIDE + lenvatinib + TACE较TACE显著改善PFS,HR为0.70,95% CI为0.57–0.86,p=0.0007;OS HR为0.84,95% CI为0.65–1.09,p=0.1814。STRIDE + TACE较TACE也改善PFS,HR为0.71,95% CI为0.56–0.91;OS HR为0.70,95% CI为0.51–0.95。3/4级治疗相关不良事件发生率分别为62.7%、48.6%和18.6%,对应STRIDE + lenvatinib + TACE、STRIDE + TACE和TACE组。
在肝细胞癌治疗序贯方面,摘要4002 报道了 IMbrave251 最终分析。这是首个全球随机 III期研究,评估既往接受 atezolizumab + bevacizumab 后进展的局部晚期或转移性 HCC 患者中,继续 atezolizumab 联合 TKI 是否优于 TKI 单药。研究共纳入557例患者,中位随访12个月;结果显示,atezolizumab + TKI 与 TKI 单药相比,中位 OS 为14.6个月 vs 12.5个月,HR 0.88,P=0.2115,未达到主要 OS 终点;中位 PFS 为4.3个月 vs 4.8个月。
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乳腺癌
摘要号:LBA514
Neoadjuvant rilvegostomig plus trastuzumab deruxtecan (T-DXd) in high-risk HER2-negative breast cancer: Results from the I-SPY 2.2 trial.
I-SPY 2.2研究评估rilvegostomig联合T-DXd作为Block A新辅助治疗。105例患者接受R + T-DXd治疗。HR+Immune+患者Block A EpCR为57%,高于预设目标15%,posterior probability >0.99;HR-Immune+患者EpCR为52%,对应预设目标40%,posterior probability为0.87。Immune-亚组未达到对应pCR目标。安全性方面,最常见不良事件包括疲乏84.8%、恶心81.0%和脱发58.1%;Block A期间ILD发生率为11.4%,其中1例为3级,8例患者因ILD停用T-DXd + R并进入下一治疗Block。
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黑色素瘤
KEYNOTE-942(摘要9500)研究在高危切除黑色素瘤患者中评估 mRNA 个体化新抗原治疗 intismeran autogene 联合 pembrolizumab。5年更新显示,中位随访60.3个月时,intismeran autogene联合pembrolizumab较pembrolizumab单药降低复发或死亡风险49%,RFS HR为0.51,95% CI为0.294–0.887;降低远处转移或死亡风险59%,DMFS HR为0.411,95% CI为0.200–0.843。OS为探索性终点,HR为0.471,95% CI为0.165–1.345。
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在 Developmental Therapeutics 和 CSS 专场中,新型精准治疗机制同样值得关注。
在DLL3 ADC研究中,摘要3001报告BL-M14D1用于局部晚期或转移性SCLC、NEC和其他实体瘤的I期结果。截至2025年11月30日,共127例患者入组,其中SCLC 87例、NEC 40例。治疗相关不良事件发生率为98.4%,≥3级治疗相关不良事件发生率为74.0%;最常见≥3级治疗相关不良事件包括血小板减少54.3%、中性粒细胞减少53.5%、白细胞减少46.5%和贫血32.3%。在4.0 mg/kg和4.5 mg/kg剂量水平下,经治SCLC患者ORR/cORR为71.1%/57.8%,中位PFS为7.2个月。
在KRAS G12D靶向治疗研究中,摘要3007报告DN022150用于KRAS G12D突变晚期实体瘤患者的I/IIa研究。截至2026年1月22日,共56例患者入组,其中66.1%为胰腺癌,约80%既往接受过≥2线系统治疗;安全性分析纳入49例患者,剂量范围为20–650 mg。
在MYB mRNA degrader研究中,摘要6009报告REM-422用于复发/转移性腺样囊性癌的I/II期剂量递增队列最终结果。I期研究共入组69例患者,59例可评估疗效;其中32例为biomarker positive。RP2D为24 mg,RP2D下最常见治疗相关不良事件为鼻出血60%、疲乏60%和贫血40%,均为1级或2级。Biomarker positive人群中,≥12 mg剂量下21/30例出现靶病灶缩小;RP2D 24 mg下7例biomarker positive患者中观察到3例PR,ORR为42%。
泛实体瘤ADC研究摘要11510 YL201 是一款 B7-H3 ADC,采用肿瘤微环境可激活 linker-payload 平台。既往泛实体瘤研究显示,其 ORR 达到 44.6%,DCR 为 83.7%。本次 ASCO 研究进一步拓展至复发或难治性尤文肉瘤和软骨肉瘤。
在ADC靶点转化研究中,摘要11509 一项平滑肌肉瘤空间RNA–蛋白profiling研究分析了35个ADC靶点。研究包括ST-LMS 23例患者、94个ROI,以及U-LMS 32例患者、92个ROI。RNA层面F3、AXL和PTK7表达最高;蛋白层面Tissue Factor、AXL和CD70表达最高。多数ADC靶点存在空间变异,U-LMS较ST-LMS显示更高的肿瘤内和肿瘤间异质性。RNA–蛋白一致性最高的靶点包括CD99、CD47和Fibronectin/EDB;ERBB2–EGFR在蛋白层面呈强相关。ST-LMS中,CD47和AXL高表达与更好的生存相关。
在免疫再敏化研究中,摘要2501报告IOS-1002联合pembrolizumab用于既往抗PD-1/PD-L1治疗后进展的晚期实体瘤患者。截至2026年1月1日,28例患者接受联合治疗,其中16例为抗PD-1/PD-L1复发/难治患者。可评估患者中观察到3例确认PR,ORR为20%,即3/15;第12周DCR为54%,即7/13;第24周DCR为40%,即4/10。
在GPC3 CAR-T研究中,摘要2508报告Ori-C101用于多线治疗后的GPC3阳性晚期HCC患者。截至2025年12月24日,19例患者接受Ori-C101输注,所有患者均为BCLC B/C期,31.6%存在肝外转移;既往治疗线数中位数为3线,范围2–8线。摘要显示,在延长随访期间未观察到迟发性或累积性毒性;最常见≥3级治疗期间不良事件包括一过性血液学毒性和肝功能实验室异常
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全基因组测序(WGS)凭借全基因组无偏覆盖的全景解析能力,突破传统基因检测覆盖局限、临床分型粗糙及风险标志物挖掘不足的瓶颈,成为肿瘤精准医学的核心底层技术。WGS广泛应用于肺癌、乳腺癌、消化道肿瘤等实体瘤及血液肿瘤领域,可深度解析肿瘤进展、耐药、转移的分子机制,精准捕获传统检测遗漏的高危变异与关键基因组事件;同时依托WGS构建的液体活检、肿瘤溯源与无创筛查体系,实现肿瘤微转移监测、预后精准分层与早期无创诊断;在人群队列研究中,WGS还可完成基因组祖先精细聚类与血统特异性风险变异鉴定,为肿瘤精准预防、个体化诊疗及健康公平提供核心技术支撑,全面推动肿瘤诊疗从经验化向精准化升级。
肺癌
摘要:8027
作者:Ruoyi.Jin, Peking University People's Hospital
题目:Chromosomal instability and integrated tumor-margin immune ecosystem remodeling as drivers of progression of pulmonary ground-glass nodules.
本多中心纵向研究纳入845例GGNs患者,中位随访55.8个月,通过系列CT分为稳定型、GGO为主型、实性为主型三组。WGS分析显示,GGNs进展主要由染色体不稳定性驱动,进展性结节存在染色体碎裂、局部超突变、染色体外DNA等灾难性结构变异,稳定型结节中未检出。基于基线CT结节及2.5mm边缘特征开发的AI模型,训练/内部/外部队列 AUC 分别达 0.89/0.85/0.83,为 GGNs 侵袭性进展预测提供精准工具。
乳腺癌
摘要:1034
作者:Greydon.Arthur,BC Cancer Agency
题目:Real-world outcomes and tumor gene expression analysis of sacituzumab govitecan (SG)- and trastuzumab deruxtecan (T-DXd)-treated metastatic breast cancer (MBC).
本回顾性研究纳入43例接受SG或T-DXd治疗的转移性乳腺癌患者,采用全基因组和全转录组测序评估真实世界疗效并探索疗效相关分子特征。结果显示,SG 组中位无进展生存期为 4.0 个月,T-DXd 组为 7.4 个月;T-DXd 初治患者中,应答不佳者ESR1表达显著更高,FGFR1扩增患者均对 ADC 应答不佳,同源重组缺陷与 SG 良好应答相关,证实患者结局存在显著异质性,为 ADC 疗效预测标志物探索提供了关键依据。
消化系统肿瘤
摘要:4101
作者:David.Liu, Divsion of Cancer Surgery
题目:Diagnostic andpredictive utility of peritoneal tumor DNA in gastroesophageal cancer: Aprospective multicenter study.
一项前瞻性队列研究开发了基于肿瘤溯源全基因组测序(WGS)的腹膜肿瘤 DNA(ptDNA)检测平台,用于胃及胃食管结合部癌(G/GEC)的腹膜转移诊断与预后评估。研究纳入 92 例接受根治性治疗的非转移性患者,结果显示 ptDNA 阳性与晚期 T 分期显著相关,且是腹膜复发及生存不佳的独立预测因素;新辅助治疗后 ptDNA 转阴患者无腹膜复发,独立队列验证其诊断效能达 100%,为腹膜微转移诊断提供了精准工具。
其他重磅进展
摘要:10514
作者:Hersh.Gupta, Albert Einstein College of Medicine
题目:Fine-scaled genomic ancestry clusters to reveal population-specific cancer enrichments in the All of Us Research Program.
本研究基于美国 “我们所有人”(All of Us)项目41.5万人群数据,通过同源相同(IBD)基因组片段精细聚类,将24.5万有效样本划分为58个祖先亚群,系统评估19种癌症的人群特异性风险。研究复现了德系犹太人群乳腺癌、非洲裔人群前列腺癌等已知风险,同时发现混合夏威夷裔女性乳腺癌、波多黎各裔/多米尼加裔人群结直肠癌的新富集信号,揭示了西班牙裔内部的肺癌风险异质性。证实精细基因组聚类比传统种族标签更精准识别亚群风险,为消除癌症健康差异、实现精准预防提供了新思路。
摘要:10504
作者:Jeffrey.Shevach, Duke University School of Medicine
题目:Association betweenthe rs72725854(A>T) allele and prostate cancer in males of African ancestry in a US population-based database.
基于美国 “我们所有人”(All of Us)数据库的回顾性队列研究,纳入18,846名非洲血统男性,评估rs72725854 (A>T)变异与前列腺癌风险的关联。中位随访25.6个月,共发生91例前列腺癌。校正年龄、遗传主成分及ATM/BRCA等罕见致病变异后,结果显示每增加1个T等位基因,前列腺癌发病风险升高3.38倍(HR=3.38,p=3.92×10⁻¹⁰),效应量与ATM等罕见致病变异相当。研究证实该非洲血统特异性变异为前列腺癌关键风险因素,应纳入基因检测panel,助力精准风险分层,消除种族健康差异。
摘要:6570
作者:Alex.Bataller, The University of Texas MD Anderson Cancer Center
题目:Whole genome sequencing to identify novel, clinically relevant findings missed by standard of care for patients with myelodysplastic syndrome.
本回顾性研究纳入43例MDS患者样本,通过两阶段验证全基因组测序(WGS)的检测效能。结果显示WGS灵敏度可达94%~100%,可完全覆盖传统标准检测的所有变异。同时在39%患者中检出21个传统方法遗漏的高临床价值变异,包含MECOM重排、KMT2A-PTD、TP53及RUNX1关键位点缺失等高危预后变异。证实WGS可一站式完善MDS基因组图谱,有效提升疾病精准诊断与风险分层能力。
摘要:7019
作者:Rui.Liu, Geneseeq Research Institute
题目:FragmentiaAI–Lymphoma: A cfDNA language model for lymphoma detection using ultra-low-passWGS.
本研究开发Fragmentia AI–Lymphoma模型,基于超低频全基因组测序(ULP-WGS)捕获cfDNA片段组学特征(GC含量偏差、异常片段分布),实现淋巴瘤无创检测。模型在训练队列(389 例)AUC达 0.943,独立验证队列(390 例)AUC为0.944,95%特异性下灵敏度 0.889;测序数据量降低3倍仍保持AUC>0.94的稳定性能,无需依赖驱动突变,为淋巴瘤筛查与监测提供低成本、高可及性的新方案。
摘要:7555
作者:Hyunsoo.Cho, Seoul National University Hospital
题目:Extrachromosomal DNA as a shaper of aggressive transcriptional states in multiple myeloma.
本回顾性研究纳入904例初治多发性骨髓瘤患者,通过全基因组测序解析染色体外 DNA(ecDNA)的临床意义。研究发现ecDNA阳性率为3.1%,这类患者总生存期显著缩短(HR=2.15,P<0.001),为独立不良预后因素;ecDNA高频扩增MYC、BCMA等癌基因,驱动增殖与代谢通路过度激活,证实ecDNA是骨髓瘤中被忽视的高危标志物,为疾病风险分层与治疗靶点开发提供了新方向。
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