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Cell Stem Cell丨Yamanaka团队揭示eIF4G2调控成体小肠干细胞命运

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在发育、应激反应和细胞再生过程中蛋白质翻译起始过程会被重新编程,并可通过选择性翻译快速重塑细胞状态。eIF4G2是非经典eIF4G家族成员,参与携带结构化5′ UTR及上游开放阅读框uORF)等特征性元件的mRNA的选择性翻译,但由于Eif4g2基因敲除小鼠存在胚胎致死性,其在成体组织中的生理功能仍不清楚。

近日,来自美国格莱斯顿研究所的Shinya Yamanaka研究团队在Cell Stem Cell上发表题为eIF4G2-mediated selective translation of chromatin regulators safeguards adult intestinal stem cell identity and differentiation的文章,发现eIF4G2对于成体小肠上皮细胞身份的维持至关重要,其缺失会导致胎儿样重塑,并通过核糖体图谱分析鉴定出染色质调控因子(CREBBP和EP300)存在选择性翻译缺失,导致KAT3丰度降低和整体组蛋白乙酰化水平下降,驱动了位点选择性增强子重塑,表现为成体ISC/Wnt-Notch元件丢失和富含TEAD的胎儿位点激活。


研究人员首先构建了他莫昔芬诱导型全身性Eif4g2基因敲除小鼠,发现在敲除Eif4g2后小鼠出现显著的肠道表型,表现为为杯状细胞和潘氏细胞减少,因此他们将后续研究聚焦于小肠。进一步研究发现全身性eIF4G2缺失会导致肠道干细胞(ISC)耗竭、损害分泌分化并增加隐窝细胞死亡,而增殖亚群和肠上皮细胞则相对得以维持。单核多组学分析显示,Eif4g2缺失的隐窝中,ISC特征基因下调,而胎儿样逆转程序(在损伤、应激或特定情况下,细胞逆转其成体身份,重新激活原本只在胎儿发育阶段表达的基因网络,从而获得类似胎儿祖细胞的表型和再生能力)及YAP靶基因特征富集,提示干细胞状态发生根本性转变。并且这种胎儿样逆转并非短暂应激反应,而是可持续数月,表明eIF4G2是维持成体ISC身份的关键因子。

接下来他们利用小肠类器官模型发现,Eif4g2缺失并不影响整体蛋白质合成速率,而是通过翻译效率(TE)的选择性调控发挥作用。Ribo-seq鉴定出数百个TE显著降低的eIF4G2依赖性转录本,这些mRNA普遍具有更长的5′UTR和更高的uORF丰度。富集分析显示,这类转录本富含染色质与表观遗传调控因子,其中包括KAT3共激活因子CREBBP和EP300,并验证了Eif4g2缺失后CREBBP/EP300表达下降,伴随全局性H3K18和H3K27乙酰化水平降低。进一步分析显示,Eif4g2缺失导致H3K27ac和KAT3蛋白从ISC相关增强子上解离并重新分布至胎儿样/再生性元件。这种表观重塑伴随着ISC特异性转录程序(Wnt-Notch通路)的失活和YAP/TEAD依赖的胎儿样程序的激活。使用CREBBP/EP300特异性抑制剂处理野生型类器官,可高度重现Eif4g2缺失导致的囊变形态、基因表达谱变化及胎儿样特征,进一步证实KAT3活性下降是介导该表型的核心下游事件。并且源自胎盘的肠类器官(胎儿球体)在Eif4g2缺失后虽然同样出现KAT3减少和乙酰化水平下降,但其能耐受这些改变并长期存活,提示成体与胎儿上皮具有不同的染色质基线状态与增强子依赖性,成体ISC高度依赖eIF4G2维持的KAT3活性来保持身份,而胎儿上皮本身就处于YAP高活性的再生潜能状态,对KAT3抑制具有更强的缓冲能力。


总的来说,这项研究揭示了eIF4G2通过选择性翻译剂量敏感的表观遗传调控因子,维持成体肠道干细胞特异性增强子活性与细胞身份将选择性翻译与表观遗传调控在干细胞命运决定直接联系起来

原文链接:https://doi.org/10.1016/j.stem.2026.04.006

制版人: 十一

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