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流感病毒拮抗宿主天然免疫的全新机制——对SARS-CoV-2等新兴病毒与宿主互作研究的启示

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L ncRNAs 是一类长度超过200个核苷酸、且无蛋白编码能力的RNA分子。 全面理解调控IAV复制的 lncRNA s 及其潜在机制 , 对于 鉴定 新型抗病毒药物靶点至关重要 。研究表明, IAV 感染可 诱导 部分 lncRNAs 的表达以抑制病毒复制, 这类 lncRNA s 包括lncRNA-01615、lncRNA-155、lncRNA-45、lncRNA-61、lncRNA-AVAN、lncRNA-GBP1P1、lncRNA-IFITM4P、lncRNA-ISG20、lncRNA-ISR、lncRNA-IVRPIE、lncRNA-LINC01197、lncRNA-LINC02574、lncRNA-PINK1–2 : 5、lncRNA-RDUR、lncRNA-RPS6P3和lncRNA-SAAL ,它们构成了宿主的 自我防御机制 。有趣的是, 具有促进 IAV复制 功能 的lncRNA-NRAV、lncRNA-AROD和lncRNA-THRIL 在病毒感染后表达下调,这可能是宿主应对病毒感染的 另一 种 自我保护反应 。值得注意的是,尽管宿主可通过调控 lncRNAs 表达激活抗病毒免疫,但越来越多的证据表明, IAV 能够 劫持 部分 lncRNAs 以增强自身复制。此类 lncRNAs 包括 lncRNA-ACOD1、lncRNA-IPAN、lncRNA- MxA 、lncRNA-NSPL、lncRNA-PAAN、lncRNA-PCBP1-AS1、lncRNA-PSMB8-AS1、lncRNA-TSPOAP1-AS1、lncRNA-USP30-AS1和lncRNA-VIN。 然而, IAV 通过抑制 lncRNAs 介导的抗病毒防御、进而 拮抗 宿主免疫并 促进自身 复制的分子机制, 此前仍未被系统阐明 。

近日,International Journal of Biological Macromolecules期刊 在线发表了题为IAV inhibits the host antiviral defense mediated by LncRNA-LRIR to enhance viral replication的 研究成果 。该研究揭示了甲型流感病毒( Influenza A Virus, 简称 IAV)拮抗宿主抗病毒免疫的全新分子机制,阐明 IAV 可通过抑制宿主长非编码 RNA ( Long Non-Coding RNAs ,简称 L ncRNAs ) 的 表达、削弱其介导的抗病毒 防御 以实现免疫逃逸并促进自身复制 , 丰富了对IAV拮抗宿主天然免疫分子机制的认知 , 为 新型抗流感药物 的研 发提供 全新靶点 与理论支撑 。



团队 总结 了IAV 与宿主互作 网络的研究进展,包括IAV与宿主 lnc RNA s 之间的相互作用 。为进一步探讨 lnc RNA s 在IAV感染中的作用, 团队 使用 流感病毒 WSN 毒株感染 A549 细胞,并在感染 12 小时后提取总 RNA 进行 全转录组测序 。 数据分析显示,感染 12 小时后 , 共有 2735 条 lncRNA s 显著 下调,5289 条 lncRNA s 显著上调 ( foldchang e >2,p<0.05) 。 从中选取 8 条下调及 14 条上调的 lncRNAs 进行热图与火山图分析 。 这22条 lncRNAs 在WSN感染A549细胞后呈现极显著的差异表达,提示其可能在IAV感染过程中介导包括 调控 病毒复制在内的多种生物学功能。随后,研究采用 qRT –PCR对这些 lncRNAs 的差异表达进行验证。为快速筛选参与调控IAV复制的 lncRNAs ,将针对上述 lncRNAs 的siRNA转染至接种于24孔板的A549 细胞,随后进行WSN感染,并通过 空斑 实验 测定病毒滴度。结果显示,使用siRNA-1 干扰 LncRNA-ENST00000514933 可显著 促进 IAV复制,且调控作用 最为突出。 进一步功能实验证实,该lncRNA的 抗病毒活性 主要依赖于258至381 nt 和38-97 nt 的区域 , 其可直接抑制IAV基因组的复制与转录。 然而, IAV 在感染过程中可主动抑制该lncRNA的表达, 削弱其介导的抗病毒防御功能, 为自身高效复制创造条件 。

SARS-CoV-2与IAV之间有许多相似之处 ,例如: 第一,两者同为 有包膜的单链RNA 病毒 ; 第二,两者都可以导致呼吸道感染, 且肺脏为两者共同的主要靶器官,A549 细胞为两者共同的常用细胞模型 ; 第三,IAV与SARS-CoV-2感染后,宿主RIG-I、MDA5、TLR3和TLR7等模式识别受体能够有效识别 vRNAs 并激活NF-κB、IRF3、IRF7等转录因子和JAK-STAT信号通路以此启动抗病毒天然免疫应答 ; 第四,IAV与SARS-CoV-2感染后均能够靶向抑制模式识别受体、信号蛋白分子、转录因子和干扰素受体介导的信号转导进而抑制干扰素及下游ISGs的表达 , 以此发挥拮抗宿主天然免疫的作用 ; 第五,两者均存在跨宿主传播的风险并能引起急性肺损伤、多器官衰竭,其严重危害公共卫生安全 ; 第六,作为单链RNA病毒,抗原变异和毒力变异在两者跨宿主传播过程中均可发生 ; 第七,目前均可通过反向遗传技术快速获得拯救病毒。 鉴于IAV 具有相对系统的理论体系 且与SARS-CoV-2有 诸多相似之 处 , 其 有望成为除 冠状病毒科成员之外,对SARS-CoV-2 研究最具参考价值的新标杆。此外, IAV研究成果可以为SARS-CoV-2与宿主互作的研究思路提供重要借鉴, 其中 包括 参与调控 SARS-CoV-2 复制的宿主生物分子的鉴定 。

自 COVID-19 疫情暴发以来已6 年有余,然而 , lncRNAs 调控SARS-CoV-2复制及其相关机制的研究报道甚少 。 鉴于此, 总结了 一 些关于病毒- 宿主相互作用的观点,期 望能加速SARS-CoV-2与宿主 lncRNAs 相互作用的研究进程。简而言之,核心思想在于 鉴定 调控 SARS-CoV-2 复制的 lncRNAs 及其调控机制。 本研究中采用siRNA干扰策略实现关键 lncRNAs 的快速初筛,有效缩短了候选分子的鉴定周期,亦可为SARS-CoV-2相关研究提供重要参考 。 除 复制周期与抗病毒信号通路 外 ,lncRNA调控SARS-CoV-2复制的分子机制是否与 宿主限制因子、 宿主依赖因子、其他非编码RNA(通过海绵机制)、微肽、自噬、细胞凋亡、代谢重编程及应激颗粒形成相关,仍是未来亟待解答的科学问题。而SARS-CoV-2是否能够通过削弱lncRNA介导的抗病毒防御来促进病毒复制,也值得深入探究 。 对于未来未知新兴病毒,可借鉴 以上 总结的 lncRNAs 筛选与分子机制的探究思路 等 ,快速开展其与宿主 lncRNAs 的互作研究,为新 兴 病毒的抗病毒策略研发奠定理论基础 。


聚焦于IAV复制周期的抗病毒药物靶点图谱

原文链接:https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2025.146665

制版人:十一

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