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Cell | 维生素B3:拯救致命神经发育疾病的“神奇营养素”

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在19世纪末,维生素缺乏症曾是威胁人类健康的重大隐患,催生了“维生素猎人”时代的到来。如今,维生素补充剂随手可得,但我们却面临一个新问题:哪些遗传疾病恰好可以通过特定维生素来治疗?这个看似简单的问题,却一直缺乏系统性的解答。营养素与基因之间的交互作用构成了人体健康的微观基础,而维生素作为关键的酶辅因子,其在特定遗传背景下的治疗潜力亟待挖掘。

近日,发表在《Cell》期刊上的研究中,美国格拉德斯通研究所和Arc研究所的Isha H. Jain团队完成了题为《Vitamin B2 and B3 nutrigenomics reveals a therapy for NAXD disease》的研究,建立了一种营养基因组学筛选框架,系统性地鉴定出可通过维生素B2和B3治疗的遗传疾病。


研究团队首先在K562细胞中进行全基因组CRISPR筛选,在不同维生素B2和B3浓度条件下培养敲除细胞库,通过MAGeCK算法确定哪些基因敲除导致细胞在维生素缺乏条件下适应性下降,而高浓度维生素能够挽救这一表型。将筛选结果与已知单基因疾病数据库交叉比对后,研究人员发现了数十种可能对维生素B2或B3补充治疗响应的疾病基因。

在维生素B2筛选中,团队验证了已知的核黄素转运蛋白SLC52A2和FAD合成酶FLAD1,其突变分别导致Brown-Vialetto-Van Laere综合征和核黄素反应性代谢性肌病。更有趣的是,他们发现GPX4缺乏对维生素B2浓度高度敏感——使用GPX4抑制剂RSL3处理细胞后,细胞存活率强烈依赖B2水平。在神经元特异性GPX4敲除小鼠模型中,维生素B2缺乏饮食加速了运动功能衰退,表明B2水平可修饰GPX4相关疾病的严重程度。

转向维生素B3筛选,NAXD成为最引人注目的候选基因。NAXD编码一种“校对酶”,可将有毒的NADHX代谢物转化回NADH。研究团队构建了Naxd敲除小鼠模型,这些小鼠出生时看似正常,但迅速出现生长迟滞,出生后0-5天内死亡。病理分析显示,敲除小鼠大脑皮层和纹状体区域出现神经炎症和细胞死亡,皮肤也出现鳞屑样表型。代谢物检测发现,所有检测组织中各种形式的NADHX显著积累,而在对照组织中几乎检测不到。值得注意的是,只有在出现明显病理表现的脑和皮肤组织中,NAD(H)显著耗竭。


为回答膳食维生素B3是否能改变NAXD疾病进程,研究人员进行了饮食干预实验。将杂合子交配的孕鼠置于维生素B3缺乏饮食后,约70只后代中未观察到任何敲除小鼠出生,提示子宫内死亡。相反,从出生当天开始每日腹腔注射大剂量维生素B3(750毫克/公斤),敲除小鼠与对照小鼠几乎无法区分,寿命延长超过40倍,体重、神经病理学等各项指标均得到显著改善。

半靶向代谢组学分析揭示,Naxd敲除小鼠脑中丝氨酸和磷酸丝氨酸显著耗竭,血浆中丝氨酸水平同样降低。丝氨酸生物合成的限速酶PHGDH正是NAD依赖酶,其突变临床表现与NAXD疾病相似。进一步实验表明,NADHX可直接抑制PHGDH活性,且呈剂量依赖性。空间代谢组学显示,维生素B3治疗后,全脑范围内环状ADP-核糖、丝氨酸和谷胱甘肽水平得到恢复。

单核RNA测序分析揭示了脑内皮细胞和周细胞是NAXD缺乏中最受影响的细胞类型,这些细胞表现出丝氨酸生物合成通路的上调和ATF4介导的整合应激反应激活。内皮细胞还呈现强烈的凋亡信号特征,而每日维生素B3治疗几乎完全恢复了这些转录变化。从原代脑内皮细胞的代谢组学分析也证实了丝氨酸、谷胱甘肽和核苷酸等一碳代谢相关代谢物的耗竭。

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