陕西
转座子（Transposable elements，TEs）是真核生物基因组的主要组成部分，也是遗传变异的重要来源。然而，不同物种间，同一物种的不同群体间，不同个体间，甚至不同细胞间，转座子的数量往往都存在显著的差异。因此，“转座子数量之谜”（TE abundance enigma）是一个基础但也是更本质的生物学问题，能为理解转座子的作用提 供关键视角和理论框架。
近日，中国科学院植物研究所郭亚龙研究组受邀在国际权威期刊Trends in Genetics上在线发表了题为“The enigma of transposable element abundance: lessons from Arabidopsis”的长篇综述，该文章全面总结归纳了驱动“转座子数量之谜”的多种因素，且对未来的研究方向进行了深入地思考，为转座子的研究提供了新的视角和新的方向。
该综述首先阐述了转座子的转座具有“双刃剑”属性，既能促进适应性进化，也能对宿主产生有害影响。基于转座子在基因组上的分布，群体中的频谱，以及适合度分布三个方面的证据表明其有害性。其次，该文章重点强调了遗传漂变、群体历史、转座速率、重组率、连锁选择和“搭便车”效应对转座子数量变化的影响。在此基础上，文章进一步总结了遗传、表观和环境因素如何调控转座子的沉默与激活，最终导致其数量差异。最后，该综述将视角聚焦至能够逃脱宿主抑制、重激活的转座子，这些转座子被称为活跃性转座子（active TEs），活跃性转座子也是转座子数量差异最主要的贡献者之一，文章系统地总结了活跃性转座子的特点，并深入探讨了其鉴定方法以及未来的应用潜力。
综上，该综述围绕“为什么不同物种、群体或个体的转座子数量有差异”这一核心问题，以模式植物拟南芥为主线，并与其他代表性物种（水稻、果蝇和人类等）进行比较，从群体遗传、遗传调控、表观修饰、环境响应和活跃性转座子等多个维度，系统解析了“转座子数量之谜”的形成机制，既具有模式生物研究的深度，又体现出跨物种归纳的广度，为转座子的理解和应用指出了新的视角和新的方向。
“转座子数量之谜”。A. 转座子的有害性和有益性；B. 决定转座子最终命运的群体过程；C. 转座子转座的调控因素；D. 活跃性转座子的表征、鉴定方法以及应用。
中国科学院植物研究所博士生杨龙龙为该论文的第一作者，郭亚龙研究员为通讯作者，硕士研究生李屹和助理研究员牛小敏也参与了该工作。该工作得到了国家自然科学基金与国家重点研发计划项目资助。
论文链接：
https://doi.org/10.1016/j.tig.2025.12.007
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