广东
近日，河南省农科院蔬菜研究所与河北农业大学园艺学院等国内外10多家单位合作在《Science》期刊上发表题为“Gapless pangenome analyses reveal fast Brassica rapa subspeciation”的研究成果。河北农业大学为第一完成单位，河南省农科院蔬菜研究所为第二完成单位。河北农业大学马卫教授为论文第一作者，河南省农科院魏小春研究员为共同第一作者。河北农业大学赵建军教授、马卫教授和洪益国教授，河南省农科院原玉香研究员，比利时根特大学Yves Van de Peer教授为共同通讯作者。
研究团队通过对1720份白菜种质进行重测序，精选7个亚种11份“诸侯”代表性材料进行端粒到端粒（T2T）完整基因组组装，并识别出110个着丝粒，同时挖掘到5个与物种形成和分化密切相关的着丝粒特异卫星重复序列。在此基础上，结合31份白菜基因组构建泛基因组，系统解析了着丝粒重塑与大规模结构变异对白菜亚种快速分化的共同作用；并通过泛基因组关联分析与突变体功能验证，锁定控制叶球形成的关键基因BrLH1，将具体亚种的形成与泛遗传变异直接关联起来，为理解被子植物实现快速多样化提供了基因组学支撑。
该研究从基因组、泛基因组和泛遗传学三个层面系统刻画了白菜亚种快速分化的遗传基础，把被子植物“快速扩张”的经典问题研究具体落实到一个肉眼可见的演化框架之中；通过构建完整着丝粒图谱，揭示了卫星重复、着丝粒动态与结构变异在芸薹属物种演化中的关键作用，加深了对芸薹属基因组起源与分化顺序的认识；同时，这一系列高质量图谱与分析体系，也为今后在芸薹属乃至更广泛十字花科作物中开展功能和演化研究提供了研究范例。
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