祝贺！黄三文团队

近日，中国农业科学院公布了2025年度重大科学发现。其中，中国农科院基因组所“马铃薯基因组学启发物种起源研究与设计育种”入选中国农业科学院2025年度重大科学发现。

该成果从基因组学层面系统解析了马铃薯单倍型图泛基因组、杂交起源机理与抗病基因进化规律，阐明了创新性状块茎形成机制，并进一步提出抗性基因理性设计与理想单倍型育种策略。

2025年1月23日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）黄三文团队在《自然（Nature）》期刊上发表题为“Leveraging a phased pangenome for haplotype design of hybrid potato”的研究成果。该研究构建了首个完整解析马铃薯单倍型的泛基因组，首次系统揭示了无性繁殖植物的基因组特征，并在此基础上提出了理想单倍型育种新策略，通过组合不同品系的基因组片段，可以最大限度减少自交系中的有害突变，为高效培育杂交马铃薯提供了全新思路。

2025年7月31日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）黄三文团队联合中外科研团队在《细胞（Cell）》期刊上发表题为“Ancient hybridization underlies tuberization and radiation of the potato lineage”的研究成果。该研究首次揭示了马铃薯组的杂交起源、薯块形成和辐射分化，研究发现，马铃薯组起源于900万年前番茄组和类马铃薯组的一次古杂交事件，杂交产生了新器官（薯块）。该研究是“优薯计划”的又一重大突破，为马铃薯遗传育种提供了全新的理论视角。

2025年10月30日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）黄三文团队与南京农业大学植物保护学院/农林生物安全全国重点实验室董莎萌团队合作，在《自然（Nature）》期刊上发表题为“Plug-in Strategy for Resistance Engineering Inspired by Potato NLRome”的研究成果，为解决这一全球性难题提供了一个新方案。该研究构建了马铃薯抗病基因资源库，揭示了识别和辅助两类抗病基因在序列和功能上的分化特征，并阐明了它们与具有不同进化潜力的病原菌之间的协同演化规律。利用比较和演化基因组学，研究团队挖掘出三个新抗晚疫病基因，并在对其抗病机理的深入解析基础上提出了“Plug-in（插件式）”抗病育种新策略，为培育持久抗病的马铃薯品种开辟了全新路径。