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巧克力属于进口食品类，其清关流程需满足食品进口的特殊监管要求，核心围绕资质备案、单证准备、口岸申报查验、检验检疫等环节，同时要注意标签合规和成分检测等关键要点，具体流程及注意事项如下：
清关前准备
完成资质备案：境内进口商需先办理进口食品化妆品进出口商备案，且必须持有《食品经营许可证》；境外巧克力生产企业要按规定在华完成注册，注册编号需标注在内外包装上。若为有机巧克力，需准备对应有机认证；转基因巧克力则要提前办好农业部转基因生物安全证书。

明确归类并备齐单证：先确定巧克力对应的 HS 编码，比如块状非夹心巧克力是 1806.3200，夹心巧克力是 1806.3100，不同类别税率不同。再备好贸易合同、商业发票、装箱单、提单等基础单证；还要获取官方签发的原产地证和卫生证书，卫生证书需标注生产企业信息及产品批次号；首次进口的巧克力，还需准备微生物、重金属等项目的检测报告。
合规设计中文标签：标签要符合 GB 7718 标准，需包含品名、配料表、净含量、生产日期、保质期、进口商信息等，中文品名字体要大于外文。同时必须标注致敏物质，像含乳制品、坚果的巧克力需明确标注，避免因标签问题延误清关。
到港核心清关操作
换单与报检：进口商或代理凭正本提单到船公司换取提货单，随后提交《入境货物报检单》及各类备好的单证办理报检手续，商检局审核后会出具检验检疫相关通知书。该环节半天到 1 天可完成，需核对提单信息与备案信息一致。
海关申报与缴税：通过单一窗口提交申报信息，注明可可含量、是否含乳制品等申报要素。海关审核单证和申报内容，确认税号、价格等无问题后，生成关税和增值税缴款书。企业及时缴清税费，单证无误的情况下 1 - 2 天可完成该环节，若申报价格存疑，可能需要价格磋商，耗时会相应延长。
查验与抽样检测：海关会开箱核对货物包装、数量等是否与申报一致；检验检疫部门除了核查标签、包装，还会抽样送检微生物、添加剂、污染物等项目。常规查验 1 天内可完成，实验室检测周期通常为 5 - 7 个工作日，紧急情况可申请加急。
放行及后续操作
获取凭证并放行：检测合格后，商检局签发《卫生证书》，这是巧克力合法销售的关键凭证。此时若税费已缴清且无其他异常，海关会签发放行凭证。若检测不合格，货物需面临退运或销毁处理。
提货与后续留存：企业凭放行凭证结清港口相关杂费后提取货物，如需冷链运输需提前安排。后续要将《卫生证书》、海关申报单、检测报告等文件留存，同时把产品批次号录入海关追溯平台，以备后续核查。