晶泰科技王渊：当药物发现突破“经验主义”局限，源头创新驱动“精准制药”新范式 | BIO-FORUM 2025

从需要63步合成、拥有19个手性中心的复杂天然产物，到利用人工智能在数以亿计的化学空间中精准锁定候选药物分子，晶泰科技高级副总裁、小分子药物发现与技术主管王渊博士的科研生涯，仿佛是新旧药物发现范式更迭的一个缩影。

在2025上海国际生物技术与医药研讨会的创新药物转化研究论坛上，这位兼具深厚传统药学功底与前沿技术视野的科学家，向我们展示了人工智能正如何以颠覆性的方式驱动源头创新，破解小分子药物发现的百年难题，让创新药物的诞生之路变得更短、更智能、更充满无限可能。

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01

从“经验摸索”到“智能导航”：

ai重绘药物发现新路径

传统的药物发现，始于实验室中化学家基于经验的漫长摸索，如同在茫茫大海中依靠经验与运气“捞针”。他们依靠深厚的专业知识与直觉，设计、合成并测试数以万计的分子，这条路径不仅耗时，且结果充满不确定性。

“过去这完全依赖科学家的经验来设计与筛选化合物。这个过程涉及海量数据，仅靠人脑分析是远远不够的。”王渊在专访中坦言。ai的介入，正将这一过程从“经验驱动”升级为“数据与智能驱动”，为研究者开辟出一条研发新路径。

在论坛演讲中，王渊详解了这条新路径的运作方式：首先，利用ai分子生成技术（xmolgen），可在虚拟的化学空间中瞬间创造出海量潜在分子，极大地拓展了探索的边界。随后，通过智能筛选与精准的自由能微扰（fep）计算，如同一套精密的“筛选系统”，能够迅速将目标范围从“天文数字”收敛至数百个乃至几十个最具潜力的候选分子。

“这意味着，我们可以在极短时间内，以最小代价合成出最关键的目标分子进行验证。”王渊解释道。他以gpx4抑制剂为例，ai平台从10的14次方个初始虚拟分子出发，经层层智能筛选，最终仅提名150个化合物进行实体合成，并成功从中快速锁定3个苗头分子。“这不仅大大压缩了研发时间，更重要的是，源头创新的效率被极大提高了。”

这其中，预测模型的精准度至关重要。王渊在采访中提到了一个关键指标“r平方”，它衡量的是预测与现实的吻合度。“当模型的r平方值达到0.7或0.8时，其预测能力就已远超我们预期。这能让我们在研发的起点，就对前进的方向拥有把握。”

02

解放智慧双手：

当ai“大脑”遇见自动化“臂膀”

如果说ai是重塑药物发现路径的“超级大脑”，那么自动化实验室就是不知疲倦、精准执行的“钢铁臂膀”。二者的结合，构成了晶泰科技智药新范式的另一大支柱。

“我们建立了一个大规模的自动化合成平台，在深圳、上海各有100多台自动化工作站。”王渊在演讲中展示了一段视频，展示了机器人手臂如何高效、准确地执行复杂的化学合成操作。这套系统能将化学家从大量重复、繁琐的体力劳动中解放出来。

更令人惊叹的是，ai不仅指挥设计，还能指导“如何制作”。通过收集和分析海量化学反应数据，ai模型可以预测在特定条件下化学反应能否成功，其准确度甚至超过了经验丰富的化学家。王渊分享了一组对比数据：对于某些难以成功的反应，ai预测的准确度高达81%，而人类化学家由于“过于自信”，准确率反而低得多。

“将来，一个化学家进入实验室，他不需要去查很多文献资料，就可以问ai：‘这几个反应，条件应该怎么做？”王渊描绘了这样一幅未来图景。这意味着，专家的智慧将更多地投入到解决最前沿、最棘手的科学难题上，而不是耗费在常规操作和信息检索中。

王渊在采访中将这一愿景进一步具象化：“晶泰拥有全自动的化学合成实验室，并正在应用ai agent（ai智能体）来指挥整个合成流程。这能将化学家从繁琐重复的工作中解放出来，让他们能集中精力攻克更疑难的合成问题。” 这不仅是效率的提升，更是科研人力资源的一次深刻解放与升级。

03

跨越“经验陷阱”：

数据驱动如何催生源头创新

评估ai的价值，人们常关注它缩短了多少时间，降低了多少成本。但在王渊看来，一个更关键的指标是“化合物的新颖性”。

“药物发现需要探索广阔的化学空间，在此空间中产生的分子才更具新颖性和代表性，成功几率也更高。”他在采访中强调。ai的强大之处在于，它能以一种纯粹数据驱动的、无偏见的视角，帮助科学家跨越固有的“经验陷阱”，发现前所未有的全新药物结构。

他在演讲中分享的smarca2/4靶点案例，生动地诠释了这一点。在分析现有专利文献时，王渊团队发现，已报道分子与靶点的关联性很差，暗示着前人认定的药物作用位点可能并不准确。他们利用自身的计算和实验能力，重新解析了蛋白结构，果然发现了一个全新的结合位点。

“你可以看到这些应用能非常快地帮助我们走出原有的经验陷阱。”王渊说。基于这一全新发现，利用ai分子生成技术，团队迅速设计出了完全跳出原有化学空间的全新化合物，在短短一两个月内就完成了关键突破。

这种“数据驱动”的创新模式，正在从根本上改变药物发现的思维方式。它不再仅仅依赖于对已有知识的归纳和延伸，而是能够主动探索未知，从海量数据中挖掘出人类智慧难以直接洞察的全新规律。

“我希望能看到ai agent（ai智能体）被大规模应用。”谈及未来五到十年的愿景，王渊在采访中描绘了这样一幅图景，“将能够通过ai智能自主完成的研发过程，整合进一个自动化的、具备自我学习能力的系统。”它的意义远不止于解放科学家的双手，更在于与我们人类的智慧形成深度对话与协同进化，共同面对那些悬而未决的复杂生物学难题。”从跟随经验到驾驭数据，从优化已知到创造未知，这一转变正推动药物研发迈向一个由智能深度驱动的新纪元。

从哈佛实验室里挑战最复杂天然产物合成的化学家，到引领ai驱动药物发现的产业先锋，王渊博士的经历本身，就是一场从传统到前沿的“双向奔赴”。在演讲与采访中，他没有描绘遥不可及的科幻图景，而是用扎实的数据和成功的案例，向我们证明：ai制药已不再是概念，它正作为一种高效且极具创新力的工具，深刻地融入新药研发的血脉之中。

在上海这片生物医药创新的热土上，以晶泰科技为代表的企业，正将算力、算法与自动化实验深度融合，构建起一套全新的药物研发“操作系统”，让“源头创新”变得可设计、可执行、可预期，并以此加速链动全球创新资源，为更多患者点亮从实验室通往万家灯火的希望之光。

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作者：朱文莹

上观号作者：上海科技