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炎性衰老找到真凶?不在炎性因子,而是线粒体脆弱的DNA!

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提到衰老和Y症,各位读者是不是马上想到了一个词:SASP(衰老分泌表型)。长期以来,我们都将衰老引发的慢性Y症问题,归咎于这些衰老的僵尸细胞,它们不断向外释放SASP,在我们的身体组织中四处煽风点火,把我们身体的内环境搞得乌烟瘴气。

这确实解释了是“什么”在传播Y症,但!“是什么”迫使这些衰老细胞释放了SASP? 这个分泌的行为,究竟是Y性衰老的病根,还是仅仅是Y性衰老症状?

就在昨天,来自Nature期刊的一篇研究,就给这个问题提供了一个关键线索,将Y症衰老的源头,直接指向了线粒体基因组(mtDNA)的稳定性失调!



失控的“传家宝”

那就先聊聊细胞里的“重要人物”—线粒体,它人称能量工厂,负责生产驱动生命活动的 ATP,同时也是代谢调控与信号传导的关键枢纽。

但如果要说线粒体中最独特的标志,还得是它在进化史上的奇特出身。它,曾是一个独立的细菌!直到被我们的细胞祖先吞噬“收编”,成了细胞里永久共生的小伙伴[2]。


图注:真核细胞与线粒体起源的两种假说:1、原始真核细胞形成后,再吞噬细菌演化为线粒体(红色箭头);2、古菌与细菌通过一次融合事件,同时形成了真核细胞与线粒体(紫色箭头)

也正因如此,线粒体至今还揣着一份来自远古的传家宝:线粒体DNA(mtDNA),这套小型的环状基因组独立于细胞核之外,编码着呼吸链(能量生产的核心)所必需的多种关键蛋白质。


然而,这份珍贵的mtDNA,在衰老面前却显得异常脆弱。研究发现,在衰老的细胞和年老小鼠的组织中,大量本应被严格限制在线粒体内部的 mtDNA,竟以碎片化的形式潜逃至细胞质中——这是它们本不应该出现的区域。

图注:红色为线粒体,绿色为mtDNA。在Mgme1-/-(Mgme1能维持线粒体基因组稳态)的细胞中,可以看到绿色的DNA(箭头所示)大量逃离线粒体的禁锢,四散在细胞质中

这是一个极其危险的信号。在正常生理状态下,细胞质中几乎没有游离的DNA存在,一旦出现,便会立刻被细胞的天然免疫系统视为外来入侵者(如病毒或细菌)的标志,从而启动防御模式。

但仔细琢磨一下,泄漏的mtDNA碎片……只是一个衰老引发的表象而已,那到底在它泄漏之前的更早源头,发生了什么?为了探明真相,我们还得返璞归真一波,从遗传信息的两大基本盘,DNA与RNA开始查起。



体内的豆腐渣工程

这俩可以说是核酸家族的亲兄弟了,不过构建它们的基本模块却截然不同:DNA使用高度稳定的脱氧核苷酸,而RNA则使用化学性质更活泼的核糖核苷酸。两者虽然只差一个羟基基团,却从根本上决定了DNA适合做长期遗传档案,而RNA只适合当短期信使。


图注:一个核苷酸是由磷酸基团+(脱氧)核糖+含氮碱基构成

所以你想,如果一个本属于RNA的rNTP,要是走错片场,不小心被错误地掺入DNA的队伍中的话,就会为整条DNA分子的断裂埋下致命隐患。而更扎心的是,这并不是小概率事件,随着衰老,这种走错片场的现象会在我们的体内批量发生,频率越来越高!

数据显示,在衰老的细胞和年老小鼠的组织中,负责将rNTPs转化为dNTPs的关键酶,核糖核苷酸还原酶(RNR)活性出现明显的降低。这直接导致细胞内正确的dNTPs严重短缺,rNTPs大量积压,rNTPs与dNTPs的比率急剧升高,细胞内核苷酸池出现严重失衡。


图注:在缺少能维持线粒体基因组稳态的基因Mgme1时,细胞中用于合成DNA的四种核心原料(dNTPs)的库存被严重耗尽(左4图)。并且,这种原料短缺打破了DNA原料(dNTPs)和RNA原料(rNTPs)之间的平衡,导致两者比率急剧升高(右4图)

这种失衡就为mtDNA的复制过程埋下了巨大的隐患。这就好比砌墙,好的原料(dNTPs)没几块,“劣质”的原料(rNTPs)却到处都是。在这种窘境下,DNA聚合酶犯错的几率大大增加,更频繁地把错误的rNTPs分子安装到正在合成的mtDNA链中去。


图注:在强碱性环境下,正常细胞的mtDNA(橙色曲线)结构依然能保持完整,形成一条清晰的条带。但来自基因敲除细胞的mtDNA(蓝色曲线)被掺入了大量错误的rNTPs,其内部充满了弱点,在同样的压力下断裂成无数的小碎片,形成了一片长长的模糊拖尾

而且,每一个被错误掺入的rNTP,都因其额外的羟基基团,在DNA骨架上形成了一个化学性质不稳定的断点。使得mtDNA变得异常脆弱,在复制压力或化学应激下极易断裂,出现mtDNA碎片化和泄漏现象。


图注:衰老是导致mtDNA结构脆弱的普遍原因:衰老细胞的mtDNA(蓝色曲线,Sen(IR))在强碱性环境下变得不堪一击,断裂成了无数的小碎片,形成了长长的模糊拖尾(左图)

还没完,这一损伤会直接激活细胞内非常经典的免疫通路——cGAS-STING[3]。这是细胞质DNA的主要监察机制,一旦检测到错位于细胞质中的DNA分子,该系统便会立即启动,清除这些潜在的威胁。


图注:cGAS-STING的工作流程如下:识别入侵→细胞生成信使→激活STING→发动反击

当脆弱的mtDNA碎片从线粒体泄漏到细胞质中时,它们便成为了cGAS-STING通路的目标,它会不加区分地将这些mtDNA碎片识别为危险信号。cGAS会与这些DNA碎片结合,从而激活下游的关键接头蛋白STING,点燃下游的Y症信号,引起一系列促Y基因的表达。


图注:(滑动查看)左侧热图显示,在Mgme1缺失的小鼠体内(Mgme1能维持线粒体基因组稳态),大量Y症相关基因表达升高,但在STING蛋白也被敲除后,其表达水平几乎完全恢复了正常(蓝色区域)

一边mtDNA持续泄漏,一边cGAS-STING长期激活,细胞不断产生、释放Y症因子,这就启动并维持了那种低度而持续的慢性Y症状态,即“Y症性衰老”。可以说,我们终于为这个曾经模糊的概念,找到了个有据可依的源头!

所以,如果dNTPs的缺乏是真正的起点,那么补充它的话,我们能否逆转整个衰老过程,修复一切?科学家们直接给衰老细胞补充了它们所缺的脱氧核苷(dNTPs)。结果嘛……立竿见影:

随着dNTPs的供应恢复,mtDNA的复制准确性与结构完整性均得到提升,DNA碎片泄漏随之停止,cGAS-STING免疫系统也归于沉寂。最终,由该通路驱动的衰老相关Y症表型(SASP)的表达被成功抑制。


图注:衰老细胞(红色实心柱)会表达大量的Y症因子(如CXCL1, IL8等),进入一种慢性Y症状态。然而,在补充了dNTPs后(红色条纹柱),Y症因子的表达也出现了降低

总之,本文表明,衰老相关的Y症通路,在理论上是可以通过靶向干预被“关闭”的!Y症性衰老,或许正在从一个由多种因素共同作用的复杂表型,转变为一个由上游代谢失衡所驱动的、具有清晰分子逻辑的因果事件……


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