生信必备技能--生信服务器集群

SXY CLOUD

2025

数信云服务器

迭代升级

福利大放送

数信云

数信云针对不同需求人群，提供多种生信服务器选择（单节点共享服务器，多节点服务器集群，单节点独享服务器）。

配套Rstudio、Jupyter、Singularity、预装大量常用工具和R包，提供丰富生信分析脚本服务。

智能“科研创作助手” 全程赋能，从数据分析到论文撰写，提供智能建议，提升科研效率与质量。

配备专业高效售后支持，保障科研无忧。包括但不限于软件安装、代码分析、代码报错等技术支持。

选择数信云：省心、高效、智能、高性价比的科研伙伴！

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PART

1

多节点服务器集群

SXY CLOUD

集群服务器

收费标准

cpu:112核、运行内存:512G、硬盘:2T

1897/年、3197/两年

cpu:112核、gpu:RTX4060、运行内存:1T、硬盘:2T

2997/年、5097/两年

cpu:112核、gpu:V100、运行内存:1.5T、硬盘:2T

4297/年、7997/两年

多节点集群服务器优点

PAET 01

1.独立的用户环境，拥有（sudo) 权限。

2.可以自由选择空闲节点切换（可利用资源更多）

3.预装上千种R包和常用工具

4.历史存档恢复

5.极速响应技术支持

6.SXY专用镜像

7.AI助手

不同配置使用场景

PAET 02

H1入门款：

适用于轻量级的基因组组装（基因组大小1-2G）、小样本的群体重测序 & 变异检测（1-100样本 30x深度）、bulk RNA-seq (1-30样本 30x深度)、~5w内的单细胞分析、宏基因组单个样本原始数据 10-50G（肠道宏基因组常见 15-30G / 样本，土壤样本可达 50G）

H2性能款：

一、基因组学分析

1. 基因组组装与注释

数据量：三代PacBio HiFi数据（500G-2T/物种，如植物基因组1-10G大小，覆盖度30-50x）；ONT超长读长数据（200G-1T/物种）。

适用场景：

可同时处理500G HiFi数据集（组装阶段单任务占60-80线程、500-600G内存），剩余资源可并行运行质量评估（QUAST）。

GPURTX 4060加速hifiasm的纠错和重叠群构建步骤，较H1提速30%-50%。

复杂基因组组装：如重复序列占比60%以上的植物基因组（如玉米、小麦），使用hifiasm（支持GPU加速）或Flye组装：结构注释：用BRAKER结合RNA-seq数据预测基因模型，可并行处理5-6个染色体的注释任务（单任务15线程、100-120G内存）。

对比H1优势：H1仅能处理小基因组（如细菌、真菌，<500M）的组装，且无GPU加速。

2. T2T基因组

数据量：超高深度HiFi+ONT数据（1-3T/物种，人类基因组需100x HiFi+50x ONT）。

适用场景：

用Telomerecat识别端粒序列，结合Canu补gap（单任务占70线程、600-700G内存）。

GPU加速DeepVariant进行高准确度变异检测（针对T2T基因组的复杂区域），较H1提速2倍，单样本变异检测提速2倍以上。

3. 泛基因组构建

数据量：10-50个个体的基因组数据。

适用场景：

用细菌或真核生物构建泛基因组，可并行比对10个个体的基因组到参考序列（单任务8线程、60-80G内存）。

GPU加速多序列比对（如ClustalOmega-GPU），50个基因组的比对时间从缩短40%以上。

4. 重测序与群体遗传

数据量：100-500个样本重测序。

适用场景：

群体SNP calling：用GATK GenotypeGVCFs合并100个样本的GVCF文件，可一次性处理，不用分批分染色体进行）。选择消除分析（如XP-CLR）：500个样本的基因型数据（VCF约50G），可并行计算，大大缩短项目时间。尤其适用于GWAS分析（大样本对内存需求高）。

5. BSA分析

数据量：2个混池（每个池30-50样本）。

适用场景：

用MutMap定位突变基因，可同时进行2个混池的比对和call snp，48小时内可出结果。

二、转录组学分析

1. Bulk RNA-seq

数据量：100-500个样本（每个15-30G，如肿瘤队列）。

适用场景：

用hisat2批量比对100个样本，可并行所有样本）。

2. scRNA-Seq

数据量：10-30个样本（每个10-50G，10x Genomics平台，1-2万个细胞/样本）。

GPU加速Seurat的UMAP降维（RunUMAP启用GPU）和scVI的深度生成模型训练，30万个细胞的聚类分析轻松搞定。

3. small RNA-seq

数据量：50-100个样本（每个5-10G，如miRNA测序）。

适用场景：

用Bowtie比对50个样本，可并行所有样本，结合miRDeep2定量，总耗时从H1的2天缩至12小时。

三、表观基因组学

1. DNA甲基化

数据量：50-100个样本（每个20-40G，如肿瘤甲基化图谱）。

适用场景：

高效完全大样本的比对，GPU加速MOABS的甲基化水平计算。

2. ChIP-seq/ATAC-seq

数据量：~100样本（每个10-20G，如多组织表观图谱）。

适用场景：

多样本表观图谱的构建，快速比对&call peak，

GPU加速计算。

3.Hi-C三维基因组

数据量：10-20个样本（每个50-100G）。

适用场景：

用Juicer处理20个样本的Hi-C数据，可并行样本，内存满足矩阵构建（无需拆分染色体），组装A/B compartments和TAD结构。GPU加速HiC-Pro的接触矩阵归一化（如ICE算法）。

该配置可支撑中小型实验室的全流程生信分析，从基础测序数据处理到复杂基因组学研究，以及对GPU有需求的项目。

H3全能款：

在H2项目的基础上有更多的样本，尤其适合做大样本群体遗传GWAS分析，追求卓越的性能体验，以及多人协作的便利性。

PART

2

单节点共享服务器

SXY CLOUD

单节点共享服务器

收费标准

cpu:72核、运行内存:512G、硬盘:500G

897/年、1697/两年

cpu:112核、gpu:RTX4060、运行内存:1T、硬盘:1T

1297/年、2297/两年

cpu:192核、gpu:A20

、运行内存:4T、硬盘:1T

2797/年、5197/两年

单节点共享服务器，主打高性价比。

A1款：适合刚开始入门的生信小白，做一些基础分析。

A3款：如果您的项目需要一定的图形处理能力，第二款就很合适。像涉及到一些需要图形加速的生信分析，比如蛋白质三维结构的可视化分析等，在保证性能的同时，价格也比较亲民。

A5款：适合处理大规模的生信数据，比如复杂的多组学数据整合分析、大规模的基因变异检测等任务，但高峰期任务需要排队处理，且不能占用太多资源。

PART

3

独享服务器

SXY CLOUD

独享服务器

收费标准

cpu:32核、运行内存:256G、硬盘:6T

897/月、4997/半年、7990/年

cpu:48核、运行内存:512G、硬盘:18T

1897/月、10997/半年、18970/年

cpu:112核、gpu:RTX4060、运行内存:1T、硬盘:24T

3697/月、21970/半年、36970/年

cpu:112核、gpu:V100、运行内存:1.5T、硬盘:36T

4697/月、27579半年、46970/年

性能优势

资源专属：独占服务器的 CPU、内存、硬盘等硬件资源。在进行大规模基因序列分析、蛋白质结构预测等复杂计算任务时 ，不会因其他用户占用资源而导致计算速度变慢，保障了运算的高效性和及时性。

稳定运行：没有其他用户干扰，服务器的性能表现稳定。在处理生信数据的长时间任务时，不会出现因资源争抢导致的程序中断或运行缓慢的情况，保证了数据分析的连续性和准确性。

VIP专属售后服务：提供7X24h专属的技术支持和售后服务，在遇到服务器故障、性能问题等情况时，能获得更及时、高效的解决方案。

定制服务：根据用户的特殊需求，可以提供定制化的服务方案，满足用户在不同场景下的个性化需求。

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