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Cell Rep Med丨刘志红团队绘就糖尿病肾病遗传图谱,解码关键遗传发病机制

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糖尿病肾病(Diabetic Nephropathy, DN)是2型糖尿病(Type 2 Diabetes, T2D)最常见的微血管并发症之一,也是全球终末期肾病(End-Stage Kidney Disease, ESKD)的首要病因,其发生 和 发展 均 受遗传因素 影响 ,但其关键遗传 致病 机制尚未得到 充分阐释 。

既往的糖尿病肾病( DN ) 遗传学研究多基于临床表型定义的糖尿病肾脏疾病(Diabetic Kidney Disease, DKD)队列开展。 但由于 DKD患者中常 合并 其他 类型 肾脏疾病,导致 研究 无法精准 解码 真正的DN遗传易感位点。此外,由于DKD队列缺乏精准的病理表型数据,对 已 发现的遗传变异与肾脏病理特征 之 间的 关联 , 及其在DN致病机制中的确切作用认识 存在 不足。 并且, 现有DKD遗传学研究 大 多在欧美人群中进行, 导致 相关研究成果难以直接应用于中国人群。

因此 ,亟需 开展 基于肾脏活检确诊的中国人群DN精准表型队列 的 遗传学研究 , 解析DN 真正的 遗传易感位点, 阐明其生物学意义, 并验证 关键位点的 致病 机制 ,从而 为理解DN发生发展 机理 ,制定 疾病防控 策略提供科学依据。

近日,东部战区总医院 ,国家慢性 肾病 临床医学研究中心 刘志红院士 团队 、上海交通大学医学院附属上海第六人民医院 贾伟平院士 和 胡承教授 团队、浙江大学良渚实验室 沈宁教授 团队 合作 在 Cell Reports Medicine 杂志上发表题为 Multimodal analysis stratifies the genetic susceptibility and reveals the pathogenic mechanism of kidney injury in diabetic nephropathy 的研究论文。 研究 联合国内12家单位,成功构建了目前最大规模、经肾活检 明确诊断 为DN的 精准表型 队列 。以此为基础, 绘制 了 中国汉族人群 DN患者遗传图谱, 发现了 10个新的DN 疾病 风险SNP位点 ;创新性的整合DN患者“基因型-肾脏基因表达谱-病理表型-临床表型”的多维度、多模态数据,全面 解析了 关键 致病遗传变异与 DN病理和 临床表型 的 关联 ,阐明其生物学意义 ; 揭示了 关键致病突变 加重 肾小管细胞 线粒体损伤促进DN发生发展 的关键 分子机制 。 这项 研究全面和系统的解读了 DN 的 遗传 发病 机制 , 为未来 制定 疾病 关键防控策略和精准干预手段奠定了重要的理论 基础 。

图1 : 研究流程图 。

精准表型 增强DN遗传 变异 识别效能

研究团队 为 了 最大程度降低临床表型定义的DKD队列中难以避免的 其他肾脏疾病的 干扰,采用了严格的临床与病理表型筛选方案 ,其中 DN疾病组 仅纳入经肾脏病理活检 明确 诊断的 DN患者,并排除所有其他肾脏疾病 ; 糖尿病对照组 ( T2D组 )则 筛选了 罹患2型糖尿病 10年以上,无微量白蛋白尿 且 肾功能正常的患者,并通过眼底 检查 排除了合并 糖尿病视网膜病变患者 ; 健康对照组 ( HC 组 ) 则 纳入无糖尿病及肾脏病病史的健康人群。最终, 该 研究共纳入2279例DN患者、3762例T2D患者和3970例健康对照者。 得益于这种严谨的表型分层策略, 该研究 将DN的遗传度由既往研究报道的10-12%提升至36.5-42 . 4%, 极大地增强了识别真正致病性DN遗传变异的能力 。

全面 系统 地 解析 了 DN遗传 发病 机制

研究 基于两阶段GWAS分析, 发现了 10个达到全基因组显著水平的DN遗传易感位点 , 且 新发现位点与既往DKD GWAS研究结果存在 显著 差异 ,不仅 提示中国汉族人群 可能 具有独特的DN遗传易感背景,也有力地支持了精准 表型 DN队列在揭示核心致病 位点上 的优势 。 研究首次利用DN患者,T2D不合并微血管病变患者以及正常对照患者的组间GWASs结果比较分析,证实了DN疾病发生主要取决于肾脏对于损伤的易感性。利用 GWAS Catalog 通路富集分析 ,揭示了 DN遗传易感位点 相关基因 显著富集于免疫系统调节及代谢相关通路 。 相关结果为全面系统解析 DN 遗传发病机制 指明了方向 。

多模态分析 阐释易感位点 生物学意义

研究团队 充分 利用 了 DN组患者拥有完整肾脏病理数据的独特优势,在初步通过FINEMAP确定5个 潜在致病性基因突变位点 的基础上,创新性地进行了 “ 基因型- 肾脏组织基因表达- 病理表型-临床表型”的多模态数据整合分析。分析揭示了与其他肾脏病理指标相比,这5个关键位点的基因型与肾小管间质纤维化和小管萎缩 ( IFTA )间 存在着最密切的关联。例如,携带rs75680863 (TCN2) 风险等位基因T的患者,其IFTA评分显著高于非携带者,且其肾小管间质 TCN2 基因表达水平也同步降低 。 由此可见, 多模态分析不仅从遗传关联的层面证实了肾小管损伤在DN发病中的核心地位,也为后续解析已鉴定遗传变异的致病机制提供了坚实的数据支撑 。

体内外研究解析 关键突变致病 机制

为了深度验证多模态分析筛选出的核心致病位点的生物学功能,研究团队聚焦 东亚人群高频携带(7.3%)的 TCN2 基因第2号外显子上错义突变rs75680863 ( c.230A>T, p.K77M ) 展开下游分子机制探索。通过构建 TCN2 基因 肾小管条件性 敲除小鼠及 TCN2 K77M点突变小鼠,并诱导其发展为糖尿病肾病模型,结合体外细胞实验, 揭示了 该基因突变会破坏线粒体结构稳定性与功能完整性,导致肾小管上皮细胞出现能量代谢障碍 ,加重高糖情况下 肾小管间质损伤并驱动DN发生发展 的分子机制 , 这为未来开发相关靶向干预手段提供了理论基础 。

研究意义:从 遗传机制 解析 到 疾病 精准 防控

(1) 为 DN 遗传机制研究提供精准 方向

研究 基于大样本精准表型 DN队列 的GWAS研究, 鉴定 了 10个新的DN风险SNP位点 , 并 开创性地绘制了 从遗传易感位点鉴定→ 肾组织基因表达 → 肾脏病理和临床表型的 全景图 谱 。结果 不仅填补了中国人群DN遗传数据空白,更为后续遗传机制研究提供了 高度可信的研究方向 。

(2) 为系统 解读 DN遗传 发病 机制提供框架

研究 通过 比较分析 DN患者, T2D 不合并 微 血管病变疾病对照以及正常人群 的组间 GWAS 结果 , 全面 解析 了 DN复杂遗传病因 ,并揭示了免疫炎症和代谢异常驱动DN发生发展的 遗传学基础 ,为 更加系统的 解读 DN 遗传发病 机制 提供了 框架。

( 3 ) 为 开发 DN 靶向干预 手段 提供依据

研究锁定 了 5个 关键潜在 致病 突变位点 ,并 首次证实 了 TCN2 ( p.K77M ) 这一关键 突变影响 线粒体功能 加重高糖情况下 肾小管 细胞损伤促进 DN进展 的机制 。 这 为靶向 TCN2 及其下游通路 开发 精准 干预手段提供了理论 依据 ,具有良好的临床转化价值 。

( 4 )为 制定 DN精准 防控 体系奠定基础

在本研究发现的 DN遗传易感位点 及其与临床和病理表型关联的基础上 , 未来有望 通过整合核心位点 、关键分子通路,以及患者 病理和临床表型数据, 构建 多层次和多维度的疾病发生和预后预测 模型, 从而 实现对 DN 疾病 发生及进展风险的 精准防控 。

综上所述, 本 研究 在全面系统的解析 DN 遗传 发病机制 的基础上, 为 制定疾病精准 防控 策略和开发 靶向 干预手段提供了重要支撑。

东部战区总医院 国家慢性肾病临床医学研究中心 刘志红院士、 上海第六人民医院贾伟平院士 和 胡承教授 、 浙江大学良渚实验室沈宁研究员 为论文的共同通讯作者。东部战区总医院蒋松、贾晗颖、金立、侯庆和良渚实验室博士后 Md. Asif Ahsan 为 论文的并列第一作者。

原文链接:https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S2666-3791(25)00322-2

制版人:十一

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