广东
近日
“深圳造”T1+基因测序仪
助力疾控系统
对4例基孔肯雅病毒样本
进行测序溯源
其测序覆盖度均高于99.9%
据悉，其中2例感染的病毒属于基孔肯雅东中南非型（ECSA分型），另外2例感染的病毒属于基孔肯雅亚洲型（Asian分型）。
深圳华大智造科技股份有限公司生物技术高级经理 王逸丛介绍， T1+基因测序仪 是全球首款可在24小时内产出Tb级别数据的桌面式测序仪，也是目前全球桌面式Tb级别基因测序仪中速度最快的机型之一，具有准确、快速和高通量的特点。
“值得一提的是，其 中1例极低病毒载量的样本，采用 T1+基因测序仪 进行宏转录组测 序也获得了全长序列，展现了面对突发疫情时， T1+基因测序仪快速、高通量的性能结合宏基因组测序方法的溯源兜底能力。” 王 逸丛说。
王逸 丛 表示，在此轮基孔肯雅热流行中，疾控工作人员拿到样本上机后，24小时内就完成了测序任务，得到全基因组序列后，比对确定样本中的病毒是否为同一来源，就能为病毒后续传播中的精准防控提供基础。
据悉，基孔肯雅病毒型别多样、突变位点多，传统的溯源方法为细胞培养后进行Sanger测序，此法需要耗时数周，并且面对低病毒载量样本时细胞培养法成功率较低。同时，基孔肯雅病毒培养需要生物安全三级实验室环境，传统方法不适用于基层疾控、一线海关口岸。
相比传统方法，宏基因组测序技术“免培养、广谱筛查、全基因组解析”的特性，使其成为应对新发突发传染病溯源工作的关键技术。
王逸丛表示，T1+基因测序仪仍在助力多地疾控系统完成基孔肯雅病毒测序分析，并在相关各级防控单位持续输出，高效捕获病毒序列，支持相关部门快速、精准、有效地制定防控策略。
据介绍，在后续的防控工作中，采用靶向全基因组测序，可以快速（在 6-8小时内完成从样本到报告的全流程）、经济、大规模地实现基孔肯雅、登革病毒测序溯源。 此外，全基因组序列也可助力快速诊断与复杂样本分析。
除T1+基因测序仪外，在华大时空中心的全读长（SEQ ALL）测序平台实验室内，还有许多不同的精密仪器。
王逸丛称：“截至目前，将近400台由华大智造生产提供的全读长测序仪在助力筑牢我国的公共卫生防线。这些测序仪在各地疾控、海关随时待命，可在公共卫生事件突发时即刻响应。”
潮安区融媒体中心
本期编辑：蔡晓琳
执行编辑：王晓丹
编 审：刘俊雄
来 源：深圳卫视深视新闻
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