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NSMB丨黄成栋/王育才/王朝团队揭示固有无序区域(IDR)远程驱动蛋白质功能开关的新机制

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2025 年 6 月 4 日,中国科学技术大学生命科学与医学部黄成栋教授等团队在 Nature Structural & Molecular Biology 期刊发表题为

Remote On-Off Switching of Protein Activity by Intrinsically Disordered Region
的研究论文。该工作首次揭示蛋白质中的固有无序区域(IDR)无需与功能结构域直接接触,即可通过调控构象熵,远程实现对蛋白活性的开关控制。这一突破打破了必须接触或发生结构变化才能调控的传统认知,为新型分子开关的设计提供了全新思路。

本研究同步在Nature Structural & Molecular Biology发表 Research Briefing 专题解读,题为How protein disorder turns internal dynamics into a long-range regulatory switch。

IDR :蛋白质功能的 “ 隐形操控器 ”

蛋白质的 IDR 广泛存在,却常因 “ 缺乏稳定结构 ” 而被视作 “ 无用尾巴 ” 。本研究以分子伴侣 Sgt2 为模 型,利用高分辨率核磁共振( NMR )和生化手段,系统揭示了 Sgt2 的 C 端 IDR 能作为 “ 双向熵调节器 ” ,跨越 150 多个氨基酸远距离调控 N 端结构域的动态性与活性,从而按需切换蛋白对下游分子的结合能力。令人惊讶的是,该功能的 “ 开 — 关 ” 切换完全不依赖任何直接接触或瞬时相互作用,仅凭 IDR 对动态变化的远程调控即可实现(图1)。

图1:IDR宛如遥控器,可以远程切换蛋白功能的‘开’与‘关’。(Art by Lili Q)

IDR序列本身就是“开关密码”

进一步研究表明, Sgt2 的自抑制作用与蛋白的中间结构域无关,而是由 IDR 特定的氨基酸序列决定(图2)。只要改变 IDR 的序列,这种自抑制效果就会消失。这说明, IDR 区域本身很可能是决定蛋白功能的核心元件,而非 “ 进化残留 ” 。

图2:Sgt2的自抑制作用由C端IDR的特定序列决定,且不依赖中间结构域或其他蛋白片段。

构象熵:蛋白质远程调控的新范式

与经典的 “ 构象变化 ” 模型不同,本工作证实, Sgt2 蛋白的自抑制和解锁过程完全建立在内部动力学变化(即构象熵)的调节上。 IDR 存在时,分子整体处于高度动态 、低序参数(高熵)状态 ,功能域被 “ 锁定 ” ;而 IDR 被切除或底物结合后,分子变得刚性,活性被 “ 解锁 ”(图3)。这揭示了 “ 动态熵信号 ” 作为蛋白远程调控的新范式,有望推广到更多蛋白系统中。

图3:Sgt2的IDR通过调控分子构象熵,实现了无需直接接触的远程自抑制和激活机制,从而动态切换蛋白的结合能力。

展望

该工作也充分展现了液体NMR技术在解析蛋白动态与功能关系上的独特优势。这一发现不仅拓展了蛋白质调控机制的认知,更为未来开发高效、可控的新型蛋白分子开关提供了理论基础。

本研究由中国科学技术大学博士生季拓为第一作者,黄成栋、王育才、王朝教授为共同通讯作者。

原文链接:https://www.nature.com/articles/s41594-025-01585-7

制版人: 十一

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