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Colossal称复活“冰原狼”,基于近亲灰狼编辑改造,获得3只幼崽

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近日,全球首家复活灭绝物种的公司 Colossal Biosciences 宣布已成功复活了恐狼(Dire Wolf)——3 只恐狼幼崽分别于 2024 年 10 月和 2025 年 1 月成功出生。

3 只恐狼幼崽中,有两只雄性狼 Romulus 和 Remus,取自罗马神话中由狼养大的双胞胎,一只雌性狼 Khaleesi,取自《权力的游戏》中的人物丹妮莉丝·坦格利安。两只雄性幼崽于 2024 年 10 月 1 日出生,另外一只雌性幼崽于 2025 年 1 月 30 日出生。

恐狼是一种美洲犬科动物,已灭绝 12,500 多年。根据首席执行官Ben Lamm 的介绍,团队从两块恐狼化石中提取了 DNA:一块牙齿来自俄亥俄州的谢里登坑,距今约 13,000 年;另一块内耳骨来自爱达荷州的美国瀑布城,距今约 72,000 年。

该团队对提取的 DNA 进行了深度测序,并使用 Colossal 的新方法迭代组装高质量的古代基因组,最终从牙齿中获得了 3.4 倍覆盖率的基因组,从内耳骨中获得了 12.8 倍覆盖率的基因组。Colossal 称这些数据提供的恐狼基因组覆盖率比之前高出 500 倍以上。

然后,他们将这些基因组与狼、豺和狐狸等现存犬科动物的基因组进行了比较,并确定了恐狼特有的基因,包括体型、肌肉、毛发颜色、毛发质地、毛发长度和皮毛图案。对高质量恐狼基因组的分析显示,灰狼是恐狼现存的近亲,这两个物种共享 99.5% 的 DNA

之后,该团队对来自恐狼的近亲灰狼的供体基因组进行了多重基因编辑,创下了 14 个基因中 20 个精确编辑的记录。这 20 种编辑中有 5 种是基于已知在灰狼中产生浅色皮毛的突变,只有 15 个直接基于恐狼基因组,旨在改变动物的大小、肌肉组织和耳朵形状。但这些变化是否对转基因动物产生了预期的影响还需要一年左右的时间才能弄清楚。

Colossal 编辑了多基因调控模块中恐狼的特异性变体,该模块与体型以及耳朵、头骨和面部形态的变化有关。该区域编码八个基因,这些基因确定了骨骼大小和结构的物种特异性限制。该模块编码的一个基因 HMGA2 与狗和狼的体型直接相关;另一个基因 MSRB3 与犬科动物和其他哺乳动物的耳朵和头骨形状的差异有关。鉴于这些基因在确定物种特异性大小和形态方面的作用,团队将恐狼特异性变体编辑成该基因组区域中的基因增强子。

对于每个被确定为与目标表型相关的高影响变异,Colossal 的恐狼团队都创建了一份详细的资料,列出了对供体灰狼基因组的所有潜在影响。为了确保健康的结果,该团队放弃了那些在预测表型之外会产生一定风险的变异,或优先考虑已经在具有预测表型的灰狼中进化的变异。

比如,恐狼基因组中的 3 个必需色素沉着基因发生了蛋白质编码替换:OCA2、SLC45A2 和 MITF,它们直接影响黑色素细胞的功能和发育。虽然这些变异会使恐狼的皮毛变浅,但这些基因在灰狼中的变异可能会导致耳聋和失明。因此,研究小组通过一种已知在灰狼中安全的途径,为恐狼设计了浅色皮毛:诱导 MC1R 和 MFSD12 功能丧失。这些基因影响沉积在皮毛上的黑色素细胞中色素真黑素和褐黑素的表达,实现恐狼基因组所暗示的较浅色素皮毛颜色表型,但不会对健康产生任何潜在影响。

然后,该团队通过全基因组测序和核型分析筛选了编辑后的细胞系,使用体细胞核移植将高质量细胞系克隆到供体卵细胞中,进行了胚胎移植并管理了跨物种代孕。

Colossal 在声明中透露:“健康发育的胚胎随后被移植到代孕母体内进行跨物种妊娠”。据该公司向 CNN 证实,他们使用家养犬(特别是大型混种猎犬)作为代孕母体。62 天后,经过基因改造的幼崽出生。

也就是说,科学家利用古代 DNA、克隆和基因编辑技术,改变了灰狼(史前恐狼的近亲)的基因,创造了三只幼崽。结果本质上是一种外观与其已灭绝的祖先相似的杂交物种。

“毫无疑问,整个基因组中 99.9% 的基因都是灰狼。科学界将会争论需要改变多少基因才能变成一只恐狼,但这实际上是一个哲学问题。”斯德哥尔摩大学古遗传学中心进化基因组学教授、Colossal 的公司顾问 Love Dalén 表示。

此外,Colossal 还将上述方法应用到了全球保护工作。他们利用一种新的非侵入性血液克隆方法,成功繁育了两窝克隆红狼,来自三条不同的遗传创始谱系,包括一只雌性红狼(Hope)和三只雄性红狼幼崽(Blaze、Cinder 和 Ash)。这是在恐狼研究中开发的一种新型、侵入性较小的克隆方法。

红狼是世界上最濒危的狼,其成功诞生进一步证明了复活灭绝物种的努力与该公司通过复活灭绝物种技术创新支持全球保护工作的能力不断增强之间的联系。

据悉,狼群在一片面积超过 2,000 英亩的安全广阔生态保护区中茁壮成长,该保护区由美国人道协会认证并在美国农业部注册。Colossal 雇佣了 10 名全职动物护理人员来支持狼群的身心健康。整个保护区包括专门的接触区和习性类型,被 10 英尺高的动物园级围栏包围,并配有冗余周边安全措施。在保护区内,狼群通过现场实时摄像头、安保人员和无人机跟踪持续受到监控,以确保它们的安全和福祉。保护区包括一个较小的六英亩安全场地,可以在那里进一步照料和研究恐狼。该区域还支持现场兽医诊所、狼管理设施、户外风暴庇护所和狼群的天然巢穴。

Colossal 的长期目标是通过与美国政府合作的现行保护工作让红狼重新回归野性。据悉,在对新物种的健康和福祉进行广泛的可行性研究、监测和跟踪之后,Colossal 将在未来几个月提供更多有关红狼和恐狼的信息。

1.https://www.businesswire.com/news/home/20250407444322/en/Colossal-Announces-Worlds-First-De-Extinction-Birth-of-Dire-Wolves

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