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西南大学邹懿教授课题组在活性天然产物生物合成研究中获重要进展

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导读

近日,西南大学药学院中医药学院邹懿课题组在《Angewandte Chemie International Edition》在线发表了题为“Biosynthesis of (−)-Vinigrol” (DOI: 10.1002/anie.202416795)的研究论文,解析了明星分子(−)-vinigrol的生物合成途径,展示了自然界在复杂多环体系分子中的合成艺术。

图1. (−)-Vinigrol的化学合成与生物合成进展

1987年,日本藤泽制药的科学家从真菌

Virgaria nigra
F-5408中发现了二萜化合物(−)-vinigrol(图1a),其具有一个桥[5.3.1]双环体系构成的独特三环骨架(紫杉醇类似结构)。此外,(−)-vinigrol还有八个连续的立体手性中心和三个羟基,其中的十氢-1,5-丁基萘结构也是首次在天然产物中出现。除了特殊的化合物结构以外,该分子具有良好的生物活性,如抗高血压,抑制血小板凝集的活性(IC50 = 52 nM),还可作为肿瘤坏死因子的拮抗剂。因此,该化合物自发现以来就备受小分子药物开发的高度关注。

(−)-Vinigrol是全合成中最具挑战的分子之一,全世界有超过20个课题组参与该分子的合成竞争,但均未实现该分子的全合成。直到2009年,天才有机化学家Phil S. Baran 课题组首次实现了其消旋体的全合成。著名有机化学家Barriault 和Njardarson课题组也分别在2012年和2013年完成了该分子消旋体的合成。2019年,北京大学罗佗平课题组率先用20步非常漂亮地实现了(−)-vinigrol的不对称合成。同年,南方科技大学李闯创课题组开发了一条高效简洁的、无保护基的不对称合成新策略,以Type II [5+2]反应为关键策略,将(−)-vinigrol的全合成缩短到了14步。两个中国课题组的工作,将(−)-vinigrol的全合成研究推到了全新的高度。

相较于全合成研究,(−)-vinigrol生物合成的研究却鲜有报道,诺贝尔化学奖得主E. J. Corey教授课题组在2000年提出了该分子的生源合成假设(图1b)。但是,直到今日,自然界合成该分子的生物酶,途径和策略仍是未解之谜。本研究(1)首先从菌株

V. nigra
NBRC9238的发酵液中分离鉴定到 (−)-vinigrol;(2)通过基因组测序结合萜环化酶遗传进化分析,锚定了 (−)-vinigrol可能生物合成基因簇;(3)通过体内异源表达和体外酶学表征等手段,阐明了其完整的生物合成途径,确认其最小合成基因簇为二萜环化酶VniA和细胞色素P450 VniB。VniA首先将GGPP环化为vinigrol-type骨架,然后由VniB在两个惰性碳原子上连续羟化得到终产物 (−)-vinigrol;(4)通过基因挖掘在菌株
Daldinia grandis
CBS 114736和
Xylariaceae
sp. AK1471两个菌株中鉴定了另外两个合成vinigrol-type骨架的环化酶,为这一稀有且高价值的vinigrol-type二萜骨架提供了新的真菌来源。

该研究展示了自然界在复杂多环体系分子中的合成艺术,同时为未来(−)-vinigrol及其衍生物的仿生合成和代谢工程生产提供了值得借鉴的例子。

西南大学为该论文成果的唯一完成单位,药学院2023级博士研究生许润为论文第一作者,邹懿教授为通讯作者。该项研究得到了科技部重点研发计划合成生物学重点专项课题,重庆市生物医药研发重大专项课题,西南大学自然科学领域领军团队项目和2035先导计划发展培育项目等基金资助。

近5年,邹懿教授课题组以西南大学为唯一或第一完成单位,作为独立或共同(最后)通讯作者,已陆续在J Am Chem Soc (2024, 2022, 2020),Angew Chem Int Ed (2024a, 2024b, 2023, 2019),Nat Commun (2022a, 2022b),ACS Catal (2021),Chem Sci (2024),Acta Pharm Sin B (2019)和Org Lett (2024a, 2024b, 2023, 2021, 2019)等国际知名期刊上发表文章数篇,相关成果多次被天然产物领域权威杂志Nat Prod Rep遴选为研究热点报道。

来源:西南大学

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