近日,北京化工大学冯越课题组与清华大学杨茂君课题组合作在Nature Chemical Biology发表了题为“Cas1 mediates the interference stage in a phage-encoded CRISPR–Cas system”的研究长文以及“An alternative mechanism for recruiting Cas2/3 in a phage-encoded CRISPR–Cas system”的研究简报,报道了ICP1噬菌体CRISPR-Cas系统独特的招募Cas2/3降解靶DNA的机制。
该研究阐明了ICP1 CRISPR-Cas系统复合物全新的招募Cas2/3的分子机制。首先,研究人员发现ICP1 Cas1可以结合ICP1 Csy或Csy-dsDNA复合物,而铜绿假单胞菌的Cas1并不能结合其Csy或Csy-dsDNA复合物;其次,ICP1 Cas1-Cas2/3复合物结合ICP1 Csy-dsDNA后,可以形成稳定的Csy-dsDNA-Cas1-Cas2/3复合物,该复合物由冯越课题组和杨茂君课题组合作解析(图1)。Cas1-Cas2/3复合物位于中心,两侧各结合一个Csy-dsDNA复合物,总分子量约1 MDa,这也是首个I-F型CRISPR-Cas系统结合Cas2/3的复合物结构,而铜绿假单胞菌Cas1-Cas2/3结合其Csy-dsDNA后,Cas1会逐渐从Cas2/3解离下来,最终只能形成Csy-dsDNA-Cas2/3复合物;体内和体外的活性实验证明,ICP1 Cas2/3只有在Cas1存在时,才能更好地降解Csy复合物靶向的DNA,而铜绿假单胞菌Cas1几乎不影响Cas2/3降解靶DNA。结合以上结果,冯越课题组提出了ICP1 CRISPR-Cas系统由Cas1招募Cas2/3进行靶DNA降解的新机制。
图1 ICP1 I-F型 CRISPR-Cas系统干扰机制
来源:北京化工大学
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