实验设计助手：一键获得研究内容、详细方案、高分建议、思维导图

来源：科研者之家

很多做基础研究的同学，课题开始的第一步--选题就蒙了，‍无从下手；而在课题设计时，实验方案设计作为核心内容，又该如何准备？

本期我们将介绍的这两款工具，不仅能够帮助大家锻炼选题思维，还可以针对输入的标题，协助归纳研究内容、实验目的、实验详细步骤。

（在生物学霸后台回复关键词「实验设计」，可免费使用！）

来源：丁香通 × 科研者之家，科研工具箱专题页面

高质量的文献，可以帮助我们获得发散思维和开拓课题思路。比如 Nature 上发现了一个新的肿瘤耐药基因，那针对这个基因和其他已知基因/通路作用关系的课题就可以被开展。再比如，文献里研究了生物学功能，那是不是就可以联想到相关的生物学功能也可以研究呢。

「IdeaIgnite 高分选题」这个工具可以根据最新发表的 CNS 文献，也可以上传文献，总结潜在的、新的课题思路，同时查看每个思路在已有文献的发表情况，如果没有被报道过，那恭喜你，

选好题了，比如「SALL2 基因缺失诱导乳腺癌内分泌耐药的分子机制」，但又有同学开始懵了，这实验该怎么设计呢？

这个时候就可以使用「实验方案设计助手」了，题目扔进去，直接给出研究内容、实验方案、高分建议和思维导图（而导出的思维导图，就可以做组会报告了）

1. 研究内容

1）确定 SALL2 基因缺失与乳腺癌内分泌耐药之间的关系。

可以通过对乳腺癌患者样本进行基因组测序，比较 SALL2 基因在耐药和非耐药乳腺癌患者中的表达水平差异。

2）确定 SALL2 基因缺失对乳腺癌细胞内分泌耐药的影响。

可以选择具有不同 SALL2 基因表达水平的乳腺癌细胞系，通过细胞增殖实验、细胞周期分析和细胞凋亡检测等方法，评估 SALL2 基因缺失对乳腺癌细胞内分泌耐药的影响。

3）探究 SALL2 基因缺失对乳腺癌细胞内分泌耐药的分子机制。

可以通过转录组测序和蛋白质组学分析等方法，比较具有不同 SALL2 基因表达水平的乳腺癌细胞系中基因表达和蛋白质表达的差异，寻找与内分泌耐药相关的信号通路和分子机制。

2.详细实验方案

实验目的 1：确定 SALL2 基因缺失与乳腺癌内分泌耐药之间的关系

实验设计：

1. 收集乳腺癌患者样本，包括耐药和非耐药患者。

2. 提取样本中的 RNA，进行基因组测序。

3. 对测序数据进行比对和分析，比较 SALL2 基因在耐药和非耐药患者中的表达水平差异。

4. 使用统计学方法验证差异的显著性。

所用材料和仪器：

1. 乳腺癌患者样本

2. RNA 提取试剂盒

3. 基因组测序仪器

4. 生物信息学分析软件

实验目的 2：确定 SALL2 基因缺失对乳腺癌细胞内分泌耐药的影响

实验设计：

1. 选择具有不同 SALL2 基因表达水平的乳腺癌细胞系。

2. 分别将这些细胞系分为实验组和对照组。

3. 对实验组和对照组的细胞进行细胞增殖实验，比较细胞生长曲线和增殖速率。

4. 对实验组和对照组的细胞进行细胞周期分析，比较细胞周期的分布情况。

5. 对实验组和对照组的细胞进行细胞凋亡检测，比较细胞凋亡率。

所用材料和仪器：

1. 具有不同 SALL2 基因表达水平的乳腺癌细胞系

2. 细胞培养基和培养器具

3. 细胞增殖检测试剂盒

4. 流式细胞仪

实验目的 3：探究 SALL2 基因缺失对乳腺癌细胞内分泌耐药的分子机制

实验设计：

1. 选择具有不同 SALL2 基因表达水平的乳腺癌细胞系。

2. 分别对这些细胞系进行转录组测序和蛋白质组学分析。

3. 对测序和分析结果进行差异基因和差异蛋白的筛选和注释。

4. 对差异基因和差异蛋白进行功能富集和信号通路分析，寻找与内分泌耐药相关的分子机制。

所用材料和仪器：

1. 具有不同 SALL2 基因表达水平的乳腺癌细胞系

2. RNA 提取试剂盒

3. 转录组测序仪器

4. 生物信息学分析软件

5. 蛋白质提取试剂盒

6. 质谱仪

增加的实验（为达到更高水平期刊要求）:

1. 验证 SALL2 基因缺失与乳腺癌内分泌耐药之间的关系的临床样本数量需要进一步扩大，以增加统计学上的可靠性。

2. 对 SALL2 基因缺失对乳腺癌细胞内分泌耐药的影响进行体内动物实验，例如使用小鼠模型，观察 SALL2 基因缺失对乳腺癌生长和耐药性的影响。

3. 进一步研究 SALL2 基因缺失对乳腺癌细胞内分泌耐药的分子机制，可以进行功能验证实验，例如通过基因敲除或过表达技术，恢复或增加 SALL2 基因的表达，观察对乳腺癌细胞内分泌耐药的影响。

思维导图也有了，点击导出 PDF 高清。

当然基础研究中，在研究某一个疾病时候，就离不开使用对应的细胞系和动物模型，分别代表体外和体内实验来论证课题结论。但细胞系种类繁多，动物模型也经常涉及复杂的种系差异和基因敲除。

这个时候就可以使用「细胞系/动物模型查询助手」，输入某个疾病或研究内容，自动罗列文献中对应的、已有报道的细胞系和动物模型，所以结果都是靠谱的。

同时给于解释说明，帮助快速理解，比如很多同学看不懂的基因敲除小鼠，比如 MMTV-Myc 小鼠是啥.... 其实点开小三角就能看到解释，原来这种小鼠是通过鼠乳腺肿瘤病毒（MMTV）启动子/增强子的控制下过度表达了 Myc 基因，常被用于研究乳腺癌的发生和发展。

好了，本期的工具就介绍到这啦。

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