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组织样本 RNA 易降解、难检测?1 小时了解最新单细胞空间原位技术

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随着成像和测序技术的飞速发展,机体组织器官空间成像研究逐渐爆火,一度成为 CNS 常客!尤其单细胞以及亚细胞空间分辨率的原位成像技术,为探索生命复杂性和疾病精准治疗提供无限可能。

2024 年 2 月举办的全球性 AGBT 大会上,单细胞 RNA 空间原位检测技术带来全新突破,打破组织 RNA 易降解的困局,实现单细胞、多靶标、空间原位高通量成像分析。无论是固定后的细胞还是组织(FFPE 样本,类器官,组织芯片等),可在多种组织类型中检测数百万个细胞(涵盖稀有细胞类别),同时对近 19,000 个基因表达进行成像,构建跨多个人体组织的综合单细胞空间图谱[1-2]。值得一提的是,基于此公开发布了以真正的单细胞分辨率捕获的全转录组 CosMx™ SMI 数据集。因此,这项技术的革新及应用不仅有助于探索人类复杂组织结构和生理功能,完善空间医学的基准数据库;更加速了疾病病理研究,展示精准治疗新范式。


图. RNA 单细胞空间原位检测技术流程

突破远不止于此!想要了解 RNA 单细胞空间原位检测完整解决方案吗?该技术在探索机体组织结构的应用及优势有哪些?如何助力疾病的精准治疗?……为了让广大科研人员更深入了解此技术及研究进展,NanoString 将于2 月 29 日 13:00~14:00举办线上研讨会,把 NanoString 在 2024 AGBT 大会上发布的内容带给大家,精彩多多,不容错过!

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亮点内容抢先看


1.单细胞空间原位技术突破性研发进展:首次真正实现单细胞空间全转录组检测分析

2.如何将最新的 High-plex 单细胞空间原位检测方案集成到您的实验室中:CosMx™ Human 6K Discovery Panel

3.超多靶标的空间蛋白组学方案:GeoMx® IO Proteome Atlas,在一张玻片上检测分析 570 多种蛋白质

分享嘉宾

Joseph Beechem, PhD

首席科学官兼研发高级副总裁,NanoString Technologies

CosMx™ SMI 单细胞空间原位成像系统优势及应用

1)高通量:CosMx™ SMI 是一个突破性的单细胞空间原位成像平台,结合了超高分辨率成像技术和多靶标检测能力,能够对组织切片中6,000 种 RNA 和 64 种蛋白质分子进行单细胞和亚细胞分辨率的原位成像

2)多种样本精准定量:突破 FFPE 样本中的 RNA 和蛋白质质量较低,RNA 易降解的局限。该系统具有简单的样本制备流程和稳定的原位杂交化学原理,并能够容多种组织类型(如新鲜冷冻(FF)、福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)、组织芯片(TMA)、类器官等),在单细胞分辨率上实现 RNA 和蛋白质在组织细胞原位精细的可视化展示和精准的定量分析。

3)应用广泛:超多靶标的单细胞空间原位表达信息在真实的组织空间背景下推进您对细胞间相互作用、细胞通讯和细胞状态的深刻洞察。

• 单细胞空间图谱:发现不同细胞类型,绘制其组织空间定位;

• 差异表达分析:基于空间背景的单细胞转录组差异表达分析;

• 解析细胞状态和细胞功能;

• 细胞邻域分析:组织微环境的空间表型;

• 细胞通讯:配体-受体相互作用;

• 转录本和蛋白的亚细胞定位;

• 生物标志物的发现和验证。

以上内容包含广告

内容策划:邹礼平
内容审核:朱卿

题图来源:图虫创意

参考文献

[1]. Michael Patrick, Shanshan He, David Kroeppler, et al. A universal 6,000-plex RNA panel to construct comprehensive single-cell spatial atlases across multiple FFPE human tissues.

[2]. Joseph Beechem, Rustem Khafizov, Tushar Rane, et al. Spatial Single-Cell Whole Transcriptome Imaging in Tissue and Fixed Cells using CosMx Spatial Molecular Imaging.

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