直播时间:2023年3月23日(本周四)20:00
直播主题:增强取样和开源分子模拟软件SPONGE/MindSPONGE简介
特邀讲者:杨立江, 北京大学,副研究员
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特邀讲者
杨立江,北京大学化学与分子工程学院副研究员,北京大学化学与分子工程学院理论与计算化学实验室主任。博士毕业于南开大学物理学院,曾于美国加利福尼亚大学尔湾分校和德克萨斯农工大学从事博士后研究。2010年入职北京大学化学与分子工程学院,从事理论和计算化学研究,主要研究方向为:增强取样分子模拟方法的发展和应用、化学反应机理模拟研究、高性能分子模拟软件开发等。曾参与开发了在学术界和工业界都享有盛誉的分子动力学软件包AMBER 9.0,作为主要贡献者参与提出并实现了多个高效的增强取样方法,比如,适合大尺度构型变化的近似加速算法,高斯型能量偏执的加速分子动力学模拟方法 (AMDGP),选择性过渡路径抽样方法 (STPS),温度积分增强抽样方法 (ITS)和选择性温度积分增强抽样方法 (SITS),可以将复杂体系的热力学计算提速几个数量级。近年来更加关注自主知识产权科学计算软件的开发,2021年参与组织开发并发布了国产开源分子模拟软件SPONGE,更布局以大数据和深度学习为代表的人工智能技术, 与华为昇思团队合作基于深度学习框架MindSpore开发了全景分子模拟软件MindSPONGE, 力求打造在算力时代引领技术变革的下一代分子模拟软件平台。
直播摘要
分子模拟作为一个重要的理论工具,在现代化学、物理、生物和材料等相关学科的研究中起着越来越重要的作用。 然而,受到当前计算机处理速度的 限制, 分子模拟计算所能够达到的时间尺度同实验或实际应用中要求的时间尺度相比 还存在着巨大的鸿沟。 增强抽样方法的发展和应用可以有效地拓宽分子模拟所能研究体系的时间尺度,极大地提高分子模拟的热力学和动力学计算能力。 本次报告首先将为大家介绍分子模拟中几种重要的增强取样方法,特别是我们课题组所发展的温度积分增强取样方法的原理和应用。 讲座的后半部分将重点介绍我们自主开发的开源分子模拟软件 SPONGE ,以及与华为昇思团队合作开发的分子模拟软件 MindSPONGE ,该软件完全基于华为人工智能框架 MindSpore 实现,有望成为在人工智能时代引领技术变革的下一代分子模拟平台。
内容预告
( 1 ) 增强取样方法和应 用
(2)开源分子模拟软件SPONGE简介
(3)面向下一代分子模拟的MindSPONGE
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超算云播课 ——
计算化学主题月
“计算化学主题直播月”是由并行科技超算云播课为分享计算化学前沿学术成果、普及化学领域高性能计算应用而举办的系列直播讲座活动。3月9日起,来自北京大学化学与分子工程学院、香港城市大学化学系,以及中国科学院大连化学物理研究所的专家学者将连续进行四场计算化学相关主题直播讲座,每周四20:00一场,B站【超算云播课】、视频号【并行科技】同步直播,欢迎观看!
超算云播课往期直播回放:
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北京并行科技股份有限公司(简称并行科技,股票代码:839493)成立于2007年,是国内领先的超算云服务和运营服务提供商。提供智算云、行业云、超算云、设计仿真云和计算资源建设及运营服务。
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