近日速石科技与深势科技宣布,共同部署完成了基于云平台的高通量自由能微扰计算方案。该方案以速石科技一站式新药研发云平台fastone为基础,融合深势科技Hermite™药物计算设计平台,能够自动化弹性调用超过百张GPU卡进行Uni-FEP计算任务,显著提升新药早期研发效率。目前,这一方案已在加科思药业正式启用。
本次联合方案部署融合了速石科技与深势科技两方的技术优势,强化了药企内部研发能力。
❖ Uni-FEP,即深势科技自研的FEP计算解决方案,它将自由能微扰理论、分子动力学、增强采样算法与高性能计算相结合,适用于骨架跃迁、配位共价、电荷转移、大环成环等不同场景,以高精度计算替代部分合成实验,从而提升药企在先导化合物优化阶段的研发效率。
❖ fastone平台核心是速石科技自研的一套即开即用的新药研发环境,深势科技Uni-FEP模块完全部署在fastone平台上,部署周期极短,能够实现新药研发企业对全部数据的自主管控能力。fastone平台能根据Uni-FEP任务需求,提供自动化弹性伸缩的动态GPU集群,在大规模并行任务提升计算效率的同时,实现成本控制的目标,并能基于任务层面监控告警功能,及时掌握Uni-FEP运行状态。
同时,本次方案建立在速石科技完整的安全保障体系之上,通过统一认证,全通道数据加密,数据隔离,数据传输审计,运维监控等多重安全措施,更好地保护药物研发数据资产,从技术架构上保障药企信息安全。
加科思药业临床前研发执行副总裁龙伟博士表示,药物分子与靶标蛋白的结合与相互作用是现代药物发现的重要基础之一,但其预测的精准度也制约着药物分子的快速筛选与设计。速石科技与深势科技分别是CADD平台整合与FEP精准计算领域的先行者。通过这次合作,加科思将充分发挥这两个领域的技术优势与资源,加速推进分子发现,攻克更多难成药靶点。
深势科技创始人兼CEO孙伟杰表示,加科思药业在创新药研发方面具备全球领先的技术积淀,借助本次合作,我们将高精度的Uni-FEP计算工具融合速石科技在云平台方面的技术实力,能够在保持计算精度的同时具备高度弹性的计算能力,让自由能微扰计算真正在实际的管线研发中发挥作用,提升先导化合物优化阶段的研发效率,助力加科思药业攻克更多难成药靶点。
速石科技创始人陈熹表示,利用计算机技术辅助药物研发,是生命科学行业的一个长期发展趋势,随着国内从事创新药研发的企业增多,研发管线的整体增加,AI辅助药物研发逐渐从梦想步入现实。对漫长药物研发周期的不满,对更多算力的渴求,对数据安全,系统安全的要求提高,都是药企需要面临的挑战。这次与深势科技在加科思药业的合作,就是一个很好的里程碑事件。
关于加科思药业
加科思药业(1167.HK)致力于为患者提供突破性治疗方案,公司的愿景是与合作伙伴携手共进,成为全球认可的药物研发领导者。公司的实验室坐落于中国北京、上海和美国马萨诸塞州,实验平台拥有开发蛋白磷酸酶、KRAS和其他转录因子的变构抑制剂技术。
关于加科思的更多信息,请访问:
http://www.jacobiopharma.com/
关于深势科技
深势科技成立于2018年,是“AI for Science”科学研究范式的先行者,致力于运用人工智能和分子模拟算法,结合先进计算手段求解重要科学问题,为人类文明最基础的生物医药、能源、材料和信息科学与工程研究打造新一代微尺度工业设计和仿真平台。
深势科技是国家高新技术企业、北京市“专精特新”中小企业,总部位于有“中国硅谷”之称的北京市中关村地区,具有约2000平米的科研办公场地以及1500平米的生物实验室,同时在上海、深圳、海口等城市布局研发中心。科研技术团队由中国科学院院士领衔,汇集了近百名数学、物理、化学、生物、材料、计算机等多个领域的优秀青年科学家和工程师,其中博士及博士后的比例超过了35%。核心成员获得2020年全球计算机高性能计算领域的最高奖项“戈登贝尔奖”,相关工作当选2020年中国十大科技进展和全球AI领域十大技术突破。
深势科技深耕“AI for Science”领域,创新性地融合了跨尺度建模、高效采样、高性能计算等技术,在保持量子力学精度准确性的基础上,将分子动力学的计算速度提升了数个数量级,从而解决药物和材料的微观计算模拟难题。深势科技推出的Hermite™药物计算设计平台、Bohrium微尺度科学计算云平台以及Lebesgue高性能任务调度与算力编排平台等微尺度工业设计基础设施,颠覆了现有研发范式,打造"计算指导实验、实验反馈设计"的全新范式,为药物、材料领域带来极具突破性的计算模拟及设计工具。
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https://dp.tech
关于速石科技
速石科技(fastone)致力于构建为应用定义的云,让任何应用程序,始终以自动化、更优化和可扩展的方式,在任何基础架构上运行。
我们为制药企业、Biotech公司提供一站式新药研发云平台,基于本地+公有混合云环境的灵活部署及交付,帮助用户提升10-20倍业务运算效率,降低成本达到75%以上,加快市场响应速度。我们提供生命科学行业应用的分析与加速,通过Serverless框架屏蔽底层IT技术细节,实现用户对本地和公有云资源无差别访问。
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https://fastonetech.com/
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