Materials-Studio 论坛问答全集2

5、问：那位高手能够介绍一下MS中CASTEP的势能模型的适用范围？比如说LDA的（PWC,VWN），GGA的（PW91,BP,PBE,BLYP,BOP,VWN-BP,PRBE,HCTH），能够简述一下其大致差别更好？

答：LDA局域密度近似（LDA）：局域密度近似（LDA）是第一阶梯。它仅仅采用空间点r处的电子密度n（r）来决定那点交换-相关能密度的形式。交换-相关能密度由密度相同的均匀电子气完全确定。泛函的交换部分就准确的用均匀电子气的微分表达。各种不同的局域密度近似（LDA）仅仅是相关部分表示方法不同，所有现代应用的局域密度泛函都基于Ceperly和Alder`s在８０年代对均匀电子气总能量的Monte Carlo模拟。

广义梯度近似（ＧＧＡ）：ＧＧＡ是Jacob阶梯的第二个台阶，将电子密度的梯度也作为一个独立的变量（|?n(r)|），在描述交换－相关能方面，梯度引入了非定域性。ＧＧＡ泛函包含了两个主要的方向：一个称为“无参数”，泛函中新的参数通过已知形式中参数或在其它准确理论帮助下得到。另外一个就是经验方法，未知参数来自于对实验数据的拟和或通过对原子和分子性质准确的计算。

Perdew,Burke and Emzerhof(PBE)以及Perdew-Wang from 1991(PW91)是无参数的，在量子化学中广泛采用的GGA，比如Becke,Lee,Parr and Yang(BLYP)是经验性。LYP校正采用了密度的二阶Laplace算符，因此严格上讲属于Jacob阶梯的第三阶，但通常仍然归类为GGA。

6、[求助]Linux上MS的安装问题我在RHES4.6上安装MS3.0,但是在castep和dmol下的RunDMol3.sh大小为零，没有东西，同时在share下也没有bin目录，也找不到ms_setuo.sh脚本请问是什么原因？

相应的出现这样的错误信息：

/home/sript/MSI/3.0/3rdParty/regxpcom: error while loading shared libraries: libcxa.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory

答：假如你有Materials Studio 3.1的ISO版本以及licene.dat。在linux机器上的用户名为firefox。下面是安装MaterialsStudio3.1 linux版本的步骤

1、假定把Materials Studio3.1的iso文件mount到/home/firefox/ms目录，切换到root帐号下，然后用下面的命令如下：mount -o loop /home/firefox/MS_MODELING.iso /home/firefox/ms

2、文件mount上去后，退出root帐号，回到firefox帐号。然后到/home/firefox/ms/UNIX目录，运行下面的：./Install

3、开始按提示安装了

• 1）、指定你要Materials Studio安装到的目录，比如/home/firefox/MaterialsStudio
• 2）、下面就是指定你所需要安装的模块了，根据自己的需要选择，当然也可以全部选上
• 3）、然后指定你License_Pack所在的目录，我们假定也是放到/home/firefox/MaterialsStudio/License_Pack目录中，那么先建立这样的目录：mkdir /home/firefox/MaterialsStudio/License_Pack接着按提示Enter。开始安装Licens_Pack了。
• 4）、下面把你所得到的licene文件msilic.lic拷贝到/home/firefox/MaterialsStudio/License_Pack/licenses目录中，并改名为msilicense.dat。
• 5)、把/home/firefox/MaterialsStudio/License_Pack/licenses/msilicense.dat完整的文件名按提示输入。这些完成后。就基本安装好了。下面就是把gateway运行起来。

4、到/home/firefox/MaterialsStudio/Gateway目录，运行下面的命令：./msgateway_control_18888 start提示说Gateway start succeeded - running as process xxxx。后，就启动成功了。

5、在ie的地址栏输入，http://127.0.0.1:18888/; 则页面会显示该机器上已经安装好的计算模块基本就安装成功了。(注意之处：不要用root安装它)。

7、问：我想对NaYF4的电子云分布进行模拟计算,请各位高手指点怎么计算??如果有NaYF4的结构的话,请分享一下.

答：如果是晶体的话，可以找相关的文献看晶格常数和原子坐标，自己构建模型后计算如果没有文献，可以上无机晶体结构数据库ICSD查询，如果查到，直接导出来就可以用ms算了电子云分布算一下电子密度就可以了可以用dmol和castep。如果要某个轨道的电子云，dmol算homo－lumo上下若干个轨道castep算能带，最后那visulizer看电子云密度图就ok了。