幽门螺杆菌感染是引起慢性胃炎、胃溃疡、甚至胃癌的一个主要因素，所以长期有胃部不适或者有家族胃癌史，一般都建议根除幽门螺杆菌。
但是实际情况是许多人在采用三联或者四联疗法后，发现幽门螺杆菌并未根除，可能产生耐药，这其中主要是幽门螺杆菌对抗生素耐药。
所谓的三联疗法指的是：两种抗生素（如阿莫西林联合克拉霉素或甲硝唑）加质子泵抑制剂（如奥美拉唑）；
四联疗法指的是：两种抗生素（如阿莫西林联合甲硝唑或奥硝唑或克拉霉素或呋喃唑酮等）加质子泵抑制剂（如奥美拉唑）加铋剂（如枸橼酸铋钾）。目前临床普遍采用的是四联疗法，清除率较高。
对于多次幽门螺杆菌根除失败，有耐药的可采取以下措施：
1.换用平时较少使用的抗生素，如使用奥硝唑、替硝唑等，使用呋喃唑酮、左氧氟沙星等。将阿莫西林可以每天小剂量多次使用，如一天3-4次，能够稳定抗菌药物的血药浓度。
2.换用受CYP2C19影响较小的质子泵抑制剂，如埃索美拉唑等。
3.如果是三联疗法换用四联疗法，四联疗法中的枸橼酸铋钾能够减少抗菌素耐药。延长给药时间，有的人采用的是10天的序贯疗法（先使用质子泵抑制剂+阿莫西林5天，再使用质子泵抑制剂+甲硝唑+克拉霉素5天），可变为14天（四联疗法）。
4.可同时服用特定益生菌，如布拉氏酵母菌，有助于提高幽门螺杆菌的清除。
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