晚明三大疑案也叫明末三大案，是发生在明朝末期宫廷中的梃击案、红丸案、移宫案的总称。这三桩案件一个比一个复杂，内部各方势力糅杂，客观来说它们并没有重大到直接导致一个王朝的灭亡，但史学界一致认为标志着明末纷乱和衰亡的开始。
第一案梃击案发生在万历四十三年五月初四（1615年5月30日）。这一日本来和往常一样，万历皇帝正在寝宫休息，突然传来的消息令他大为震惊，太子在宫中差点被人打伤！原来当日太子朱常洛在自己居住的慈庆宫待着，突然有一个名为张差的粗野男子手持木棍直接闯入殿中，守门宦官上前阻拦反被打伤。只见他猛地一下冲向朱常洛，好在侍卫反应过来联手将其制服，才使得太子朱常洛有惊无险地逃过一劫。
张差被捕后并没有立刻交代，刑部提牢主王之寀用了点手段才知道真相。张差本来是一个普普通通的猎户，一个月前他遇到一位太监说能带他赚大钱，张差就跟着太监一起上京了，在京城他被交到了另一位老太监手上。事发那天早上，老太监带着他到了慈庆宫外，将木棒交给他并嘱咐他进宫后见人就打，尤其是穿黄袍的，一定要下狠手。如果张差不小心被捉住了，他一定会派人来救。果然张差进宫后就开始大闹，见到穿着黄袍的太子朱常洛更是横冲直撞，闹出不小的动静。
根据张差的供言顺藤摸瓜，很快就找到了那两个太监，他们是郑贵妃的贴身保镖庞保和刘成。郑贵妃想害死太子，让自己的儿子朱常洵上位，东窗事发，她只能赶忙向太子和皇帝求情。太子和皇帝都不想深究此事，于是一场谋害太子的大案除了一个张差被以“疯癫病”发作处决外竟然就不了了之。
万历四十八年（1620）七月，明神宗驾崩，一个月后朱常洛即位，是为光宗。光宗生活没有节制，据《罪惟录》记载：“及登极，贵妃进美女侍帝。未十日，帝患病。”仅仅登基十天，泰昌帝朱常洛突然一病不起，第二天的万寿节庆典也不得不取消，这一切还和郑贵妃有着脱不开的关系。四天后皇帝病情加重赶忙召内官崔文升治病，服用崔文升开的药后皇帝非但没有好转，反而开始疯狂腹泻，一天能腹泻几十次。这种折磨持续到八月二十九日，鸿胪寺丞李可灼自称有灵丹妙药能治，皇帝一听赶忙召见。李可灼来了后先是诊断一番，然后拿出了他的仙药——一颗红色的药丸。皇帝因遭受长时间的折磨，一见“红丸”眼睛都亮了，当即不顾劝阻就服了下去。
也不知这红丸究竟是什么，皇帝一服下去立刻就“暖润舒畅，思进饮膳”。高兴的皇帝并不知道这不过是回光返照，当天申时，他又服下一枚红丸，这次红丸非但没有救他的命，反而将他推向了死亡。次日卯刻，泰昌帝朱常洛驾崩，此时距离他继承皇位不过一个月，这场“红丸”引发的宫廷案件，史称“红丸案”。
第三件“移宫案”紧随其后，且祸患早早就埋下了。朱常洛非常宠爱两名李氏选侍，分别为“东李”和“西李”，其中又以“西李”最为得宠。郑贵妃与西李暗中勾结，一个要做皇太后，一个要做皇后，虽然最后都没成功，但二人野心丝毫不减。朱常洛死后皇位由年幼的朱由校继承，面对这位小皇帝，西李的野心空前膨胀。按规定，皇帝驾崩后后妃要去往别处，但西李拒不离开，一直据守在乾清宫。
她与心腹魏忠贤运用各种手段牢牢控制小皇帝朱由校，妄图“挟天子以令诸侯”。但凡有什么奏章需要皇帝决断，一定要先交给她过目，她觉得没问题才会给朱由校。这些举动大大引起了朝臣的不满，大臣们暂且放下了内部斗争，一致向西李施压，最终西李和魏忠贤一党顶不住压力，不得不交出小皇帝，西李也移出乾清宫。“移宫案”到此时仅仅告一段落，更令人想不到的是四年后，朱由校竟然封了西李为康妃，一年后更是颁布了《三朝要典》这样一本彻底颠倒三大案黑白的文典，三大案变成了东林党人戕害皇族的事件。
明末三大案始末如此，它们都与郑贵妃有关，不过这个女人在其中也只是个棋子，事件背后反映更多的是朝堂混乱、党派之间激烈且不择手段的斗争。作为封建社会中枢的朝廷如此混乱，那么黎民百姓又该是生活在什么样的情况中？所以三大案看似只牵涉到皇家以及地位较高的臣子，但实际上明朝灭亡的迹象已经出现。巍峨山峦不是一夜崩塌，而是长久的风吹雨打变得脆弱，最终不堪重负倒下。丧钟为谁而鸣？相比诸位心里已然明了。
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