网易首页 > 网易号 > 正文 申请入驻

Science被质疑图片重复使用及结果无法重复,作者对此强势回应!

0
分享至

  2020年2月14日,宾夕法尼亚大学Sandipan Ray等人在Science 在线发表题为“Circadian rhythms in the absence of the clock gene Bmal1”的研究论文,该研究确定Bmal1功能对于皮肤成纤维细胞和肝切片中的日常分子振荡是必要的。

  但是,很快该文章被质疑图片重复使用以及结果无法重复,可能会严重影响文章的结论。2021年1月29日,Sandipan Ray等人在Science 发表更正的文章,更正的数据达到了数十个。

  2021年4月16日,Katharine C. Abruzzi等人在Science 发表评论文章,重新分析了这些数据,发现该基因型中可再现的mRNA振荡少得多。 我们还注意到错误和可能不适当的分析。

  2021年4月16日,Sandipan Ray等人在Science 回复了Katharine C. Abruzzi等人的质疑,指出:Abruzzi等人认为,在缺乏Bmal1的情况下在我们的研究中发现的转录组振荡幅度低,统计学意义和一致性低。 但是,他们的结论完全依赖于与我们使用的统计算法是不同的。 我们提供的统计指标和其他分析表明我们的原始分析和观察结果是准确的。此外,我们突出显示Bmal1独立24小时分子振荡的独立证据。

  2021年4月16日,Elan Ness-Cohn等人在Science 发表评论文章,指出:我们重新分析了相关数据。 我们无法重现原始发现,也无法确定可靠的周期基因。我们得出的结论是,在没有Bmal1的情况下,没有足够的证据支持昼夜节律的转录节奏。

  2021年4月16日,Sandipan Ray等人在Science 回复Elan Ness-Cohn等人的质疑,指出:几项独立的证据表明,在缺乏Bmal1或其他时钟敲除模型的情况下,分子和代谢振荡,支持了我们的观察结果。 为了确定在Bmal1 – / –细胞中观察到的转录组水平的振荡是“噪声”而不是真正的昼夜节律,作者可以在他们认为完全没有外部线索的环境中进行相同的实验,以验证实验结果。

  昼夜节律时钟(约24小时)在调节日常生理中起着基本作用。转录因子BMAL1是哺乳动物中分子钟的主要驱动器。Bmal1删除取消了24小时活动模式,这是时钟输出的一种度量。

  

  2020年2月14日,宾夕法尼亚大学Sandipan Ray等人在Science 在线发表题为“Circadian rhythms in the absence of the clock gene Bmal1”的研究论文,该研究确定Bmal1功能对于皮肤成纤维细胞和肝切片中的日常分子振荡是否必要。出乎意料的是,在Bmal1基因敲除小鼠中,在没有任何外源性驱动因素(例如日常光照或温度循环)的情况下,这两个组织在2至3天内都表现出转录组,蛋白质组和磷酸化蛋白质组的24小时振荡。该研究建议这样的振荡可能是由ETS家族转录因子募集的转录调控所支撑的。

  但是,很快该文章被质疑图片重复使用以及结果无法重复,可能会严重影响文章的结论。

  

  2021年1月29日,Sandipan Ray等人在Science 发表更正的文章,更正的数据达到了数十个。其中指出:

  作者在原始手稿中发现了一个错误。在分析过程中,一个数据集(肝脏切片时间进程)中的基因型(Bmal1 + / +和Bmal1-/-)被无意间颠倒了。这会影响图2和图3中的某些面板。报告的第一和第三部分以及相关的补充数字和表格。没有其他数据集或分析受到影响。这些更正不会改变本文的结论。

  正文中的以下项目已得到纠正:

  

  • 图1(B,C,D):修正了维恩图和热图(交换了Bmal1 + / +和Bmal1-/-面板)
  • 图3(A,B,C,D):包括Bmal1 + / +和Bmal1-/-的序列基序分析,以及ETS转录因子的相分布和节律性表达谱。
  • 正文中的句子已被删除或修改,以适当地纠正这种基因型倒置。

  与倒置肝脏切片数据集相关的补充数字和表格也已得到纠正:

  

  • 表S1,S2和S3:交换数据以反映正确的基因型。
  • 图 S1,S2和S3:交换肝脏切片转录组学面板以反映正确的基因型。
  • 图S6:在Bmal1 + / +和Bmal1-/-组织中鉴定的节律性ETS转录因子被交换以反映正确的基因型。描述了在Bmal1 + / +和Bmal1-/-中鉴定的节律性ETS转录因子的siRNA耗竭分析。
  • 图S9D:已使用更正的肝转录组学数据更新了图。

  作者还纠正了Gene Expression Omnibus(GEO)(登录号GSE111696)中单个数据集中的错误。作者非常感谢Kate Abruzzi及其同事关于此错误的早期沟通,他们独立发现了这一错误。

  

  2021年4月16日,Katharine C. Abruzzi等人在Science 发表评论文章,指出Sandipan Ray声称Bmal1 – / –肝切片和皮肤成纤维细胞中存在温度补偿的,自由运行的mRNA振荡。Katharine C. Abruzzi等人重新分析了这些数据,发现该基因型中可再现的mRNA振荡少得多。我们还注意到错误和可能不适当的分析。

  大多数Bmal1-/-MSF有节奏的转录本幅度低,重要性低,并且在整个数据集中的一致性极低。还值得注意的是,即使在重新分配基因型后,野生型肝切片数据中也没有核心时钟转录物振荡,而其中一些在Bmal1-/-中表现出周期性但非典型的阶段性模式。 因此,该分析与Bmal1独立和细胞自治振荡器的主张背道而驰。

  

  2021年4月16日,Sandipan Ray等人在Science 回复了Katharine C. Abruzzi等人的质疑,指出:

  Abruzzi等人认为,在缺乏Bmal1的情况下在我们的研究中发现的转录组振荡幅度低,统计学意义和一致性低。但是,他们的结论完全依赖于与我们使用的统计算法是不同的。 我们提供的统计指标和其他分析表明我们的原始分析和观察结果是准确的。此外,我们突出显示Bmal1独立24小时分子振荡的独立证据。

  

  2021年4月16日,Elan Ness-Cohn等人在Science 发表评论文章,指出:

  Sandipan Ray等人报告了缺少核心时钟成分BMAL1的小鼠组织中明显的转录昼夜节律。为了更好地理解这些令人惊讶的结果,我们重新分析了相关数据。我们无法重现原始发现,也无法确定可靠的周期基因。我们得出的结论是,在没有Bmal1的情况下,没有足够的证据支持昼夜节律的转录节奏。

  

  2021年4月16日,Sandipan Ray等人在Science 回复Elan Ness-Cohn等人的质疑,指出:

  Elan Ness-Cohn等人声称缺乏足够的证据支持了我们在小鼠皮肤成纤维细胞中缺乏核心时钟基因Bmal1的转录昼夜节律的观察结果。他们声称,他们无法通过重新分析来复制某些原始发现。我们不同意他们的分析和观点。

  几项独立的证据表明,在缺乏Bmal1或其他时钟敲除模型的情况下,分子和代谢振荡,支持了我们的观察结果。为了确定在Bmal1 – / –细胞中观察到的转录组水平的振荡是“噪声”而不是真正的昼夜节律,作者可以在他们认为完全没有外部线索的环境中进行相同的实验,以验证实验结果。

  参考消息:

  https://science.sciencemag.org/content/367/6479/800.long

  https://science.sciencemag.org/content/371/6528/eabg5409

  https://science.sciencemag.org/content/372/6539/eabf0922

  https://pubpeer.com/publications/B8A5981339F9657F1864EC35AA1BEE#8

  https://science.sciencemag.org/content/372/6539/eabf1941

  https://science.sciencemag.org/content/372/6539/eabe9230

  https://science.sciencemag.org/content/372/6539/eabf1930

特别声明:以上内容(如有图片或视频亦包括在内)为自媒体平台“网易号”用户上传并发布,本平台仅提供信息存储服务。

Notice: The content above (including the pictures and videos if any) is uploaded and posted by a user of NetEase Hao, which is a social media platform and only provides information storage services.

相关推荐
热点推荐

横店18线小演员被大佬邀约“三亚游”......

Buy遍全球1004
2021-05-07 11:45:26

“中国长征五号B火箭残骸已失控”,还“威胁地球”?外媒又乱炒

环球时报视频
2021-05-06 09:01:52

“我就出去发泄一次”亲子鉴定揭开尘封5年的秘密,丈夫崩溃不已

培大看众生
2021-05-06 23:32:28

半天没了近千亿!为了印度放弃疫苗知识产权,到底因为啥。。。

大猫财经
2021-05-07 11:54:22

挖地牢抢女孩做性奴,变态男惊动全美,被判400年后暴毙!

英国报姐
2021-05-06 18:30:02

一女子头顶红发身穿红裙,在20多层露台跳舞坠楼,留下一封遗书

独好
2021-05-06 22:37:05

在深圳,男子用下体顶女乘客,女子扯下她的面罩怒斥:我把你割了

紫轩收藏鉴赏
2021-05-07 01:16:15

美媒爆料盖茨夫妇离婚细节:不是友好分手,律师已经忙了几个月,家人几乎都站梅琳达

环球网资讯
2021-05-07 10:46:20

不惧苹果、小米挑战 | 上汽通用5年投入500亿加速转型

芳向盘
2021-04-15 00:21:27

疑似黄光裕回家乡被拍:与妻子杜鹃手牵手,多人陪同

和讯网
2021-05-07 08:56:08

“我不管”24岁男孩结婚一个月要离婚,妻子崩溃:那我不就三婚了

眉尾旋
2021-05-06 10:46:17

可怕!全球顶尖实验室合作,发现新冠病毒可以整合到人类基因组中

iNature前沿
2021-05-07 10:16:45

美女命丧珠峰,成为“睡美人”,9年后男子对其遗体做出一件傻事

苏神
2021-05-06 10:54:39

女粉丝与当红男星酒店同床,朋友圈发自拍炫耀:狂热的爱,最伤人

周冲的影像声色
2021-05-06 18:31:01

知名律师炫耀睡别人老婆刺激到处晒照片,女子扬言要鱼死网破

法律之声
2021-04-30 00:26:30

对澳全面清算开始!要让澳大利亚经济崩盘,中国用这一招就够了!

熊猫君
2021-05-07 06:15:02

蒙牛陷入“倒奶门”,专家:已对品牌造成负面影响

大白财经观察
2021-05-06 21:06:28

印度专家:中国连“疫苗玻璃瓶”都造不出,还好意思称制造大国?

记录之路
2021-05-07 06:04:13

尼泊尔疫情恶化,首都圈封锁延长+国际航班停飞

澎湃新闻
2021-05-07 09:38:54

昨天的斗争,中国火力很猛!

牛弹琴
2021-05-07 07:07:16
2021-05-07 13:25:08
iNature前沿
iNature前沿
专注科学动态、传递科普信息
1556文章数 47034关注度
往期回顾 全部

科技要闻

盖茨离婚细节曝光:家人几乎都站梅琳达

头条要闻

中纪委曝光开发乱象:滇池"腰"没了 插树枝冒充植树

头条要闻

中纪委曝光开发乱象:滇池"腰"没了 插树枝冒充植树

体育要闻

埃梅里淘汰枪手创历史 黄潜疯狂庆祝

娱乐要闻

阿娇未修图曝光 面部圆润大象腿明显

财经要闻

汽车要闻

不只有SUV车型 WEY品牌将发布轿车/MPV等

态度原创

家居
手机
房产
艺术
健康

家居要闻

港男月入过万只能带妻儿住7平蜗居 在洗衣机上做饭

手机要闻

iPhone 6电池爆炸:美国男子索赔500万美元

房产要闻

海口再出4634套预售房源 住宅最高19880元/㎡

艺术要闻

贾又福:山水画最忌小打小闹、细声细气

减重手术能治疗糖尿病?