网易首页 > 网易号 > 正文 申请入驻

38种癌症类型、2658个癌症样本,全面解析肿瘤内异质性

0
分享至

  

  撰文|nagashi

  近年来,随着经济发展和科学进步,医疗技术已经高度发达,人类平均寿命也得到了大幅提升。但由于寿命的增加以及环境因素等等,人类癌症发病率也随之增加。

  据世界卫生组织国际癌症研究署(IARC)发布了2020年全球最新癌症负担数据,2020年全球新发癌症病例1929万例,2020年全球癌症死亡病例996万例,癌症已经成为人类健康的头号威胁。

  人类一直没能彻底攻克癌症,肿瘤异质性是其中的一大障碍,肿瘤组织包含着各种不同的细胞,它们具有不同的表型特征,因而对治疗有不同的敏感性。想要彻底治愈癌症,首先就是要充分认知人类癌症基因组中的肿瘤异质性基因,并基于此开发新的癌症治疗方法。

  2021年4月7日,以弗朗西斯·克里克研究所为首的英国、美国和加拿大的联合团队在Cell上发表了题为:Characterizing genetic intra-tumor heterogeneity across 2,658 human cancer genomes 的研究论文。

  这项研究对跨越38种癌症类型的2658个癌症样本的全基因组序列进行了有关肿瘤内异质性(ITH)的描述,研究结果强调了ITH及其驱动因素在肿瘤发生发展中的重要性,并从全基因组测序数据中提供了一个全面注释肿瘤内异质性的泛癌症资源

  

  癌细胞在分裂增殖中会不断累积体细胞突变,其中一些突变是给癌细胞带来更强的适应性优势,并可能导致在基因上存在差异的肿瘤细胞群,特定的肿瘤细胞亚群携带特定的亚克隆突变,这被称为肿瘤内异质性(ITH)。

  值得注意的是,肿瘤内异质性是导致癌症治疗耐药性产生的一种机制,同时也是一个重要的临床挑战。然而,在不同癌症类型中,人类对肿瘤内异质性的范围、起源和驱动因素仍知之甚少。

  虽然此前的研究表明肿瘤内异质性可以通过大量并行测序数据来表征,但在在不同的癌症类型中,肿瘤内异质性仍然缺乏特征,并且对于亚克隆群体的选择压力存在很大的不确定性。

  在此项研究中,研究团队开发了一个强大的研究策略——调用拷贝数和簇突变来评估肿瘤内异质性及其起源、驱动因素和在肿瘤发展中的作用。基于这一策略,研究人员对跨越38种癌症类型的2658个癌症样本进行了全基因组测序。

  

  基于全基因组测序的肿瘤内异质性(ITH)表征

  与外显子组相比,全基因组测序提供了更多数量级的点突变信息,更高的检测拷贝数的改变(CNAs)的分辨率,以及调用结构变异(SVs)的能力。这增加了研究分析的广度和深度,并揭示了癌症类型的普遍性。

  

  利用突变分期进一步表征肿瘤内异质性(ITH)

  研究人员发现,几乎所有的癌症样本(95.1%)都含有明显的亚克隆扩展的证据,亚克隆之间存在频繁的分支关系。不仅如此,他们还在大多数癌症类型中观察到亚克隆驱动基因突变的阳性选择,并识别出癌症类型特异性的驱动基因突变、融合、结构变异和拷贝数改变的亚克隆模式,以及亚克隆之间突变过程的动态变化。

  这意味着肿瘤亚克隆扩展可以作为时间和空间变化的突变过程的证据,由此显示了丰富的肿瘤亚克隆体系结构具有线性和分支进化。

  

  驱动因素突变和亚克隆基因的选择

  除此之外,研究团队还发现只有11%的肿瘤亚克隆携带已知的单核苷酸变异(SNV)或indel(插入或缺失)驱动突变,他们推测这是因为晚期驱动基因突变池太大,到目前为止无法进行足够广泛的取样。

  最后,为了评估肿瘤内异质性对临床治疗的潜在影响,研究人员评估了活性驱动突变的克隆性(STAR方法),推断针对亚克隆突变可能导致治疗失败。他们发现,60.1%的肿瘤至少有一个临床活性位点,其中,9.7%包含至少一个亚克隆活性驱动因子,4.7%仅显示亚克隆活性位点

  由此可见,在临床研究中考虑肿瘤内异质性及其驱动因素是很重要的。

  

  总而言之,此项研究表明肿瘤内异质性(ITH)在癌症中普遍存在,并表现为癌症类型特定的模式,肿瘤亚克隆的分支系统发育是十分常见的,以及亚克隆突变过程是动态变化的。这一研究结果证实并强调了肿瘤内异质性(ITH)及其驱动因素在肿瘤发生发展中的重要性,并为肿瘤进化动力学提供了详细的见解。

  论文链接:

  https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)00294-4

特别声明:以上内容(如有图片或视频亦包括在内)为自媒体平台“网易号”用户上传并发布,本平台仅提供信息存储服务。

Notice: The content above (including the pictures and videos if any) is uploaded and posted by a user of NetEase Hao, which is a social media platform and only provides information storage services.

相关推荐
热点推荐

娶33岁处女老婆,新婚夜准备同房,她提一要求我懵了第二天离婚

共执桔梗枝
2021-05-02 08:50:02

美国一大学研究所预测:7月底,印度新冠死亡病例将超100万

海外网
2021-05-06 08:50:19

一天两喜讯六月两重天,泰山明修栈道暗度陈仓,中超有得看了

二次元小萌新
2021-05-06 22:25:10

假如地球直径1厘米,银河系会有多大?可见宇宙又有多大?

兔斯基聊科学
2021-05-05 17:23:33

经过三轮美国制裁,他直言若能扛过去,华为将成为全球最牛企业!

一笑看千秋
2021-05-06 05:58:41

恭喜张康阳!凌晨2点国米夺冠后再迎喜讯,国米称霸意甲强行加码

擎天聊球
2021-05-06 19:54:27

两性交往,男人以下这些方面越厉害,女人越是离不开你

酒巷清风plus
2021-04-30 20:27:41

嘉定新城:产业起步早 新房比二手房更值得买

易眼看房
2021-04-21 12:48:15

新婚夜床单见红老公开心不已,隔天老公给我洗内衣后,撕碎结婚证

吉祥闲话
2021-05-04 15:11:18

“层次”高的男人,微信头像都很不一般,别不懂

壹号情感
2021-05-05 14:49:19

联手赶走美国?日本前首相释放一危险信号,中俄联手抗美或成定局

东方之星V
2021-05-05 17:03:18

小米没有拿走华为一个用户,因为“买华为和荣耀的不看小米一眼”

红尘处处有飞刀
2021-05-05 10:44:03

“大佬”的一场生日宴,导致六大当红主持人集体被封杀

邓高旻娱乐社
2021-05-06 05:22:13

这次中国转守为攻!瞄准57项技术,美媒:2050年中国将超美成第一

强国网
2021-05-06 08:47:41

世界地图其实欺骗了你的眼睛?真实的太平洋超乎你的想象

鹰眼看世界
2021-05-05 21:52:59

日本76岁光棍:买买买上瘾,400平房子被塞满,7年没上床睡过觉

尘缘亦绝
2021-05-05 23:08:11

谢孟伟直播卖酒再度翻车,1千多的酒仅卖9.9,网友:劝劝潘子

趣说娱乐咖
2021-05-04 13:08:11

“再婚AA制三个月我才明白,中年男人愿意娶你,目的只有一个”

花影人间情感
2021-05-05 19:04:01

双输!杨鸣辞职遭拒绝,球队氛围可怕!杨鸣:谁都不想做辽宁主帅

体坛全视角
2021-05-06 02:03:16

岳母离婚,来家赖着不走,隔天瞧见床单,俺把房子过户给她

暮夜已深
2021-05-04 00:58:14
2021-05-07 04:40:51
生物世界
生物世界
最前沿、最有趣的生命科学研究
1881文章数 110591关注度
往期回顾 全部

科技要闻

河南女车主起诉特斯拉陶琳 索赔5万元

头条要闻

美国改口支持放弃新冠疫苗专利 打的什么算盘?

头条要闻

美国改口支持放弃新冠疫苗专利 打的什么算盘?

体育要闻

巴萨官方:法蒂成功进行了左膝关节镜检查

娱乐要闻

夏日女友!秦岚穿背心热裤秀身材

财经要闻

汽车要闻

基本确定配激光大灯 新宝马X3官图泄露

态度原创

时尚
房产
健康
公开课
军事航空

在韩出道3年的流量女星,回国会更好吗?

房产要闻

“五一”不及预期:营销力度加大,楼市有所降温

吃代餐食品减肥靠谱吗?

公开课

越穷的人,越喜欢在三个方面表现“大方”

军事要闻

一图了解世界强国步兵班组武器配置