今后，入境日本的外国人将被严密确认行踪。
“入国者健康确认中心”将用视频电话确认入境者在14天内，是否擅自外出乘坐电车等公共交通工具，或外出聚会聚餐等。
日本内阁首相菅义伟3月5日夜，对此特别做出说明。从海外入境日本的人，在14天隔离期间，保健所将利用手机确定入境者位置，以及用视频电话确认入境者的现况。并且是每天不定时确认。如果3天以上未能取得联系，工作人员将上门巡视。
同时，加强了入境前的核酸检测制度。如果赴日之前没有72小时以内的核酸阴性证明，将被拒绝登机。即使登机飞到了日本，在机场海关也将被拒绝入境。
日本政府之前曾试图用誓约书来管理入境者，但部分入境者在14天的隔离期内，擅自外出乘坐电车或聚餐，导致不少感染案例。因此从老百姓到反对党都强烈要求政府实施更加强有力的措施。据日媒称，新政策实施后，如果入境的外国人，一旦被确认到在入境后14天内擅自乘坐电车/巴士，或外出聚餐等，将有可能进入黑名单，严重者将被遣返回国。
另外，日本又将13个国家列入“特别关照”对象。这些国家分别是：意大利、奥地利、荷兰、瑞士、瑞典、斯洛伐克、丹麦、德国、法国、比利时、阿拉伯联合酋长国、尼日利亚和巴西。受英国变异病毒的影响，凡是从以上13个国家入境的外国人，抵达机场后，将在保健所指定的酒店进行隔离14天，且期间接受多次核酸检测。中途不能回家或探亲访友。加上之前指定的爱尔兰、南非和以色列，目前有17个国家被列入了“特别关照”对象国。
目前，除了持有长期在留签证，以及特殊情况急需入境的外国人以外，持有旅游等其他签证的外国人，原则上不能入境日本。
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