名侦探柯南是最成功的推理动漫，但与黑色组织对抗的主线剧情，与路人事件的非主线剧情杂混，很多人因此放弃观看，现小编将主线剧情集数及简介列出，想重温经典或喜欢这部番可以去看看。
第1至2集，云霄飞车杀人事件。工藤新一与青梅竹马毛利兰遇上“黑色组织”的大佬琴酒及伏特加，新一解决案件后只顾着看伏特加交易，没想到琴酒在背后来了一棍！还用新一试毒药APTX4869！但新一却没死，而是身体缩小了，从高中生变成了小学生，为了不危及身边的人，化名江户川柯南，寄住在父亲是侦探的毛利兰家里，只有阿笠博士知道实情。
第43集，江户川柯南诱拐事件，柯南的父母通过阿笠博士知道了柯南变小的事，日后父母成为对抗黑色组织的重要人物！
第49至50集，外交官杀人事件，柯南第一次恢复了身体，同时服部平次登场。
第56集，电玩公司杀人事件，组织成员龙舌兰前来交易天才程序设计师名单，却意外卷入他人事件被炸身亡。
第59至60集，福尔摩斯迷杀人事件，服部平次知道了柯南真实身份，并成为了对抗组织的“强力助手”！
第135至140集，黑色组织10亿抢劫事件，宫野志保（组织代号雪莉）姐姐宫野明美被琴酒杀死，宫野志保愤怒之下拒绝为组织工作，被囚禁，她服药自杀，却没死，与新一一样变成了小孩子，寄住在阿笠博士家里，柯南也知道了她的事，宫野志保化名灰原哀。
第190集，与黑色组织再会，组织成员皮斯克要暗杀日本一位议员，在此期间，灰原哀第一次恢复身体，但身处险境，被柯南救走，皮斯克由于暗杀议员的证据被人发现，被琴酒灭口。
第235集，黑色组织的大BoSS乌丸莲耶被提及！
第245至246集，战斗游戏的陷阱，与黑色组织对抗的FBI（美国联邦调查局）重要人物朱蒂老师登场！
第249至250集，神秘乘客，FBI最牛特工“银色子弹”赤井秀一登场！
第227至278集，来自芝加哥的男人，FBI老大詹姆斯登场！
有些集数是非主线剧情掺杂着主线剧情的情报（伏笔）。可以去看看，不然有些地方看不懂。
第291至294集，第301集，第307至311集，第326集。
第332至336集，柯南查出了组织雇佣的电脑工程师，并与组织危险接触。
非主线掺主线，354集，360集，361集，364集，366集，370集，也为之后的柯南加FBIvs苦艾酒之战埋下伏笔。
第371至376集，柯南和FBI与黑色组织的苦艾酒大战！
第406集，421集，428集，柯南查出黑色组织Boss的邮箱号码！
第459集，组织之手逼近的瞬间，黑色组织的基尔，基安蒂，科恩，苦艾酒，琴酒，伏特加策划暗杀候选人，基尔被FBI抓获。
第467集，基尔的弟弟登场，但不属于任何组织，纯粹是寻找姐姐。
第538至551集，红与黑的碰撞，基尔被发现是CIA（美国中情局）派往组织的卧底，并成功返回组织，赤井秀一诈死，干掉一名组织成员！
第556集，红白黄色的侦探团，基尔提供组织最新情报波本的动作。
第614集，侦探团VS抢匪团，波本假扮的赤井秀一登场（波本不相信赤井真死了，有仇）。
第630至632集，黑与13的暗示，假赤井秀一让黑色组织和FBI（局里很多人以为赤井真死了）差点大干，波本自己也差点被误杀！
非主线掺主线，第725，726，727，736，752集。三个疑似波本的人物，也为后面剧情埋下伏笔。
第753至758集，波本与苦艾酒联手要活捉宫野志保，但苦艾酒其实要她死，柯南与怪盗基德联手救了灰原哀。
非主线掺主线，讲赤井秀一家族，809集，812集，813集。
波本将与赤井摊牌前的伏笔，823集，824集。
第832至836集，波本向赤井摊牌！秀一（有人帮助）技高一筹，耍了波本，波本（日本公安派往黑色组织的卧底，也是公安第一名，是误以为同事被赤井杀了，才结仇），同时组织二号人物朗姆被提及。
非主线掺主线，讲赤井家族与新兰渊源，838集，840集，841集。
第845至846集，三名第一发现人，朗姆的情报。
第865集，出现两位疑似朗姆的警官，大和警官，黑田警官。
非主线掺主线，赤井家族情报，882集，899集。
第917至918集，与17年前一样的案发现场，关于朗姆案件情报。
第933集，934集，936集，新兰与赤井家族的渊源。
新增两位疑似朗姆的人物，（青山刚昌的烟雾弹）945集，950集。
第999集，正式推理出黑色组织的老大是乌丸莲耶！
第1009至1011集，波本与宫野家的渊源，真没想到波本是御姐控！
妈的，组织竟然以一半是卧底的前提同时对抗军情六处，FBI，CIA，柯南集团，日本公安，牛！！！
还有毛利小五郎绝对是超人！！！
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