网易首页 > 网易号 > 正文 申请入驻

Microbiome:中国科学家带来全球首个跨人群基因目录,揭开“天生丽质”的秘密

0
分享至

  皮肤,是人体的第一道防御屏障,作为人体与环境接触面积最大,频率最多的器官,其表面分布着大量的微生物群。这些微生物群从我们出生即开始建立,随着年龄的增长,以及与环境的不断接触,其组成会不断发生变化,直至成年后达到一定的稳态。有研究认为,皮肤的微生物群对于皮肤的稳定和屏障功能至关重要,异常的变化可能会导致许多常见皮肤疾病的发生。因此,对人类皮肤的微生物菌群及其功能的充分分析对于皮肤疾病的治疗具有重要的潜力和影响。

  近日,来自上海复旦大学和深圳华大生命科学研究院的研究人员在《Microbiome》上发表了题为 Characterization of the human skin resistome and identification of two microbiota cutotypes 的研究成果,通过对汉族人群的822个皮肤样本进行测序,结合538个北美样本,构建了相对完整的人类皮肤微生物基因组(iHSMGC),并充分分析了皮肤菌群的组成和功能特点、抗生素抗性基因的来源和分布以及与国人皮肤特性相关的微生物表型。

  

  https://doi.org/10.1186/s40168-020-00995-7

  为了鉴定人类皮肤表面的微生物群,研究人员从294个汉族参与者的前额、脸颊、鼻子等不同部位获得了共822个皮肤样本,并对其中的微生物进行了宏基因组测序,结合人类微生物组计划(HMP)中获得的538个北美皮肤样本测序数据,构建了包含有10930638个基因的人皮肤微生物基因目录(iHSMGC)。

  与HMP中的北美皮肤微生物基因目录相比,研究人员鉴定到了4879024个新基因。除此之外,研究人员还发现,每个皮肤样本平均含有501756个基因,远低于肠道样本中的基因。

  

  综合人类皮肤微生物基因目录(iHSMGC)的构建与分析

  在对这些基因进行注释后,研究人员发现,无论人种和取样部位,所有的样本中均普遍存在模拟棒状杆菌、痤疮丙酸杆菌、颗粒丙酸杆菌、金黄色葡萄球菌、头葡萄球菌、表皮葡萄球菌、肺炎链球菌这七种细菌,共占微生物丰度的60.8%,它们可能在皮肤中发挥着高度保守的功能。

  细菌对抗生素产生的抗药性,是皮肤病等任何疾病治疗要面临的重大挑战。基于该问题,研究人员利用iHSMGC,对国人皮肤中的病原性细菌和非病原性细菌均表达的所有抗生素抗性基因(ARG)及其前体进行了表征。共鉴定了3810个非冗余ARGs,其中足部样本的ARGs含量最高,而皮脂区域的ARGs含量最低,皮葡萄球菌属是皮肤菌群耐药基因的重要来源。此外,汉族人中ARGs的丰度明显高于北美人,这些ARG能够赋予细菌对常用于治疗皮肤感染的氟喹诺酮类、四环素类和头孢菌素等38种抗生素产生耐药性。

  

  皮肤微生物组中的抗生素抗性基因(ARG)

  之后,研究人员更详细的分析了汉族皮肤中的微生物特征,发现在中国人的面部样本中,细菌、病毒和真菌分别平均占95.83%,1.51%和2.66%。细菌中分布最多的是痤疮丙酸杆菌、奥斯陆莫拉菌、青枯雷尔氏菌和表皮葡萄球菌,而真菌和病毒成员比例远低于HMP数据集中相同部位的北美样本。

  

  汉族人面部皮肤微生物群的组成

  研究人员还对国人面部的皮肤微生物群进行了多维聚类分析和主坐标分析,发现294位汉族人的前额皮肤样本可以分层为分别以痤疮丙酸杆菌(C)和奥斯陆分枝杆菌(M)为优势菌的两个表型。每个表型中富集着与其高度相关的微生物,形成了稳定的生态网络。此外,两种表型间也存在着巨大的维生素合成、代谢和耐药相关功能差异,M表型中ARG的相对丰度也显着高于C表型。这两种表型与宿主皮肤特性也相关联,C型皮肤更水润和保湿,其皮肤表面皮脂及其微生物代谢物卟啉的含量较高。相比之下,M型皮肤较为干燥,表面皮脂水平较低,且皮肤的患病率易随年龄的增长而显著增加。

  简而言之, iHSMGC的开发将促进科学家门对人类皮肤微生物组的进一步研究,而相关的发现有助于更好地了解皮肤微生物组稳态的形成和皮肤病的治疗。

  End

  参考资料:

  [1]https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-020-00995-7

  本文系生物探索原创,欢迎个人转发分享。其他任何媒体、网站如需转载,须在正文前注明来源生物探索。

  往期精选

  围观

  热文

  热文

  热文

  热文

  医药

  基础研究/转化医学

  医疗器械/生物技术

  体外诊断 | 医疗器械 | 生物纳米 | 3D打印 | 基因检测 | 单细胞测序 | 基因编辑 | 辅助生殖 | 人工智能 | 精准医学

  市场/资本

特别声明:以上内容(如有图片或视频亦包括在内)为自媒体平台“网易号”用户上传并发布,本平台仅提供信息存储服务。

Notice: The content above (including the pictures and videos if any) is uploaded and posted by a user of NetEase Hao, which is a social media platform and only provides information storage services.

相关推荐
热点推荐

b站估计要笑死了…这部新番下架了

二次元基地
2021-04-19 13:32:25

乌克兰闯下大祸了?普京彻底被激怒,俄军招招致命,美:胜负已定

紫龙防务观察
2021-04-19 12:58:31

“公募一哥”最新持仓大曝光:卖了白酒 买了这些股票

财联社
2021-04-19 11:09:24

广州未来最值得期待的辖区:越秀、荔湾落选,不是海珠区和天河区

虹雨爱娱乐
2021-04-19 08:30:54

“三亚海胆蒸蛋”事件,蛋里到底有没有海胆?厨师一语道破玄机!

红厨网
2021-04-15 14:02:18

美八架战机逼近台海,联合航母威慑,中国可封锁台湾海峡设伏待敌

楼市行情
2021-04-19 08:12:02

妻子无法生育,我娶她闺蜜,生下儿子前妻发来祝福,我想掐死儿子

脸到用时方恨丑八怪
2021-04-18 21:33:00

凯特王妃环住查尔斯王储肩膀,亲吻脸颊,主动安慰悲伤公爹很贴心

译言
2021-04-19 04:58:57

乌克兰还是把马达西奇卖了?白送土耳其暴露私心:糟蹋了不给中国

迷彩虎军事
2021-04-18 18:41:10

女子去男朋友的别墅度假,洗澡时发现墙壁不对劲,抬头瘫在地上

倚靠窗前
2021-04-18 13:11:42

中国驻名古屋总领馆发布紧急提醒!

每日经济新闻
2021-04-19 12:57:07

斯蒂芬·沃尔特:今天的美国,没有资格要求中国尊重“基于规则的国际秩序”

观察者网
2021-04-19 08:41:16

连看2集《绝密使命》,真正的“写实”谍战剧,张桐神似柳云龙

立场影视
2021-04-19 14:19:03

埃及新都即将使用

地球知识局
2021-04-19 11:32:30

阶层滑落中的卡车司机,还有多少濒临“自杀”?

乌鸦校尉
2021-04-19 11:25:43

我都40岁了,老公还每天侮辱我,这种恶习我受不了了

百里江戈
2021-04-19 11:51:43

17岁的嫩模Taylor Joy,身材火爆,没有吊带支撑要“走光了”

mx八卦城
2021-04-17 07:05:30

“晒娃还是晒肉?”辣妈分享亲子照被喷,网友质问对得起孩子吗

皮球儿的妈妈
2021-04-14 19:15:02

51岁成龙遇见28岁最美金喜善,64岁成龙再见41岁“最胖”金喜善

明星八卦net
2021-04-16 20:53:33

飞度为什么卖不动了

财富管理专员
2021-04-19 08:18:18
2021-04-19 17:53:08
生物探索
生物探索
探索生物科技价值的新媒体门户
7465文章数 42682关注度
往期回顾 全部

科技要闻

女车主大闹车展展台刷爆网络,特斯拉回应了

头条要闻

约翰逊将宣布针对"敌对国家"新法案 英媒:包括中俄

头条要闻

安徽2岁男童凌晨从5楼坠亡:嫌疑人系孩子亲生母亲

体育要闻

瓦妮莎庆祝与科比结婚20周年:永远爱你

娱乐要闻

昆凌17岁练舞照曝光 满脸胶原蛋白

财经要闻

汽车要闻

非承载+混动系统 "机甲猛兽"坦克700车展首发

态度原创

数码
本地
游戏
艺术
军事航空

数码要闻

大幅提升使用体验:一招让显示器好用百倍

本地新闻

一段亲密关系中,如何让亲密感和新鲜感共存?

老滚MOD改编《遗忘之城》延期至今夏发售

艺术要闻

一周观展指南|康定斯基要“来”上海

军事要闻

中国航空20家族全家福!