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快讯 | 杰出表观遗传学家施扬教授加入牛津Ludwig肿瘤研究所

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撰文 | 雪 月
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迦 溆

2020年7月1日,Ludwig Institute of Cancer Research宣布施扬教授加入牛津Ludwig肿瘤研究所。

Ludwig Institute of Cancer Research官网报道

LudwigInstitute of Cancer Research 是世界著名的肿瘤研究所之一,由慈善家Daniel K. Ludwig 于1971年捐资成立,目前共有13个分所,分布于美国、英国、比利时、瑞士、澳大利亚与瑞典6个国家。

施扬教授

施 扬教授于1982年本科毕业于上海第一医学院(现为复旦大学上海医学院),1983年通过由吴瑞先生发起的CUSBEA中美生物化学联合招生项目(China–United States Biochemistry Examination and Application)赴美国纽约大学攻读博士学位,1987年博士毕业后在普林斯顿大学Thomas Shenk 团队做了三年博后,从1991年起进入哈佛大学任教至今,2004年施扬受聘为哈佛大学终身教授。据了解,施扬教授还是首位在哈佛大学拿到教职(tenure-track系列)的中国本土学者(接受建国后大陆本科教育)。(详情点击BioArt:致敬施扬教授并祝贺其当选美国院士)

施扬教授长期致力于表观遗传学以及染色质生物学领域的研究。该领域中,组蛋白甲基化是真核生物中一类重要的生物学信号,参与了大量的基本生命运动,包括基因转录、DNA复制和遗传等。这些过程中的突变也是癌症的重要驱动力,也是许多其他疾病和病症的基础。

近30年来,他围绕组蛋白甲基化开展了系统性的工作,阐明了该领域中十分关键的“组蛋白甲基化动态调控”规律,奠基了甲基化研究的理论体系。他的原创性科学成果中包括了多类组蛋白去甲基化酶和可区分不同甲基化状态的蛋白因子的发现等。其中最著名的工作是于2004年发现了首例组蛋白去甲基化酶LSD1,证实了组蛋白甲基化是酶促可逆的。这项发现对本领域产生了深远的影响,结束了长达40多年来组蛋白甲基化信号是否酶促可逆的争论,促发了后续一系列重要的科学成果,开启了真核生物DNA和RNA甲基化动态调控规律的多项发现,并奠定了表观遗传学的基础。

“施扬在染色质修饰作用机理的创新研究方面有着出色的成绩,”Ludwig·牛津分所主任Xin Lu说。“我们很高兴施扬凭借他丰富的经验,国际知名度和合作精神,在Ludwig·牛津分所领导肿瘤表观遗传学发展。”

施扬教授致力于将这些发现应用于临床治疗。他的小组在LSD1方面的研究成果助力开发了用于肿瘤治疗临床试验中的LSD1抑制剂。他的团队证明了抑制LSD1可能还有助于使原本不敏感的肿瘤更易对检查点抑制免疫疗法产生反应。此外,他的实验室还研究了表观遗传修饰在小儿神经胶质瘤和急性髓细胞性白血病中的作用和治疗方法。

施扬因其对表观遗传学的贡献而获得了许多荣誉,是美国科学促进协会(American Association for the Advancement of Science)会员,也是美国艺术与科学学院(American Academy of Arts and Sciences)院士。

在Ludwig·牛津分所,施扬团队将专注于急性髓细胞性白血病和弥漫性桥脑神经胶质瘤中染色质/表观遗传学在维持低分化状态中的关键作用。他们正在探索促进肿瘤细胞分化的机制,以期为临床治疗提供理论支持。他的团队同时还在探索肿瘤免疫系统中的表观遗传调控因子,以寻找将“冷”肿瘤“变热”的方法,并提高肿瘤对免疫检查点抑制疗法的敏感性。

扬教授作为通讯或一作的代表性文章

Re-programming Chromatin with a Bifunctional LSD1/HDAC Inhibitor Induces Therapeutic Differentiation in DIPG Anastas JN. et al, (2019), Cancer Cell, 36, 528 - 544.e10.

LSD1 Ablation Stimulates Anti-tumor Immunity and Enables Checkpoint Blockade Sheng W. et al, (2018), Cell, 174, 549 - 563.e19.

Achromatin-dependent role of the fragile X mental retardation protein FMRP in the DNA damage response. Alpatov R, et al. Cell. 2014 May 8;157(4):869-81.

Histone H4K20/H3K9 demethylase PHF8 regulates zebrafish brain and craniofacial development. Qi HH, et al. Nature. 2010 Jul 22;466(7305):503-7.

PHD finger recognition of unmodified histone H3R2 links UHRF1 to regulation of euchromatic gene expression. Rajakumara E, et al. Mol Cell. 2011 Jul 22;43(2):275-284.

DNA unwinding by ASCC3 helicase is coupled to ALKBH3-dependent DNA alkylation repair and cancer cell proliferation. Dango S, et al. Mol Cell. 2011 Nov 4;44(3):373-84.

Histone methylation: a dynamic mark in health, disease and inheritance. Greer EL, Shi Y. Nat Rev Genet. 2012 Apr 3;13(5):343-57.

The histone H3 Lys 27 demethylase JMJD3 regulates gene expression by impacting transcriptional elongation. Chen S, et al. Genes Dev. 2012 Jun 15;26(12):1364-75.

Anew horizon for epigenetic medicine? Chen S, Shi Y. Cell Res. 2013 Mar;23(3):326-8.

The histone demethylase LSD1/KDM1A promotes the DNA damage response.

Mosammaparast N, et al. J Cell Biol. 2013 Nov 11;203(3):457-70.

A histone methylation network regulates transgenerational epigenetic memory in C.elegans. Greer EL, et al. Cell Rep. 2014 Apr 10;7(1):113-26.

A histone H3 lysine 27 demethylase regulates animal posterior development.

Lan F. et al, (2007), Nature, 449, 689 - 694.

Reversal of Histone Lysine Trimethylation by the JMJD2 Family of Histone Demethylases Whetstine JR. et al, (2006), Cell, 125, 467 - 481.

Histone Demethylation Mediated by the Nuclear Amine Oxidase Homolog LSD1 Shi Y. et al, (2004),Cell, 119, 941 – 953.

A two-tiered transcription regulation mechanism that protects germ cell identity. Shi Y, Blackwell TK. Mol Cell. 2003 Nov;12(5):1062-4.

YinYang 1 is a negative regulator of p53. Sui G, et al. Cell. 2004 Jun 25;117(7):859-72.

Regulation of tissue-specific and extracellular matrix-related genes by a class I histone deacetylase.Whetstine JR, et al. Mol Cell. 2005 May 13;18(4):483-90.

Regulation of LSD1 histone demethylase activity by its associated factors.

Shi YJ, et al. Mol Cell. 2005 Sep 16;19(6):857-64.

Reversal of histone lysine trimethylation by the JMJD2 family of histone demethylases. Whetstine JR, et al. Cell. 2006 May 5;125(3):467-81.

The X-linked mental retardation gene SMCX/JARID1C defines a family of histone H3lysine 4 demethylases. Iwase S, et al. Cell. 2007 Mar23;128(6):1077-88.

S.pombe LSD1 homologs regulate heterochromatin propagation and euchromatic gene transcription. Lan F, et al. Mol Cell. 2007 Apr13;26(1):89-101.

Recognition of unmethylated histone H3 lysine 4 links BHC80 to LSD1-mediated gene repression. Lan F, et al. Nature. 2007 Aug 9;448(7154):718-22.

Histone lysine demethylases: emerging roles in development, physiology and disease. Shi Y. Nat Rev Genet. 2007 Nov;8(11):829-33.

Mechanisms involved in the regulation of histone lysine demethylases. Lan F, Nottke AC, ShiY. Curr Opin Cell Biol. 2008 Jun;20(3):316-25.

CDYL bridges REST and histone methyltransferases for gene repression and suppression of cellular transformation. Mulligan P, et al. Mol Cell. 2008 Dec5;32(5):718-26.

https://www.ludwigcancerresearch.org/news-releases/epigenetics-researcher-yang-shi-appointed-member-of-ludwig-oxford/

https://www.ludwigcancerresearch.org/

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