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横跨15年:石正丽等团队3篇顶刊的病毒研究之路

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  以下文章来源于iNature,作者北大-医学君

  iNature

  专注前沿科学动态,传递科普信息。

  2003年中国南部出现了严重急性呼吸道综合症(SARS),2018年的猪急性腹泻综合征,2019年的新型冠状病毒肺炎,无一例外,这些病原体都是冠状病毒,而且根据目前的研究成果,其宿主都是蝙蝠

  2002年至2003年,中国南部出现了严重急性呼吸道综合症(SARS)。其病原体SARS冠状病毒(SARS-CoV)的起源仍然难以捉摸。2005年10月28日,中国科学院武汉病毒所石正丽等团队在Science在线发表题为“Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses”的研究论文,该研究发现蝙蝠是冠状病毒的天然宿主,与引起SARS爆发的那些冠状病毒密切相关。这些病毒被称为SARS样冠状病毒(SL-CoVs),其遗传变异性比从人类或小动物身上分离出的SARS-CoV强。SARS-CoV的人类分离株和果子狸分离株在SL-CoV谱系内系统发育进化,这表明导致SARS爆发的病毒是该冠状病毒组的成员。

  野生动植物库中病毒的跨物种传播对人类和动物健康构成了明显的威胁。蝙蝠是公认的新兴病毒的储存库之一,而起源于蝙蝠的冠状病毒通过中间宿主传播给人类,是造成高影响力的新兴人畜共患病,严重急性呼吸系统综合症(SARS)的原因。2018年4月4日,中国科学院武汉病毒所石正丽等团队在Nature在线发表题为“Fatal swine acute diarrhoea syndrome caused by an HKU2-related coronavirus of bat origin”的研究论文,该研究提供病毒学,流行病学,进化论和实验证据,证明一种新型的与HKU2相关的蝙蝠冠状病毒,即猪急性腹泻综合征冠状病毒(SADS-CoV),是造成猪致命性疾病大规模爆发的病原体。研究人员在2013-2016年间从广东省蝙蝠采集的肛门拭子的9.8%(591个中的58个)中鉴定出SADS相关冠状病毒,其序列同一性为96-98%,主要是已知的马蹄蝠(Rhinolophus spp)是SARS相关CoV的储存库。这项研究强调了识别蝙蝠冠状病毒多样性和分布的重要性,以减轻可能威胁牲畜,公共卫生和经济增长的未来爆发。

  自18年前的SARS爆发以来,在其天然宿主蝙蝠中发现了许多严重的急性呼吸综合症相关冠状病毒(SARSr-CoV)。先前的研究表明,其中一些蝙蝠SARSr-CoV具有感染人类的潜力。2020年2月3日,中国科学院武汉病毒所石正丽团队在Nature在线发表题为“A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin”的研究论文,该认为蝙蝠才是最有可能的携带2019-nCoV病毒的野生动物

  自18年前的SARS爆发以来,在其自然的宿主蝙蝠中发现了大量与严重急性呼吸系统综合症相关的冠状病毒(SARSr-CoV)。先前的研究表明,其中一些蝙蝠SARSr-CoV具有感染人类的潜力。

  nCoV-2019的基因组表征

  在这里,研究人员报告了一种新型冠状病毒(nCoV-2019)的鉴定和表征,该冠状病毒在中国武汉引起了人类急性呼吸道综合症的流行。该流行病始于2019年12月12日,到2020年1月20日已导致198例实验室确认的感染,其中3例死亡。

  患者样本的分子和血清学研究

  在暴发初期,研究人员从5名患者中获得了全长基因组序列。它们彼此几乎相同,并且对SARS-CoV共有79.5%的序列相似性。此外,发现在整个基因组水平上,nCoV-2019与蝙蝠冠状病毒的同源性为96%。

  病毒颗粒

  七个保守的非结构蛋白的成对蛋白序列分析表明,该病毒属于SARSr-CoV物种。然后从重症患者的支气管肺泡灌洗液中分离出nCoV-2019病毒,该病毒可被几名患者的血清中和。重要的是,该研究已经确认,这种新型CoV(nCoV-2019)与SARS-CoV使用相同的受体ACE2进入细胞。

  nCoV-2019受体使用情况分析

  总而言之,这项研究提供了有关nCoV-2019的第一份详细报告,nCoV-2019是造成中国中部武汉市持续性急性呼吸道综合症流行的病因。在所有接受测试的151例患者中观察到150例病毒特异性核苷酸阳性和病毒蛋白血清转化,提供了该疾病与病毒之间存在关联的证据。根据该研究结果,应该预期并且值得测试ACE2靶向药物或SARS-CoV靶向药物是否可用于nCoV-2019患者。在此阶段,我们对病毒知之甚少,包括基本生物学,动物来源或任何特定治疗方法。

  参考消息:

  https://www.nature.com/articles/s41586-020-2012-7

  https://science.sciencemag.org/content/310/5748/676

  https://www.nature.com/articles/s41586-018-0010-9?utm_source=sn&utm_medium=referral&utm_content=null&utm_campaign=BSLB_1_CA01_GL_BSLB_AWA_CA01_GL_LSGR_PubH_Coronovirus_LandingPage

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