【肺癌】临床医生“不做实验”发表纯生信SCI

今天小编为大家简单介绍这篇发表在《Disease Markers》杂志的文章，旨在通过生信分析研究杆状病毒复制子BIRC5在EGFR，KRAS和ALK基因缺失的肺腺癌（LAD）中的预后意义。作者首先从数据库GEO获取基因表达图谱，再用GeneSpring GX方法鉴定DEGs特异表达基因，然后用基因集合富集分析GSEA进行GO分析和通路的富集分析。蛋白相互作用网络是用Cytoscape构建的。LAD和三阴性腺癌的预后价值分别用Kaplan-Meier plotter和Cancer Genome Atlas数据库做验证。最后，用一个共表达的网络和富集分析去预测BIRC5的机制。

肺腺癌的病理组织切片形态：

作者对GSE10072、GSE32863、GSE85841在肿瘤及相邻组织做了DEGs鉴定，其中发现了重叠的上调基因有38个，而重叠的下调基因有121个。

然后作者对DEGs做了富集分析，发现了这些基因参与到了生物过程，也有些基因也参与组成细胞，有些基因发挥出了分子功能作用。

随后，作者还做了PPI网络构建，红点表示上调基因，蓝点表示下调基因。另外，4个不同模块用MCODE获取。

作者又分析了hub基因的mRNA表达量，以肺腺癌LAD和正常组织对比，GIRC5、MCM4、CDC20、KIAA0101和TIRP13这5个基因在三阴性肺腺癌中mRNA具有明显上调表达（相对于非三阴性肺腺癌）。

BIRC5基因与生存期之间的关系，BIRC5 mRNA表达水平高的三阴性肺腺癌病人通常具有较差的预后效果，生存期较短、存活率较低。

BIRC5高表达与BIRC5低表达的三阴性肺腺癌病人的临床一般资料如下：

这是作者用Cytoscape软件构建的共表达网络。

Cytoscape软件的下载地址：

http://cytoscapeweb.cytoscape.org/download

对于三阴性肺腺癌，BIRC5有望可作为预后预测因子和治疗靶点。BIRC5的上调表达可以激活细胞周期信号传导途径参与这种特定类型的LAD发生发展。本文作者的研究结果为三阴性肺腺癌提供了新的见解。然而，癌症是高度复杂的分子机制的结果，并且需要更多的研究来阐明在BIRC5下三阴性肺腺癌的细胞周期相关的信号传导。

总而言之，做一篇研究论文最关键是看文章是否有深度和对人类的实际意义，研究方法关键看是否有创新性。若你的课题担心做得不够深入，你还可以生信数据分析辅助你分析研究结果，例如KEGG、GO、共表达分析、GSEA、转录组分析、蛋白质组分析……这样一篇文章写下来，就非常有趣了，想发表高分SCI就得心应手。还有，更重要一点是因为我们公司有一支专业的生信分析团队为你服务。

肺腺癌小百科

是肺癌的一种，属于非小细胞癌 。不同于 鳞状细胞肺癌 ，肺腺癌较容易发生于女性及不抽烟者。起源于支气管粘膜上皮，少数起源于大支气管的粘液腺。发病率比鳞癌和未分化癌低，发病年龄较小，女性相对多见。多数腺癌起源于较小的支气管，为周围型肺癌。早期一般没有明显的临床症状，往往在胸部 X 线检查时被发现。表现为圆形或椭圆形肿块，一般生长较慢，但有时早期即发生血行转移。淋巴转移则发生较晚。

临床表现

肺癌在早期并没有什么特殊症状，仅为一般 呼吸系统疾病 所共有的症状，如 咳嗽 、 痰血 、低热、胸痛、气闷等，很容易忽略。由于肺癌细胞可产生某些特殊的内分泌激素（异源性激素）、抗原和酶，这些物质运转作用于骨关节部位，而致骨关节肿胀疼痛，常累及 胫、腓、尺、桡等骨及关节，指趾末端往往膨大呈杵状指， x 线摄片检查可见骨膜增生。肩背痛：肺外围型肺癌常向后上发展，侵蚀胸膜， 累及肋骨和胸壁组织，从而引起肩背痛。这类患者很少有呼吸道症状。声音嘶哑：肺癌转移灶压迫 喉 神经，可使声带单板机痹而致声音嘶哑。由于肺癌的转移灶在早期即可出现，并县城转移灶有时可长得比原发灶快，因此转移灶的临床表现可先于原发灶出现。

肺癌晚期症状会因病人体质不一样而有一定的差别，肺癌晚期时病情比较严重，需要及时对症治疗。疼痛是肺癌晚期患者经常表现出来的症状，大多数已发生胸内区域性播散的肺癌患者均有胸痛的症状。声音嘶哑是肺癌晚期症状之一。控制左侧发音功能的 喉 返神经由颈部下行至 胸 部，绕过心脏的大血管返行向上至喉，从而支配发音器官的左侧。因此，若肿瘤侵及 纵隔 左侧，使喉返神 经受到压迫，声嘶便产生了，但却无咽痛及上呼吸道感染的其它症状。面、颈部水肿也是肺癌晚期症状中比较常见的，若肿瘤侵及 纵隔 右侧压迫上腔 静脉 ，最初会使 颈 静脉 因回流不畅而怒张，最后还会导致面、颈部水肿，这需要得以及时诊断和处理。气促、胸腔积液也是肺癌晚期症状中的表现。

参考文献:

Puri, Akshjot et al. “Synchronous primary adenocarcinoma of the lung and pancreas: a case series and review of the literature.” Lung cancer management vol. 6,1 (2017): 17-23.

Cao Y, Zhu W, Chen W, Wu J, Hou G, Li Y. Prognostic Value of BIRC5 in Lung Adenocarcinoma Lacking EGFR, KRAS, and ALK Mutations by Integrated Bioinformatics Analysis. Dis Markers. 2019 Apr 9;2019:5451290.

END