消毒对水产养殖的病害发生主要起预防作用，选择合适的消毒时机、合适的消毒产品以及合理控制用量非常重要。
1. 氯制剂
种类多，通过在水中形成的次氯酸的氧化作用而达到杀菌的效果。该类消毒剂易受环境因子影响，药效一般随着水温、pH 值的升高而加强。当水体有机物过多时，药效显著下降；另一方面，氯制剂对水产动物刺激性也大。
二氯海因。其活性氯含量高，气味较轻，作用温和，杀菌所需浓度较高，作用时间长，有效氯释放缓慢，一般施用浓度为 0.2 ～ 0.3 m g/L，实际使用较少。
三氯异氰脲酸。为白色晶体，具有强烈的氯气刺激味，是一种极强的氧化剂，具有高效、广谱、较为安全的消毒作用，不但能杀灭细菌、病毒、真菌、芽孢，对球虫卵囊也有一定杀灭作用，一般施用浓度为 0.1 ～ 0.3 m g/L，较为常用。
2. 溴制剂
该产品在水体中形成次溴酸，破坏病原菌膜结构，使卤素结合蛋白质分子，从而杀菌。广谱杀菌制剂，效果持久，不易挥发，对金属腐蚀性小，易分解，对环境污染小。
二溴海因。白色或淡黄色，为纯溴制剂，具有广谱抗菌能力，杀菌力强，稳定性好，无毒低味，安全环保，不受 pH 等环境因子影响，使用浓度一般为0.2 ～ 0.3 m g/L。
新洁尔灭（苯扎溴铵）。性质稳定，刺激性小，杀菌能力较强，对水体污染较小，一般施用浓度为0.5 ～1 m g/L。
3. 碘制剂
主要为季铵盐络合碘的形式。碘能氧化病原体胞浆蛋白的活性基团，并与蛋白质结合，使巯基化合物、肽、蛋白质、酶、脂质等氧化或碘化，从而达到杀菌效果。碘消毒剂为广谱消毒剂，能杀灭大部分细菌、真菌和病毒。
双季铵盐类。是一类阳离子表面活性剂，能吸附于菌体表面，其疏水基能渗入细胞的类脂层，改变细胞壁和细胞膜的通透性，使胞内酶和蛋白质变性，达到杀菌的效果，一般施用浓度为 0.1～ 0.3 m g/L。
作为新一代的生态型灭菌、消毒、保鲜剂，诺福消毒产品以其独有的生产技术，基于“活性胶质银离子”以及“食品级过氧化氢”，成为领先全球的产品。
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