福建的海岸线长达3752千米，居全国第二，拥有大小港湾125个，其中深水港湾22处，可建5万吨级以上深水泊位的天然良港有——东山湾、厦门湾、湄洲湾、兴化湾、罗源湾、三沙湾、沙埕港7个，这些港湾共同组成了福建五大港口。
福建第一个港口是宁德港，位于福建省东北部，分为三都澳港区、赛江港区、三沙港区、沙埕港区等四个港区，16个作业区，其中沙埕和三都澳可供建10至50万吨级泊位，符合世界航运船舶大型化、航道深水化的趋势。在我国18000多公里的海岸线上很难再找到这样一个深水港湾，在全世界都不多见。
福建第二个港口是莆田港，管辖范围包括湄洲岛北部水域及其相关海岸线，分为秀屿港区、东吴港区、三江口港区、枫亭港区四个大港区，还有涵江港、文甲港、宫下港、江口港、南日港、石城港、东潘港、前海港、后海港九个小港区。
福建第三个港口是福州港，是中国沿海20个主枢纽港之一，由河口港与海港组成，主要港区分布在闽江口河口段，如台江港区、马尾港区、青州港区、松门港区、筹东港区、琯头港区。目前，福州港共有万吨级以上泊位40个，其中5万吨级以上泊位14个，最大靠泊位能力为32万吨。
福建第四个港口是泉州港，距今已有1300多年历史，是世界千年航海史上独占400年鳌头的“世界第一大港”、与埃及亚历山大港齐名，联合国唯一认定的“海上丝 绸之路起点”，名气遍布全球。目前，泉州港拥有肖厝、斗尾、后渚、内港、东石、石井、崇武七大港区，生产性码头泊位92个，其中万吨级以上深水泊位25个（包括30万吨级2个、10万吨级4个、5万吨级8个、万吨级11个）。
福建第五个港口是厦门港，是我国东南海疆之要津、入闽之门户。2010年8月31日，厦门港吞并整个漳州港，使之如今拥有东渡、海沧、翔安、招银、后石、石码、古雷、东山、云霄、诏安10个港区。2013年，厦门、漳州港口一体化整合完成，厦门港进入新阶段。2017年，厦门港全年吞吐量为1038万标箱，居世界第14位，俨然一个世界级强港。
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