在临床进行的一项关于HIV突变的生物信息检测可以帮助指导选择抗逆转录病毒疗法。
通过结构建模和计算分析,A*STAR研究人员已经展示了HIV基因组的变化是如何使病毒对一种抗逆转录病毒药物产生耐药性的,它通常能更广泛地诱导同一类其他药物产生耐药性。研究结果表明,一些被称为蛋白酶抑制剂的药物,因为它们阻止关键的病毒蛋白酶,应该在其他类药物之前被规定使用。
抗体与产品开发小组领导Samuel Ken-En Gan(后排,左边第二)博士后研究员 Chinh Tran-To Su(后排,右二)是这项研究的第一作者。
该研究的高级作者、来自A*STAR生物信息学研究所的Samuel kenen - en Gan说,这样的策略可以帮助“延缓药物耐药性的发生,从而延长药物的效力,提高生活质量,降低治疗成本。”
Gan和他的团队对20多个突变蛋白酶的结构进行了建模,临床医生发现这些蛋白酶对七种不同的蛋白酶阻断药物中的任何一种都有抗药性。这些突变发生在只服用其中一种药物的患者身上,但他们也影响了其他蛋白酶抑制剂的疗效。一个A*STAR的研究小组表明,交叉抗性可以很容易地跨越七种蛋白酶抑制剂中的五种,但对另外两种抑制剂则比较少。
Gan实验室的博士后研究员Chinh Tran-To Su说,这类信息可以帮助初治和后续治疗的患者指导选择药物。
以蛋白酶抑制剂lopinavir(洛匹那韦)为例。分析发现,对任何其他蛋白酶抑制剂发生耐药也可能导致对lopinavir产生耐药性。这意味着,如果病人服用其他药物后,它就不那么有用了。然而,由于对lopinavir的抗性似乎并不影响其他六种蛋白酶抑制剂的作用,Gan和Su得出结论,lopinavir应该被认为是患者首选药物的第一个蛋白酶抑制剂。
如果lopinavir发生了耐药,分析表明患者应该尝试另一种易于交叉耐药性的蛋白酶抑制剂之一,同时留备最不受交叉耐药性影响的两种抑制剂作为最后手段的药物。
这些建议的临床实践将需要用计算模型来预测。但正如Gan指出的那样,从他的团队的结构分析中得到的见解将很难通过其他方式来实现。“这篇论文,”他说,“代表了一项具有里程碑意义的分析,利用生物信息学去实验室里实验,得到临床试验无法轻易发现的问题。”
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原文出自 : medicalxpress
译文作者:Eric 云飞
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