先秦时代，与现在人不同，姓氏分开。所以古人有姓也有氏，而孔子的孔只是氏，那孔子姓什么呢？
孔子姓子！
但是要注意，并不是因为他姓子，所以叫孔子……孔子的子，是对男子的尊称。
孔子是宋国公室的后代，而宋国是殷商的延续。武王灭商后，封纣王的儿子武庚于殷商故地，但是武王死后，武庚勾结周武王的两个儿子管叔、蔡叔造反，被周公灭掉，杀了武庚。但汤不能无后，因此又封纣王的哥哥微子于宋，这就是宋国的来历。
商朝王室的姓是“子”，据说商人的始祖简狄在洗澡时，吞了一个玄鸟的蛋，因而怀孕，生下了契。鸟蛋也就是“子”，故此以子为姓，这也就是所谓的“天命玄鸟，降而生商”。因为商人姓子，所以商人的后代宋国公族也就姓子。
宋国到春秋时期，有个君主宋穆公，临死前把君位传给了侄子与夷，并委托司马孔父嘉辅佐。与夷即位后，就是宋殇公。孔父嘉的妻子很漂亮，有一次走在路上，被太宰华督看见了，华督赞叹说“美而艳”，于是发动了政变，杀死了孔父嘉，顺便也杀了宋殇公，另立了宋庄公。
孔父嘉是什么人呢？他是宋国第五代君主宋湣公的后代，所以他也姓子。孔父嘉被杀后，他的儿子逃亡到了鲁国，就在那里繁衍了下来，孔父嘉，字孔父，名嘉。他的后代就以他的字为氏，就是孔氏。所以孔子氏孔，姓子，名丘，字仲尼。先秦时，男子称氏不称姓，女子称姓不称氏，所以孔丘就只能叫孔丘。
不过到后来姓氏合流，孔也就变成了今天的姓了。
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